Днк-археология, Палео-днк, Исследования древней ДНК (дДНК) Опции

[Залесец]

Genomic Steppe ancestry in skeletons from the Neolithic Single Grave Culture in Denmark (https://journals.plos.org/plosone/article?i...al.pone.0244872).

Это Культура одиночных погребений (КИО шуровой керамики и боевых топоров).

Нашли 9 человек (Supporting information > S4 Table):
R1b (R1b-M343),
R1b1 (R1b-L754/L761),
R1b1a (R1b-L389),
R1b1a1 (R1b-P297),
R1b1a2 (R1b-V1636),
R1b1a2a (R1b-V1274 (< V1636)),
R1b1a2b (R1b-Y83069/Y106006 (< V1636)),
R1b1b1 (R1b-M18 (< V88)),
R1b1b2 (R1b-Y7777 (< V88)).

К предкам колоколовидников или ямников (Rb-L23) могут относиться лишь 4 первых недотипированных образца, а остальные 5 человек – это боковые линии от магистральной линии R1b-L23.

Немного удивляют находки 2 носителей R1b-V88 здесь на севере Европы, так как ранее их находили или в Италии, или конкретно на Сардинии (http://www.balto-slavica.org/forum/index.p...77&p=322817). Так же удивляет, что не нашли ни носителей I2a1, ни носителей I2a2, ни носителей G2a.

[Igor1961]

Спасибо за ссылку! Мы видим очередной пример, что "шнуровиков" было много, хороших и разных. Археологи, похоже, свалили в одну кучу самые разные народы, каждый со своей историей. Тот, что жил на территории Дании 4400 лет назад, похоже, не оставил там прямых потомков по мужской линии.

Субклад R1b-V88 очень древний, так что его находка далеко от Сардинии не должна вызывать особого удивления. Безвременно ушедший блогер с ником Genetiker уже находит V88 а неолите Германии (культура Баальберге), но его интерпретации БАМ-файлов нередко грешили натяжками, так что результат не считается надежным. Опубликованные датчанами данные тоже надо перепроверять, впрочем.

Отсутствие G2a как раз удивлять не должно - они до этих краев не доходили, по всей видимости. Почему нет I2, действительно, странно. Но на такой выборке может быть что угодно.

[Igor1961]

Небольшая поправка в стиле старого анекдота, что заканчивается словами «и не выиграл, а проиграл». При внимательном чтении статьи выясняется, что в Table S4 даётся не список из 9 образцов, а результаты анализа ЕДИНСТВЕННОГО образца, у которого удалось получать сколько-нибудь приемлемое покрытие.

Он из ныне очень редкого субклада R1b-V1636, что мало о чем говорит в силу единичности находки. Все остальные гаплогруппы не нашли, потому что не искали. Извиняюсь, что не сразу обратил на это внимание.

[Залесец]

Небольшая поправка в стиле старого анекдота, что заканчивается словами «и не выиграл, а проиграл». При внимательном чтении статьи выясняется, что в Table S4 даётся не список из 9 образцов, а результаты анализа ЕДИНСТВЕННОГО образца, у которого удалось получать сколько-нибудь приемлемое покрытие.

Он из ныне очень редкого субклада R1b-V1636, что мало о чем говорит в силу единичности находки. Все остальные гаплогруппы не нашли, потому что не искали. Извиняюсь, что не сразу обратил на это внимание.

Вот таблица ((https://journals.plos.org/plosone/article?i...al.pone.0244872): Supporting information > S4 Table):



То есть получается, что это последовательное определение субклада одного образца через наличие или отсутствие тех или иных снипов M343+ > L754/L761+ > L389+ > P297- > V1636+ > V1274- > Y83069/Y106006- > M18- > Y7777-, если я теперь правильно понял?

ISoGG (https://docs.google.com/spreadsheets/d/1JvX...#gid=1078904281):



YFull (https://www.yfull.com/tree/R1b/).

Но тогда получается, что это субклад V1636* ((https://www.yfull.com/tree/R-V1636/) субклад, у которого пока не нашли современных потомков (нисходящие субклады)) или я опять неправильно понимаю?

[Залесец]

A genetic history of the pre-contact Caribbean (https://www.nature.com/articles/s41586-020-03053-2).


Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia (https://advances.sciencemag.org/content/7/2...IOibReYszmwTz8w).


Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France (https://www.cell.com/current-biology/fullte...9822(20)31835-2).

[Igor1961]

Но тогда получается, что это субклад V1636* ((https://www.yfull.com/tree/R-V1636/) субклад, у которого пока не нашли современных потомков (нисходящие субклады)) или я опять неправильно понимаю?

Все поняли правильно. От субклада, следы которого пока нашли в ископаемой ДНК на Кавказе, осталось так мало потомков, что наткнуться на след какой-либо из современных ветвей было бы редким везением. Повторю еще раз, что по одному образцу очень сложно сделать выводы о людях, что жили на территории Ютландии в то время. Авторы и сами это понимают, а потому статья пошла не в рейтинговый журнал типа Science или Nature, а в "братскую могилу" PlosONE.

[Igor1961]

A genetic history of the pre-contact Caribbean (https://www.nature.com/articles/s41586-020-03053-2).


Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia (https://advances.sciencemag.org/content/7/2...IOibReYszmwTz8w).


Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France (https://www.cell.com/current-biology/fullte...9822(20)31835-2).

Спасибо! Со статьей по Карибам знаком. Возможно, она представляет интерес для узких специалистов по истории этого региона, но в целом ее материалы мало что дают для общей публики. Никаких сенсационных данных там нет - все образцы из гаплогруппы Q, более глубокое отнесение зависит в основном от покрытия. Примерно то же самое, наверное, можно сказать про статью о Сибири. Там образцы поступили из тех же археологических сайтов, что уже проходили в других публикациях, а потому новизны почти нет. Вдобавок, в сопроводительном файле по непонятной причине нет таблиц с данными, хотя ссылки на них имеются.

У французов с этим получше, но все таблицы разрозненные, надо самому собирать воедино. Появится время, займусь и добавлю новые точки на карты ископаемый ДНК из Западной Европы и из гаплогруппы I2.

[Залесец]

Вышла ещё одна статья о Фатьяновской культуре:
Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain (https://advances.sciencemag.org/content/7/4/eabd6535).

Появились некоторые изменения в сравнении с более ранней статьёй (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.02.184507v1). В ранней статье было 16 мужчин, из которых 14 фатьяновцы ((https://www.biorxiv.org/content/10.1101/202...entary-material): Supplementary Data 2), а в новой статье стало 19 мужчин, из которых 17 фатьяновцы ((https://advances.sciencemag.org/content/sup....4.eabd6535.DC1): Table S1). Но качественных изменений нет, по-прежнему лишь у одного носителя R1a-Z645 предполагают субклад Z283.

[Igor1961]

Второй вопрос - это недостаточно глубокое отнесение для образцов, имеющих покрытие более 2х. Но это дело поправимое, потому что опубликованы БАМ-файлы. Надеюсь, в скором будущем специалисты скажут свое слово. Может быть, наконец-то удастся поймать Неуловимого Джо R1b-U106?

Не так давно работа была проделана, и образцы с приемлемым покрытием появились на YFull https://www.yfull.com/live/tree/R-L51/
Вот выжимка по их данным



Джо опять ускользнул, а линия тех польских "шнуровиков", похоже, терминировалась, как можно судить по их месту на YTree.

[Brevis]

Genome-wide analysis of nearly all the victims of a 6200 year old massacre https://journals.plos.org/plosone/article?i...al.pone.0247332

[Рекуай]

R1а YP4141- YP4132 formed 12200 ybp, TMRCA 5300 ybp
id:I4773KAZ [KZ-VOS]age

5300 лет назад это времена ямников, что известно про эту находку?

[Igor1961]

5300 лет назад это времена ямников, что известно про эту находку?

Опять Вас понесло в нумерологию. В таком случае предлагаю дать свою трактовку такому событию - в один и тот же день, 27 октября 1900 года, в Области Кубанского казачьего войска родился мой дедушка, Н.С. Рожанский, а в Саратовской губернии - будущая певица Л.А. Русланова (урожденная Лейкина). Если сможете связать эти два события, то давайте поговорим и о Ямной культуре в контексте находки из субклада R1a-YP4141.

Что касается самого образца, то вот его данные с карты https://www.google.com/maps/d/edit?mid=1BmR...amp;usp=sharing

I4773
Skeletal code: KZ-AKT-002, Object 7, burial enclosure 2, Grave 2
Y chromosome haplogroup: R1a-YP4141>YP4132
mtDNA haplogroup: U5a1a2a
Coverage: 5.029
Date: 1618-1513 calBCE (3290±20 BP, PSUAMS-2607)
Culture / Split Label: Aktogai Middle / Late Bronze Age
Location: Aktogai, Kazakhstan
Latitude, Longitude 46.9658667, 80.0347333

[Рекуай]

Спасибо.

27 октября 1900 года,

В России той поры рождалось миллионов 7 ежегодно, так что на эту дату можно найти ещё тысяч 20 новорожденных.

Опять Вас понесло в нумерологию.

Странное у Вас отношение к периодизации истории.

На момент распада R1a YP4141 YP4132 5300 лет назад На северо-западе Казахстана процветали ямники, 5500-4500 лет назад их сменили катакомбники и полтавкинцы. 4500-3700 лет назад.

В предгорьях Копетдага 4500-3700 лет назад обитали БМАК, северо-восточный форпост Ближневосточного мира.

3700-3200 лет назад была экспансия ариев, Z93 предков индоиранцев.

И тут поперёк поля в Восточном Казахстане обнаруживается явный выходец с Ближнего Востока, так как остальные его живые ветви именно там и обитают. Если, конечно, не считать YP4131 950 лет назад попавшего в Британию.

[Brevis]

Ancestry and identity in Bronze Age Catacomb culture burials: A meta-tale of graves, skeletons, and DNA
https://www.sciencedirect.com/science/artic...dnfQluwhtwveUwk

[Brevis]

Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians
https://advances.sciencemag.org/content/7/13/eabe4414

[L-man]

Ancient genomic time-transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians
Аннотация
В первом тысячелетии до н.э. в евразийской степи обитало множество кочевых культур конных воинов - скифов. Из-за отсутствия письменных источников из первых рук, мало что известно о происхождении и взаимоотношениях между различными культурами. Для решения этих вопросов мы подготовили данные по геному 111 древних особей, извлеченных из 39 археологических памятников от первого тысячелетия до нашей эры до первого тысячелетия нашей эры степей Центральной Азии. Мы обнаружили крупные смешивания в позднем бронзовом веке, формирующие генетический субстрат для двух основных генофондов железного века, формировавшихся вокруг Алтая и Урала соответственно. Их исчезновение было отражено новыми генетическими трансформациями, связанными с распространением восточных империй кочевников в первые века нашей эры. По сравнению с высокой генетической неоднородностью прошлого, примечательна гомогенизация генофонда современных казахов, вероятно в результате 400 лет строгих экзогамных социальных правил
Ссылка на работу: https://advances.sciencemag.org/content/7/13/eabe4414

[L-man]

Судя по всему уважаемый И. Рожанский остыл к генетике, былого интузиазма и активности не наблюдается. Что так?