Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



10 страниц V  < 1 2 3 4 5 > »   
Ответить в данную темуНачать новую тему
> J2 На Украине
Люда
сообщение 5.11.2012, 20:17
Сообщение #41


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Цитата
Daniel VAN ZOMEREN 1818 Nieuweschans, Netherlands

Это оказался тест Питера Ньюкомба. Он начинал много лет назад с 8 маркерного теста Oxford Ancestors, потом 37 маркерного в SMGF, потом уже 67 Y в FT.
По присланной Альфредом Абурто базе данных L243+ гаплотипов, подтвержденных на этот снип и предполагаемых, собранных им из разных баз, построила Древо по 25 STR маркерам. Индийский кластер опять рассчитан близко к нам. Появился еще более близкий к 171488 гаплотип Ysearch KSD83 (без имени и происхождения). Раньше он на письма не отвечал, сейчас мы с Абурто написали еще раз.
Еврейский кластер разрастается.
Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  Tree_25Y_38hapl._.pdf ( 12.12 килобайт ) Кол-во скачиваний: 178
 


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 6.11.2012, 18:36
Сообщение #42


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Люда @ 2.11.2012, 17:52) *
Все-таки мне остается непонятным, сейчас разница в наших схемах в основном касается индийского кластера. Комп.программы вписывают его внутрь, а у Вас, Игорь Львович, он самый древний. Непонятно, почему получается время, разделяющее гаплотипы, по Вашему методу в 2 раза больше, чем рассчитывает Y-утилита. Используется разная скорость мутирования? И как получить ту L243.htm таблицу, что Вы получили?
Свои 37 Y гаплотипы проверила Kitsch. Не особенно изменилось. Прилагаю - слева Fitch, справа Kitsch. Индийцы все внутри. Модальный перешел в еврейский кластер (?)
У Абурто предположения, что весь кластер L243 как-то связан с еврейской родословной.
Новые гаплотипы пока не было времени проверить.

Дистанционную матрицу я рассчитываю тоже через Y Utility, но используя несколько другой алгоритм.
Во-первых, в управляющей панели Generate Tables отключаю почти все все кнопки, оставляя активными Genetic Distance и Hybrid mutation model, в General Setup - только Show Legends, в ID Column фиксирую колонку данных, а 1st Data Column назначаю Automatic. То есть, расчет идет без составления модального гаплотипа, который в этой схеме играет роль пятого колеса в телеге.

Далее, получается матрица, в диагональных элементах которой находятся минусы, а в остальных - мутационная разница между соответствующими гаплотипами. Поскольку в исходных условиях задана гибридная мода, разность, например, в 2 мутации в том или ином маркере считается как 2, а не 1, как в Infinite Allele Mutation Model, которая используется для расчета TMRCA и генерирования таблицы для PHYLIP. В случае сложных систем гибридная мода дает более лучшее разрешение, поскольку она не страдает тягой к уравнительности, да и лучше согласуется с калибровками скоростей мутаций.

В принципе, такую матрицу уже можно использовать для построения дерева, если заменить минусы на нули и добавить сверху счетчик рядов. Однако, лучше сделать коррекцию на возвратные мутации по формуле
Y = округл(X*(1+exp(X/N))/2),
где Y - корректированный матричный элемент, Х - исходное значение, полученное в Y Utility, N - число маркеров в гаплотипе, а округление делается до ближайшего целого.

"Единица измерения" такого дерева - количество мутаций между гаплотипами. Его можно перевести в условные поколения между гаплотипами, если поделить Y на N и на скорость мутации в данном формате, а затем округлить до целого (PHYLIP не работает с дробными числами!). Если умножить последнюю цифру на 25, мы получим временной интервал между двумя гаплотипами. Именно так и рассчитывалась таблица, на которую ссылался.

Теперь о положении субклада L243 на общем дереве J2a1 (L24). На рисунке ниже - фрагмент общего дерева, где находятся 67-маркерные гаплотипы с проекта J-L24.

Прикрепленное изображение


Расчет делался с оптимизацией Neighbour Joining. Поскольку субклад довольно старый (как мы уже знаем), на общем дереве он оказался несколько разорванным. Еврейский кластер (оранжевый), родительская ветвь (красный) и отдельно стоящая пара Jennings-Lee (розовый) оказались разделены гаплотипами из родительской ветви J2a1h2 (L25), у которых L243 был отрицательным или не определялся. Кроме того, алгоритм поместил в ближайшие соседи молодую (800±150 лет) ветвь из Саудовской Аравии, которую пока не анализировали на снипы, нисходящие к J2. Видимо, имеет смысл кому-либо из этой арабской ветви сделать глубокое типирование на предмет более аккуратного отнесения.

Во всем остальном никаких особых сюрпризов не наблюдается. Честно говоря, не понял, что имеется в виду под еврейской родословной всего субклада L243. О каких евреях, арабах и многих других народах Ближнего Востока можно говорить во времена 6300 лет назад или даже раньше?


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 6.11.2012, 20:07
Сообщение #43


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Игорь Львович, спасибо большое за пояснения к составлению матрицы, может быть попробую. Относительно той части Древа J2, на которой мы находимся, не очень согласуется со снипами. Розовая ветка тоже L243+, тогда и вверх - Ireland, Saudi Arabi тоже были бы L243+, а они L243-.
177722 и 171488 L590+, тогда и N62982 и 123280 были бы L590+, а они L590-.
Все-таки может быть индийским гаплотипам (85998) следует провериться на L590, все-таки их "прибивает" к нам? Или Вы считаете, что выбивающаяся длина их линии говорит о раннем отделении от общего ствола? Зеленую ветку Вы рекомендуете проверить на L243?
А М6909 это кто такой?
Члены нашей группы активно включились в обсуждение своего происхождения. У каждого свои гипотезы.
P.S. Все, вижу M6909. Он не классифицирован еще был. Здорово! Надо его искать.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 6.11.2012, 22:24
Сообщение #44


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



M6909 по обычным программам Fitch-Kitsch не получается самым близким, по Fitch вообще "улетел".
Основные кластеры сохраняются, но вариаций много.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 7.11.2012, 7:04
Сообщение #45


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Alfred Aburto ответил:
"The cluster in green in Y-STR tree is cluster "0217 L24+, L25+, Najd" in our project results page: https://gap.familytreedna.com/ydna-results-classic.aspx ... Najd is the plateau region of Saudi Arabia ... most member of this cluster seemed to come from the Najd (or Nejd) region of Saudi Arabia so I call the cluster "Najd" ... Kit 156722 (Majed), a Najd cluster member, has done a Walk Through the Y (WTY) test searching for SNPs in his Y-chromosome but unfortunately no new SNPs were found. Kit 156722 is L24+, L25+, L243-, and L192.2- ... He did not belong to any of the known subclades of L25.
I was unsure of M6909. He is a member of the J-L24-Y-DNA Project and I placed him in the "0200 L24+, L25+, alpha" cluster."
По рассчетам Абурто, которые прикрепляю здесь, M6909 далековато от нас, но он переместил его в наш кластер и будет просить тестироваться на L243.
Уважаемый Игорь Львович, Alfred Aburto хочет поместить Древо по 37 Y L243+ на своей стр. в FT. Вас можно пригласить в соавторы?


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 7.11.2012, 11:04
Сообщение #46


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Уважаемая Людмила! Спасибо за сведения о молодой ветви из Саудовской Аравии. На гаплогруппном проекте этих данных нет. Значит, эти арабы попадают в родительскую ветвь L25, что вполне закономерно. Поскольку субклад L243 начал расходиться всего на несколько столетий позже возникновения родительского L25, их ветви неизбежно оказываются перемешанными на общем STR древе. В принципе, все гаплотипы, тестированные как L25+, можно рассматривать как единое целое, поскольку этот субклад имеет топологию еловой шишки, без больших разрывов в ветвлении. Снипы отмечают некоторые "чешуйки", не выбивающиеся особенно из общего облака гаплотипов.
Цитата(Люда @ 7.11.2012, 13:04) *
По рассчетам Абурто, которые прикрепляю здесь, M6909 далековато от нас, но он переместил его в наш кластер и будет просить тестироваться на L243.
Уважаемый Игорь Львович, Alfred Aburto хочет поместить Древо по 37 Y L243+ на своей стр. в FT. Вас можно пригласить в соавторы?

А где само дерево? В прикрепленном файле только сопроводительный текст, из которого ясно, что в расчете использовались чандлеровские скорости и алгоритм из Y Utility. Это не лучший метод, так что я бы предпочел получить исходный список гаплотипов для более аккуратного расчета.

P.S. Кстати, Alfred в курсе, из какого племени те 8 арабов, что вклинились в вашу ветвь? На специализированном проекте почему-то нет ни одного из них.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 7.11.2012, 12:22
Сообщение #47


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Цитата
из какого племени те 8 арабов, что вклинились в вашу ветвь?

Абурто : "most member of this cluster seemed to come from the Najd (or Nejd) region of Saudi Arabia so I call the cluster "Najd"
Цитата
А где само дерево?

Дерево- то, что у меня получилось по 25 маркерам (сообщение 41) по его базе данных (я ее Вам перешлю). Здесь прикреплю то, что я из нее взяла.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 8.11.2012, 2:27
Сообщение #48


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Уважаемая Людмила! Спасибо за данные. Вот как расположились 37-маркерные гаплотипы на дереве, что даю здесь в круговом представлении:

Прикрепленное изображение


Разными цветами отмечены далеко расходящиеся подветви, что на проекте обозначены греческими буквами.

Далеко справа располагаются 4 гаплотипа из Индии, что отмечены оранжевым цветом, они же кластер α на проекте. Их общий предок жил 850±300 лет назад. Базовый гаплотип:

12 23 14 10 16 17 11 15 12 13 11 28 16 8 9 10 11 18 15 22 31 12 13 15 17 11 11 19 23 15 14 15 20 36 41 14 9 11 7 14 15 8 11 10 8 10 9 12 17 17 14 10 12 12 16 9 13 25 20 13 12 11 14 11 12 12 13

Маркеры 4-й панели здесь взяты с единственного в этой группе 67-маркерного гаплотипа FK85998, так что пока что его лучше назвать условно базовым.

Далее при движении против часовой стрелки располагаются 2 родственных гаплотипа и один одиночный (Ваш муж). Они пока ни с кем не группируются, и на проекте в единственном числе представляют кластеры γ и δ.

Затем в верхней части дерева синим цветом выделены 5 гаплотипов с характерной меткой DYS388=14. На проекте это кластер β. Из них 3 - близкие родственники, а потому расчет базового гаплотипа и времени до предка делался не по всей пятерке, а по 3-м далеко отстоящим гаплотипам: FK123280, FKN62982 и FK93278. Это дало 2200±500 лет до их общего предка и базовый гаплотип

12 25 14 10 16 16 11 14 12 13 11 30 15 8 8 11 11 26 16 19 29 15 15 16 16 10 11 18 23 16 13 17 19 36 37 13 9 11 7 14 15 8 10 10 8 10 9 12 17 17 14 10 12 12 17 9 11 23 21 13 12 11 14 11 12 12 12

Далее, на 11 часов, розовым обозначены 4 гаплотипа, записанные как кластер ε. Все они - близкие родственники с недавним общим предком, жившим 275±150 лет назад. Базовый гаплотип:

12 23 15 10 15 16 11 15 12 13 11 29 17 8 10 11 11 26 15 20 31 13 13 15 17 10 11 19 23 17 14 17 15 36 39 12 9 11 7 14 15 8 11 10 8 10 9 12 17 17 14 10 12 12 14 9 12 23 20 16 12 11 14 11 11 12 12

Наконец, вся остальная часть дерева занята ашкеназийской ветвью, что закрашена фисташковым цветом, а на проекте записана как кластер ζ. Ее предок жил 1100±200 лет назад. Базовый гаплотип

12 24 16 11 14 18 11 16 13 13 11 29 16 9 9 11 11 26 15 21 30 12 13 16 16 10 10 23 23 16 14 17 18 37 38 12 9 11 7 14 15 8 11 10 8 11 9 12 17 18 12 10 12 12 15 9 12 22 22 15 12 11 14 10 12 12 13

Дерево на схеме не укоренено, и положение корня на нем совсем не очевидно. Каждый из кластеров фактически растет сам по себе. Так что, наверное, имеет смысл заказать снип L590 для индийцев. Это даст дополнительную информацию о возможном положении корня. Пока же время образования всего субклада можно оценить из дистанционной матрицы, составленной по базовым гаплотипам 4-х кластеров, с поправкой на их собственный "возраст", recLOH в YCAII у евреев и очевидную многошаговую мутацию в DYS447 у индийцев. Она выглядит так:

α -
β 7775 -
ε 6025 6500 -
ζ 8550 8100 5750 -

Усреднение по 9-ти датировкам дает 7100±1200 лет назад. Это время жизни предка можно принять как предварительную оценку. Хорошо видно, что субклад этот очень древний, как уже отмечал при рассмотрении 67-маркерного дерева. Пути разных его подветвей разошлись еще во времена неолита.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 8.11.2012, 10:17
Сообщение #49


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Уважаемый Игорь Львович, большое спасибо за Ваш труд. Ссылку на наш форум я дала Альфреду Абурто и членам нашего клана. Мне кажется особенно ценным рассчет времени жизни родоначальников ветвей. Деление на эти подветви соответствует и моим построениям, за исключением розовой ветви (у меня синяя и розовая ветви стоят наоборот). Индийцы, вот и у Вас на Древе, самые близкие к нам. Надо просить их тестироваться на L590. Мой муж не одиночный, но YSKSD83 никак не можем найти. На всем Древе пока только 1 дополнительный к L243 снип - L590, который объединяет нас c FK177722 (у него еще L589+ пока приватный).


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 15.11.2012, 10:49
Сообщение #50


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Игорь Львович!
Ваш расчет правильный - M6909 L243+, Aburto сегодня сообщил, первый из Arab Tribes.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 15.11.2012, 12:40
Сообщение #51


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Люда @ 15.11.2012, 16:49) *
Игорь Львович!
Ваш расчет правильный - M6909 L243+, Aburto сегодня сообщил, первый из Arab Tribes.

Вообще-то моей заслуги тут нет, я этот гаплотип не считал. То, что он принадлежит арабу, можно догадаться по номеру кита, начинающемуся на М. Это отметка арабских проектов.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 15.11.2012, 12:48
Сообщение #52


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Igor1961
Цитата
Вообще-то моей заслуги тут нет, я этот гаплотип не считал.

Как же? Это на Вашей диаграмме в сообщении№42 он в нашем (красном) кластере. До сегодняшнего дня не было известно, что он L243+. Теперь хорошо бы проверить на L590.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 15.11.2012, 13:29
Сообщение #53


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Люда @ 15.11.2012, 18:48) *
Igor1961
Цитата
Вообще-то моей заслуги тут нет, я этот гаплотип не считал.

Как же? Это на Вашей диаграмме в сообщении№42 он в нашем (красном) кластере. До сегодняшнего дня не было известно, что он L243+. Теперь хорошо бы проверить на L590.

Действительно, считал. Просто на том дереве сидит 619 гаплотипов, вот и не упомнил безымянного араба. blink.gif


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 16.11.2012, 21:09
Сообщение #54


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



У нас такие новости - индиец 85998 за эти дни тестирован на L590. Он - минус. Значит, все-таки не с одной ветви.
Добавился 254981, Абурто предположил, что из еврейского кластера. Программа также помещает его туда.
Араб М6909 (уже писала об этом) действительно оказался L243+. Теперь пытаемся определить его место на нашем Древе. Есть ли смысл тестировать его на L590? Кажется он не так близок к нам. Хотя на части общего Древа J2, он оказывался рядом.
Игорь Львович, где, по-Вашему, его место на круглом Древе, нарисованном Вами?


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 17.11.2012, 9:44
Сообщение #55


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Да, 254981 четко садится в еврейский кластер. А вот араб M6909 как-то располагается сам по себе, между Вами и испанцем N62982. Можно проверить на L590. Наперед, по виду гаплотипа, трудно предсказать, что он даст - плюс или минус.

Кстати, Альфред имеет какую-нибудь информацию, кто такие участники проекта, записанные как L24+, L25+, Mughal-Timurid? Судя по номерам китов, их тестировали довольно давно, еще на заре существования компании. Дело в том, что как по 4-м 67-маркерным, так и по 7-ми 37-маркерным гаплотипам у них получается общий предок, живший 725±200 лет. Этот интервал (от 1085 до 1485 гг) неплохо перекрывается с времемем жизни Тамерлана (1336 - 1405). Каких-либо близких родственников у этой группы узбеков, туркменов и пакистанцев нет ни в YSearch, ни в проектах FTDNA, ни в SMGF.

То есть, случайных людей там нет, их явно отбирали целенаправленно. Кто это делал и на каком основании? Если хотя бы у половины участников есть надежные подтверждения, что они тимуриды, результаты ДНК-теста можно считать серьезным аргументом в пользу того, к какой гаплогруппе относился Тимур.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 17.11.2012, 10:49
Сообщение #56


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Cпасибо, Игорь Львович. Передам Ваше мнение Абурто и задам Ваш вопрос.
Всем членам проекта J2-L24 наш координатор Альфред Абурто разослан ссылку на новую статью, где наш кластер L24 ( по другой номенклатуре - М530)- родом из Ирана.
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%...al.pone.0041252
"Ancient Migratory Events in the Middle East: New Clues from the Y-Chromosome Variation of Modern Iranians".


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 17.11.2012, 11:16
Сообщение #57


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Люда @ 17.11.2012, 16:49) *
Всем членам проекта J2-L24 наш координатор Альфред Абурто разослан ссылку на новую статью, где наш кластер L24 ( по другой номенклатуре - М530)- родом из Ирана.
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%...al.pone.0041252
"Ancient Migratory Events in the Middle East: New Clues from the Y-Chromosome Variation of Modern Iranians".

Даже как-то неприлично рассылать такие статьи, когда у администратора проекта в распоряжении на порядок более информативный исходный материал. Строить подобие дерева по 7-маркерным гаплотипам и считать времена по Животовскому - это то же самое, что выбросить потенциально ценный материал в корзину.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 17.11.2012, 13:56
Сообщение #58


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Но Деревья здесь и не строят. 7 Dys(ов), конечно, мало. Но здесь используют и снипы. База FT коммерческая, а в статье собраны гаплотипы в "полевых" условиях. Большинство этих людей никогда не стало бы платить за тест. По статье получается, что большинство М530 - персы и зарострийцы - коренное население Ирана. По базе данных Абурто это вряд ли бы получилось.


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 17.11.2012, 15:48
Сообщение #59


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6880
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Люда @ 17.11.2012, 19:56) *
Но Деревья здесь и не строят. 7 Dys(ов), конечно, мало. Но здесь используют и снипы. База FT коммерческая, а в статье собраны гаплотипы в "полевых" условиях. Большинство этих людей никогда не стало бы платить за тест. По статье получается, что большинство М530 - персы и зарострийцы - коренное население Ирана. По базе данных Абурто это вряд ли бы получилось.

То, что выборка полевая и охватывающая популяции, неизвестные в коммерческих базах данных, - это едва ли единственное достоинство этой работы. К слову, авторы в экспериментальной части пишут про 900 с лишним 10-маркерных гаплотипов, а в сопроводительном материале дали только малую их толику, выкинув задно маркеры, что не использовали при расчетах.

Представьте себе такую ситуацию, чтобы врач при постановке диагноза выбрасывал результаты каких-либо анализов, потому что они, мол, смазывают общую картину? Или чтобы инженер выбрасывал в корзину неудобные для его проекта результаты тестов? Во всяком случае, открыто в этом вряд ли кто-то признается, а то погонят метлой из профессии. А попгены это делают, не моргнув глазом. Вместо того, чтобы прямо сказать, что они не умеют работать с длинными гаплотипами и строить деревья, устраиваются всякие мутные обсуждения, пересыпанные названиями численных моделей и программных продуктов. Как будто какая-нибудь "навороченная" математическая модель способна сотворить чудо, и из предварительно "кастрированных" данных выдать нечто необыкновенное wink.gif


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Люда
сообщение 6.12.2012, 6:24
Сообщение #60


Знаток
****

Группа: Mt Helena
Сообщений: 619
Регистрация: 1.1.2010
Пользователь №: 2612



Известен ли кто это - Kidin FT152852 ? Пытаюсь строить Деревья. Он рядом с Al.Aburto.
Еще - почему-то, когда считаю "cвою" группу L243 с соседней L192.2, "наши" евреи (50521-204403) становятся менее родными, чем группа L192.2 (55151-9797).
Что означает масштаб на Рис. - 200. Наверно-лет?


--------------------
муж: Y - J2-L24(L590), митоДНК - F1b
зять1: Y - R1a1 (L784)
зять2: Y - R1a1 (YP331)

--------------------
mt-DNA: H6a1a5
Y-DNA: R1a.L365+ & mt-DNA: V1a (отец)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

10 страниц V  < 1 2 3 4 5 > » 
Быстрый ответОтветить в данную темуНачать новую тему
2 чел. читают эту тему (гостей: 2, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 16.7.2019, 11:31
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU