Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



41 страниц V  « < 39 40 41  
Ответить в данную темуНачать новую тему
> Днк-археология, Палео-днк, Исследования древней ДНК (дДНК)
Igor1961
сообщение 24.10.2018, 12:02
Сообщение #801


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6693
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Больбшое спасибо за оперативную ссылку! Материала много, в том числе ранее неизвестного, но статья пока смотрится сыроватой. Авторы попытались рассказать обо всем сразу, в итоге получилось довольно сумбурно, галопом по Европам. Надеюсь, в окончательной версии изложение будет более структурированным, с расстановкой акцентов, где это необходимо. Чтобы не растекаться мыслию по древу, ограничусь комментарием нескольких существенных моментов.

Первый – это явный «гвоздь программы», а именно открытие еще одной вымершей расы людей палеолита, существовавшей примерно в то же время, что европейские «костенкоиды». Палеогенетикам в очередной раз помогла вечная мерзлота, благодаря которой ДНК из зубов 32-тысячелетней давности сохранилась лучше, чем в иных образцах наших современников. Люди с берегов Яны принадлежали к ныне пресекшимся линиям Y-гаплогруппы Р и мито-гаплогруппы U. Кажетсо, это первая подтвержденная находка из парагруппы Р* (Р1* в нотации ISOGG). На покрытии 24х это можно считать практически доказанным фактом. Собственно, то же самое следует из филогении гаплогруппы Р, что помещает вилку Q и R на то же самое время. Неплохая проверка калибровки по снипам, кстати. Попытки наложить их аутосомы на современные (в широком смысле, начиная с неолита), используя РСА, ADIMIXTURE и F-статистику, не несут большого смысла. Компьютер железный, он что-то рассчитает, но в реальности получится фантом. Как и «костенкоиды», те люди не пережили нового похолодания, и их вклад в генетику наших современников вряд ли был заметен. Интересно, они тоже были темнокожими, как люди из Сунгиря и Мальты? Когда опубликуют БАМ-файлы, это будет нетрудно проверить тем, кто умеет с ними работать.

В сопроводительном материале есть глава, написанная археологами, из которой следует, что 32000 лет назад гайдаевская фраза «будете у нас на Колыме – милости просим» вовсе не несла иронического прдтекста. Там жили развитые племена, знавшие толк в украшениях и не имевшие недостатка в еде. Они могли позволить себе добывать мамонтов не для пропитания (для этого хватало бизонов, лошадей и северных оленей), а ради бивней, что шли на инструменты и украшения. По результатам анализа на гомозиготность выяснилоась, что у них не было никаких признаков близкородственных браков, как, к примеру, у поздних неандертальцев. Вырождение им явно не грозило. Значит, социальная организация тех племен давала возможность выбирать себе невест/женихов, живущих за десятки, а то и сотни километров от родных мест. Столь впечатляющая мобильность людей, живших на крайнем северо-востоке Азии еще до появления Берингии, вновь ставит вопрос о ранних волнах заселения Америки, предшестовавших «кловисовской». Антропологи, отстаивающие эту точку зрения, сейчас оттеснены почти что в маргиналы, но факты, что они предъявляют, пока не удается внятно объяснить с помощью «стандартной модели». Один из них - знаменитые головы ольмеков, о которых уже заходила речь.

Второй любопытный пример дает «колымчанин» 9700-летней давности, у которого определили субклад Q-M120. В статье этот факт подается в контексте, что тот образец показывет близость к современным корякам и ительменам. По аутосомам, может быть, и так, но по Y-ДНК ближайщими родственниками оказываются ... китайцы, у которых Q-M120 рассеян по всем их этническим группам на уровне 2 %. Совсем недавно тот же субклад всплыл в Молдавии у «киммерийца». Кажется, список пресекшихся сибирских линий Y-ДНК пополнился еще одной.

Самыми изученными в этой выборке оказались эскимосы начала нашей эры из окрестностей мыса Дежнева, хотя не слишком высокое покрытие не позволило провести глубокое типирование Y-ДНК у большей их части. Со скидкой на «недотипирование», пока можно предварительно заключить, что у «нео-эскимосов» Чукотки мы видим примерно тот же набор субкладов гаплогруппы Q, что у их современных собратьев на Аляске. Особняком стоят образца NEO253 и NEO249 из гаплогруппы С. Последнего удалость протипировать по цепочке L1373>F3918>F1756>B77. Субклад F1756 встречается у казахов, киргизов и монголов. Про этнический состав ветви В77 пока не курсе, а потому сложно оценить пути, приведшие предков того эскимоса так далеко.

С ископаемой гаплогруппой С в Сибири пока много белых пятен. Не попали еще палеогенетики на ее «коренное месторождение», а потому довольствуются единичными самородками. Когда и какими путями двигались ее носители, ныне занимающие одно из первых мест у разных коренных народов Сибири, еще предстоит выяснить. С этой проблемой напрямую связана загадка субклада С-Р39 – единственной значимой ветви американских индейцев, не принадлежащей к гаплогруппе Q. Есть еще какие-то С* в Перу, но ими пока никто серьезно не занимался.

Наконец, самый недавний образец с Яны (Yana_young, XII – XIV века н.э.) дает представление о масштабах миграции якутов, примерно в то же время двинувшихся из Прибайкалья на север. Его терминальный снип M1993 задает молодую (около 1500 лет до предка) ветвь гаплогруппы N, к которой принадлежит не менее 80 % современных якутов. В принципе, анализ аутосомной ДНК этого «землепроходца» может дать представление о якутах до того, как они смешались с кореннными жителями бассейна Лены.

Новые данные нанесены на карту.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 27.10.2018, 5:53
Сообщение #802


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6693
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Igor1961 @ 24.10.2018, 18:02) *
Самыми изученными в этой выборке оказались эскимосы начала нашей эры из окрестностей мыса Дежнева, хотя не слишком высокое покрытие не позволило провести глубокое типирование Y-ДНК у большей их части. Со скидкой на «недотипирование», пока можно предварительно заключить, что у «нео-эскимосов» Чукотки мы видим примерно тот же набор субкладов гаплогруппы Q, что у их современных собратьев на Аляске. Особняком стоят образца NEO253 и NEO249 из гаплогруппы С. Последнего удалость протипировать по цепочке L1373>F3918>F1756>B77. Субклад F1756 встречается у казахов, киргизов и монголов. Про этнический состав ветви В77 пока не курсе, а потому сложно оценить пути, приведшие предков того эскимоса так далеко.

Удалось выяснить ситуацию со снипом В77. Его идентифицировали в работе Karmin с соавторами 2015 года у коряка из пос. Эвенск Магаданской области. Это за 1640 км от мыса Дежнева, где 2000 лет назад жил его одноветочник. По меркам Крайнего Севера, не так уж и далеко smile.gif

Надеюсь, эта информация заинтересует Amigo, располагающего свежими данными по корякам и другим народам крайнего северо-востока России. Булат, сможете как-нибудь прокомментировать новую находку?


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Alexandr-2
сообщение 27.10.2018, 19:39
Сообщение #803


Эксперт
*****

Группа:  R1a
Сообщений: 1073
Регистрация: 5.9.2012
Пользователь №: 3885



Цитата(Igor1961 @ 24.10.2018, 13:02) *
Палеогенетикам в очередной раз помогла вечная мерзлота, благодаря которой ДНК из зубов 32-тысячелетней давности сохранилась лучше, чем в иных образцах наших современников. Люди с берегов Яны принадлежали к ныне пресекшимся линиям Y-гаплогруппы Р и мито-гаплогруппы U. Кажетсо, это первая подтвержденная находка из парагруппы Р* (Р1* в нотации ISOGG). На покрытии 24х это можно считать практически доказанным фактом. Собственно, то же самое следует из филогении гаплогруппы Р, что помещает вилку Q и R на то же самое время.


Остаётся ждать подтверждающих результатов по северному ("арктическому") пути миграции представителей R1a в Европу.
Можно привести следующую информацию по северным охотникам на мамонтов Западной Сибири - до Европы "рукой подать":
"Историческую экспозицию Музея Природы и Человека в Ханты-Мансийске открывает витрина с поистине уникальным экспонатом. Позвонок мамонта, пробитый орудием древнего человека — копьем или дротиком. Возраст находки примерно 13500 лет. Это единственное в мире прямое свидетельство, подтверждающее охоту древнего человека на мамонта. Он был найден в 2002 году в 120 метрах от устья Мамонтового ручья А.Ф.Павловым и Е.Н.Мащенко.
Ученые установили, что раненый человеком мамонт был взрослой самкой 23–25 лет. Ее высота составляла 215-220 см, а вес — 2,7-3,2 тонны. Конусовидное отверстие с застрявшими в плотной ткани пластинками зеленоватого кварцита — последствия мощного удара, нанесенного наконечником копья или дротика вкладышевого типа. Учитывая необходимое для такого броска усилие, археологи не исключают применения древним охотником несложного приспособления — копьеметалки, многократно усиливавшей мощность броска.
В палеонтологическом собрании музея более 6 тысяч костей животных мамонтовой фауны, собранных за годы исследований в местонахождении Луговском. Учеными установлено, что они принадлежат 13 видам: шести шерстистым носорогам, в том числе одному детенышу, четырем северным оленям, одному или двум взрослым бизонам и другим древним животным. Однако именно останки мамонтов и их прекрасная сохранность определяют уникальность Луговского. Обнаружены останки, по меньшей мере, тридцати одной особи мамонтов различного возраста. Датировки образцов костей мамонта находятся в основном во временном интервале 16,5-11 тысяч лет, а возраст кости шерстистого носорога — 30 тысяч лет".

Комментарий: 11 тысяч лет назад мамонты вымирают в Западной Сибири, охотники на мамонтов мигрируют на запад, в Восточную Европу, заселяя после ледника северную и центральную её часть. См. Культуры Ямочно-гребенчатой керамики.



--------------------
Y-DNA: R1a
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Dok
сообщение 3.11.2018, 14:47
Сообщение #804


Новичок
*

Группа:  Y - ???
Сообщений: 23
Регистрация: 15.6.2014
Пользователь №: 4416



Early pastoral economies along the Ancient Silk Road: Biomolecular evidence from the Alay Valley, Kyrgyzstan
https://journals.plos.org/plosone/article?i...7wpYzXIPYt1tp5w
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Амиго
сообщение 5.11.2018, 17:53
Сообщение #805


Автохтон
**********

Группа: R1a, Магистры
Сообщений: 4391
Регистрация: 12.2.2010
Из: Bashkortostan
Пользователь №: 2713
Страница в ЖЖ:-



Цитата(Igor1961 @ 27.10.2018, 6:53) *
Удалось выяснить ситуацию со снипом В77. Его идентифицировали в работе Karmin с соавторами 2015 года у коряка из пос. Эвенск Магаданской области. Это за 1640 км от мыса Дежнева, где 2000 лет назад жил его одноветочник. По меркам Крайнего Севера, не так уж и далеко smile.gif

Надеюсь, эта информация заинтересует Amigo, располагающего свежими данными по корякам и другим народам крайнего северо-востока России. Булат, сможете как-нибудь прокомментировать новую находку?


Добрый день. Извиняюсь что долго не мог ответить. Только что завершил тестирование телеутов и меркитов Алтая bashqort.gif с экспедиции, поэтому был занят.

По поводу отцовских линий на Камчатке см. тут http://suyun.info/index.php?LANG=RUS&p=4_17122017_11_1

В принципе по str-маркёрам нам встретились гаплотипы среди ительменов и коряков, но у них был сделан терминальный снип F7264, что соответствует уровню L1373. Описание этих кланов смотрите в статье со страницы 981.

Так у тонне-чавчувен-коряков, по мнению Г. М. Баимбетова, гаплотип напоминает родственную ранее ответвлённую линию Star-кластера, а в приближенцах гаплотип Абдуманапуулу из Кыргызстана, он из кластера F4002.



Смотрите в статье схему на стр. 989.

Интересно что ительменские и корякские кланы из линии C-F7264*Parent имеют аналогии с племенами северо-американских индейцев. См. на стр. 982. Так что Игорь вы правильно отметили этот момент.

Так бурин-ительмены по маркёрам родственны с индейцами чинуки из Реквы (Дель-норте, Калифорния, США). См. на стр. 983.


--------------------
Amigo

База данных У-ДНК Soraman http://suyun.info/index.php?LANG=ENG&p=b

Если что буду общаться на http://nations.unoforum.pro/

Наш сайт по этногеномике suyun.info

ЭИ Проект ''Suyun'' на сайте Томаса Кранна https://www.yseq.net/group_alleles.php?gid=70

Если вы новичок и не знаете какая у вас ветка, и что вам дальше заказывать, то см. тут.

Matches * Матчи http://www.familytreedna.com/public/Bashqo...ection=yresults
Nations * Народы http://www.familytreedna.com/public/suyun/...ection=yresults
Clans * Кланы и фамилии http://www.familytreedna.com/public/people...ection=yresults

The descendants of the ancient tribes * Потомки древних племён http://www.familytreedna.com/public/TuranS...ection=yresults

Среди цветов вишня, среди людей самураи...

--------------------
Y-DNA: R1a.Z2123. SUR250+, SUR22+
mt-DNA: H
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Dok
сообщение 6.11.2018, 11:49
Сообщение #806


Новичок
*

Группа:  Y - ???
Сообщений: 23
Регистрация: 15.6.2014
Пользователь №: 4416



http://www.pnas.org/content/early/2018/10/31/1813608115

Bronze Age population dynamics and the rise of dairy pastoralism on the eastern Eurasian steppe


Choongwon Jeong, Shevan Wilkin, Tsend Amgalantugs, Abigail S. Bouwman, William Timothy Treal Taylor, Richard W. Hagan, Sabri Bromage, Soninkhishig Tsolmon, Christian Trachsel, Jonas Grossmann, Judith Littleton, Cheryl A. Makarewicz, John Krigbaum, Marta Burri, Ashley Scott, Ganmaa Davaasambuu, Joshua Wright, Franziska Irmer, Erdene Myagmar, Nicole Boivin, Martine Robbeets, Frank J. Rühli, Johannes Krause, Bruno Frohlich, Jessica Hendy, and Christina Warinner

PNAS published ahead of print November 5, 2018

https://doi.org/10.1073/pnas.1813608115

Significance

Since the Bronze Age, pastoralism has been a dominant subsistence mode on the Western steppe, but the origins of this tradition on the Eastern steppe are poorly understood. Here we investigate a putative early pastoralist population in northern Mongolia and find that dairy production was established on the Eastern steppe by 1300 BCE. Milk proteins preserved in dental calculus indicate an early focus on Western domesticated ruminants rather than local species, but genetic ancestry analysis indicates minimal admixture with Western steppe herders, suggesting that dairy pastoralism was introduced through adoption by local hunter-gatherers rather than population replacement.

Abstract

Recent paleogenomic studies have shown that migrations of Western steppe herders (WSH) beginning in the Eneolithic (ca. 3300–2700 BCE) profoundly transformed the genes and cultures of Europe and central Asia. Compared with Europe, however, the eastern extent of this WSH expansion is not well defined. Here we present genomic and proteomic data from 22 directly dated Late Bronze Age burials putatively associated with early pastoralism in northern Mongolia (ca. 1380–975 BCE). Genome-wide analysis reveals that they are largely descended from a population represented by Early Bronze Age hunter-gatherers in the Baikal region, with only a limited contribution (∼7%) of WSH ancestry. At the same time, however, mass spectrometry analysis of dental calculus provides direct protein evidence of bovine, sheep, and goat milk consumption in seven of nine individuals. No individuals showed molecular evidence of lactase persistence, and only one individual exhibited evidence of >10% WSH ancestry, despite the presence of WSH populations in the nearby Altai-Sayan region for more than a millennium. Unlike the spread of Neolithic farming in Europe and the expansion of Bronze Age pastoralism on the Western steppe, our results indicate that ruminant dairy pastoralism was adopted on the Eastern steppe by local hunter-gatherers through a process of cultural transmission and minimal genetic exchange with outside groups.

Значимость
Начиная с бронзового века, скотоводство было доминирующим способом существования в Западной степи, но происхождение этой традиции в Восточной степи плохо изучено. Здесь мы исследуем предполагаемую раннюю скотоводческую популяцию в Северной Монголии и обнаруживаем, что молочное производство было установлено в Восточной степи к 1300 году до нашей эры. Молочные белки, сохранившиеся в зубном камне, указывают на раннее фокусирование на западных одомашненных жвачных животных, а не на местных видах, но генетический анализ указывает на минимальную примесь западных степных скотоводов, что указывает на то, что молочное скотоводство было введено путем принятия местными охотниками-собирателями, а не замены популяции.
Аннотация
Недавние палеогеномные исследования показали, что миграции западных степных скотоводов (WSH), начавшиеся в энеолите (около 3300-2700 гг. До н. Э.), глубоко трансформировали гены и культуры Европы и Центральной Азии. Однако, по сравнению с Европой, граница распространения WSH на восток не определена. Здесь мы представляем геномные и протеомные данные 22 захоронений позднего бронзового века, предположительно связанных с ранним скотоводством в Северной Монголии (ок. 1380-975 до н. э.). Геномный анализ показывает, что они в основном происходят от популяции, представленной охотниками-собирателями раннего бронзового века в Байкальском регионе, с ограниченным вкладом (≈7%) генов WSH(Западных степных скотоводов). В то же время, однако, масс-спектрометрический анализ зубного камня дает прямые белковые данные о потреблении бычьего, овечьего и козьего молока у семи из девяти человек. Ни у одного человека не было обнаружено молекулярных доказательств переносимости лактозы, и только один индивидуум показал более чем 10% вклад WSH, несмотря на присутствие популяций WSH в близлежащем Алтае-Саянском регионе в течение более чем тысячелетия. В отличие от распространения неолитического сельского хозяйства в Европе и распространения скотоводства бронзового века в западной степи, наши результаты показывают, что молочное скотоводство на основе жвачных животных было принято в Восточной степи местными охотниками-собирателями через процесс культурной передачи и минимальный генетический обмен с внешними группами.


Table S4. Uniparental haplogroups of the Khövsgöl individuals.
We determined mitochondrial haplogroups for 19 of 20 individuals, and Y haplogroups for all 12 males.

ID Sex MT-haplogroup Y-haplogroup 1
ARS001 M D4 Q1a2a1c (Q-L334;Q-L330)
ARS002 F D4j5 -
ARS003 M U5a2d1 N1c1a (N-M178)
ARS004 M F2a Q1a2 (Q-L942;Q-M346)
ARS005 M D4e1 Q1a2a1 (Q-L54)
ARS006 F C4a1a+195 -
ARS007 M A+152+16362 Q1a2a (Q-L475;Q-L53)
ARS008 M C4a2c Q1a2a1c (Q-L330)
ARS009 F D5a2a -
ARS011 M n/d Q1a2 (Q-L56;Q-M346)
ARS012 F C4a2a1 -
ARS013 F C -
ARS014 F C4a2c1 -
ARS015 M G3a Q1a1 (Q-Y706;Q-F1096)
ARS016 M A+152+16362+16189 Q1a2a1c (Q-L334;Q-L330)
ARS017 F G2a -
ARS018 M B5b1 Q1a (Q-M1117;Q-L472)
ARS024 F C4a1a1 -
ARS025 M D4b1a2a Q1a2a (Q-L475;Q-L53)
ARS026 M C4a1a+195 R1a1a1b2a2a (R-Z2123)

Notes: 1 Due to incomplete coverage of informative Y chromosome SNPs, Y haplogroup assignment has not gone down to the tip for some individuals.
The assigned haplogroup is the most downstream one supported by the presence of derived alleles.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Dok
сообщение 9.11.2018, 13:32
Сообщение #807


Новичок
*

Группа:  Y - ???
Сообщений: 23
Регистрация: 15.6.2014
Пользователь №: 4416



по древним ДНК из Америки.


https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)31380-1

Reconstructing the Deep Population History of Central and South America

Cosimo Posth 45, Nathan Nakatsuka 45, Iosif Lazaridis, Pontus Skoglund, Swapan Mallick, Thiseas C. Lamnidis, Nadin Rohland, Kathrin Nägele, Nicole Adamski, Emilie Bertolini, Nasreen Broomandkhoshbacht, Alan Cooper, Brendan J. Culleton, Tiago Ferraz, Matthew Ferry, Anja Furtwängler, Wolfgang Haak, Kelly Harkins, Thomas K. Harper, Tábita Hünemeier, Ann Marie Lawson, Bastien Llamas, Megan Michel, Elizabeth Nelson, Jonas Oppenheimer, Nick Patterson, Stephan Schiffels, Jakob Sedig, Kristin Stewardson, Sahra Talamo, Chuan-Chao Wang, Jean-Jacques Hublin, Mark Hubbe, Katerina Harvati, Amalia Nuevo Delaunay, Judith Beier, Michael Francken, Peter Kaulicke, Hugo Reyes-Centeno, Kurt Rademaker, Willa R. Trask, Mark Robinson, Said M. Gutierrez, Keith M. Prufer, Domingo C. Salazar-García, Eliane N. Chim, Lisiane Müller Plumm Gomes, Marcony L. Alves, Andersen Liryo, Mariana Inglez, Rodrigo E. Oliveira, Danilo V. Bernardo, Alberto Barioni, Veronica Wesolowski, Nahuel A. Scheifler, Mario A. Rivera, Claudia R. Plens, Pablo G. Messineo, Levy Figuti, Daniel Corach, Clara Scabuzzo, Sabine Eggers, Paulo DeBlasis, Markus Reindel, César Méndez, Gustavo Politis, Elsa Tomasto-Cagigao, Douglas J. Kennett 46, André Strauss 46, Lars Fehren-Schmitz 46, Johannes Krause 46, David Reich 46, 47

Published: November 8, 2018

DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.10.027

Highlights

• Genome-wide analysis of 49 Central and South Americans up to ∼11,000 years old
• Two previously unknown genetic exchanges between North and South America
• Distinct link between a Clovis culture-associated genome and the oldest South Americans
• Continent-wide replacement of Clovis-associated ancestry beginning at least 9,000 years ago

Summary

We report genome-wide ancient DNA from 49 individuals forming four parallel time transects in Belize, Brazil, the Central Andes, and the Southern Cone, each dating to at least ∼9,000 years ago. The common ancestral population radiated rapidly from just one of the two early branches that contributed to Native Americans today. We document two previously unappreciated streams of gene flow between North and South America. One affected the Central Andes by ∼4,200 years ago, while the other explains an affinity between the oldest North American genome associated with the Clovis culture and the oldest Central and South Americans from Chile, Brazil, and Belize. However, this was not the primary source for later South Americans, as the other ancient individuals derive from lineages without specific affinity to the Clovis-associated genome, suggesting a population replacement that began at least 9,000 years ago and was followed by substantial population continuity in multiple regions.

Основные моменты

• Геномный анализ 49 центральных и южных американцев возрастом до ~ 11 000 лет
• Два ранее неизвестных генетических обмена между Северной и Южной Америкой
• Четкая связь между геномом, ассоциированным с культурой Кловис, и древнейшими южноамериканцами
• Continent-wide replacement of Clovis-associated ancestry beginning at least 9,000 years ago
• Общеконтинентальная замена генетического компонента, связанного с Кловисом, начавшаяся как минимум 9000 лет назад

Резюме

Мы сообщаем о геномной древней ДНК из 49 особей, образующих четыре параллельных временных разреза в Белизе, Бразилии, Центральных Андах и Южном конусе, каждый из которых простирается не менее чем на ~ 9000 лет назад. Общая популяция предков быстро разошлась из одной из двух ранних ветвей, которые стали предковыми для нынешних коренных американцев. Мы документируем два ранее недооцененных потока генов между Северной и Южной Америкой. Один из них воздействовал на Центральные Анды на ~ 4200 лет назад, а другой объясняет близость между древнейшим североамериканским геномом, связанным с культурой Кловис, и древнейшими центральными и южноамериканцами из Чили, Бразилии и Белиза. Однако это не было основным источником генофонда для более поздних южноамериканцев, поскольку другие древние индивидуумы проистекают из линий, не имеющих специфической близости к генотипу, ассоциируемому с кловисцем, что предполагает замещение населения, которое началось по меньшей мере 9 000 лет назад, после чего последовала существенная преемственность населения в нескольких регионов.

Код: [Выделить]
Sample ID Average of 95.4% date range in calBP (defined as 1950 CE) Location Country Sex mtDNA haplogroup Y chrom. calls
I2232 8370 Arroyo Seco II Argentina M C1b Q1a2
I0308 7430 Arroyo Seco II Argentina M A2 (Llamas et al 2016) Q1a2a1a1
I2230 8570 Arroyo Seco II Argentina M C1b Q1a2a1b
I0309 7650 Arroyo Seco II Argentina M D1 (Llamas et al 2016) Q1a2a1a1
I7086 7750 Arroyo Seco II Argentina F D1g -
I7088 7420 Arroyo Seco II Argentina F A2 -
I7090 7160 Arroyo Seco II Argentina M C1c Q1a2
I1748 7160 Arroyo Seco II Argentina M C1c n/a
I8349 6710 Pampas, Laguna Chica Argentina F C1b -
I8350 6800 Pampas, Laguna Chica Argentina M A2 Q1a2
I8348 6880 Pampas, Laguna Chica Argentina F B2b -
I3443 9310 Mayahak Cab Pek Belize F D4h3a -
I5457 7390 Saki Tzul Belize M D1 Q1a
I5456 7370 Saki Tzul Belize M D1 Q1a2a1
I9058_d 2280 Jabuticabeira 2 Brazil F C1c -
I9057_d 2220 Jabuticabeira 2 Brazil M C1c n/a
I9054_d 1940 Jabuticabeira 2 Brazil F C1c -
I9055_d 1870 Jabuticabeira 2 Brazil F C1c -
I9056_d 1200 Jabuticabeira 2 Brazil F B2 -
CP23 9550 Lapa do Santo Brazil F D4h3a -
CP25 9590 Lapa do Santo Brazil M A2 Q1a2a1a1
CP22 9560 Lapa do Santo Brazil F B2 -
CP21 9240 Lapa do Santo Brazil M B2 Q1a2a1b
CP18 9510 Lapa do Santo Brazil M A2 Q1a2a1a
CP26 9550 Lapa do Santo Brazil F A2 -
CP19 9850 Lapa do Santo Brazil M C1d1 C2b
LAR001 6550 Laranjal Brazil F A2 -
LAR002 6800 Laranjal Brazil M A2 Q1a2a
MOS001 5810 Moraes Brazil F D4h3a -
I1752 600 Conchalí, Santiago, RM Chile M B2i2b Q1a2a1a1
I1754 830 Conchalí, Santiago, RM Chile M D4h3a1a2 Q1a2a1b
I11974 10940 Los Rieles, Los Vilos, Coquimbo Chile M C1b Q1a2a1a1
I1753 5120 Los Rieles, Los Vilos, Coquimbo Chile M C1b Q1a2a1
I2537 660 Pica Ocho, Coast Chile M A2 Q1a2a
CUN008 3280 Cuncaicha, Highlands Peru M A2h Q1a2a1a1
CP8 4180 Cuncaicha, Highlands Peru M A2a3 Q1a2a1a1
CP29 9000 Cuncaicha, Highlands Peru F A2ao -
I2261 4080 La Galgada, Highlands Peru M C1c Q1a2a1a1
I1484 780 Botigiriayocc, Laramate, Highlands Peru M B2 Q1a2a1a1
I1742 880 Tranca, Laramate, Highlands Peru F D1 -
I1485 1030 Cueva Yacotogia, Laramate, Highlands Peru M B2 Q1a2a1a1
I2551 830 Huayuncalla, Laramate, Highlands Peru F C1b -
I0237 860 Botigiriayocc, Laramate, Highlands Peru M B2 (Llamas et al. 2016) Q1a2a
I1357 880 Botigiriayocc, Laramate, Highlands Peru M B2l Q1a2a
I0039 3520 Lauricocha, Highlands Peru M A2 (Fehren-Schmitz et al. 2015) Q1a2a1b
I0040 5840 Lauricocha, Highlands Peru M A2 (Fehren-Schmitz et al. 2015) Q1a2a1a1
I0038 8610 Lauricocha, Highlands Peru M A2 (Fehren-Schmitz et al. 2015) Q1a2a1b
I0238 8560 Lauricocha, Highlands Peru M A2 (Fehren-Schmitz et al. 2015) Q1a
I0041 8500 Lauricocha, Highlands Peru F B2 (Fehren-Schmitz et al. 2015) -
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Dok
сообщение 9.11.2018, 13:47
Сообщение #808


Новичок
*

Группа:  Y - ???
Сообщений: 23
Регистрация: 15.6.2014
Пользователь №: 4416



http://advances.sciencemag.org/content/4/11/eaau4921

The genetic prehistory of the Andean highlands 7000 years BP though European contact

John Lindo1,2,*, Randall Haas3, Courtney Hofman4,5, Mario Apata6, Mauricio Moraga6,7, Ricardo A. Verdugo6,8,*, James T. Watson9, Carlos Viviano Llave10, David Witonsky2, Cynthia Beall11, Christina Warinner4,5,12, John Novembre2, Mark Aldenderfer13,* and Anna Di Rienzo2,*

Science Advances 08 Nov 2018:
Vol. 4, no. 11, eaau4921
DOI: 10.1126/sciadv.aau4921

Abstract

The peopling of the Andean highlands above 2500 m in elevation was a complex process that included cultural, biological, and genetic adaptations. Here, we present a time series of ancient whole genomes from the Andes of Peru, dating back to 7000 calendar years before the present (BP), and compare them to 42 new genome-wide genetic variation datasets from both highland and lowland populations. We infer three significant features: a split between low- and high-elevation populations that occurred between 9200 and 8200 BP; a population collapse after European contact that is significantly more severe in South American lowlanders than in highland populations; and evidence for positive selection at genetic loci related to starch digestion and plausibly pathogen resistance after European contact. We do not find selective sweep signals related to known components of the human hypoxia response, which may suggest more complex modes of genetic adaptation to high altitude.

Аннотация

Заселение Андского нагорья высотой более 2500 м над уровнем моря представляло собой сложный процесс, включающий культурную, биологическую и генетическую адаптацию. Здесь мы представляем временные ряды древних целых геномов из Анд Перу, относящихся к 7000 календарным годам до настоящего времени (ВР), и сопоставляем их с 42 новыми наборами генома генетических вариаций генома из горных и низинных популяций. Мы делаем вывод о трех существенных особенностях: разделение между популяциями на низких и высоких высотах, который произошел от 9200 до 8200 лет назад; резкое сокращение популяции после контакта с европейцами, которое значительно более серьезно в южноамериканских низменностях, чем в высокогорных популяциях; и доказательство положительного отбора в генетических локусах, связанных с перевариванием крахмала и, вероятно, резистентность к патогенам после контакта с европейцами. Мы не находим сигналов об отборе вариантов, связанных с известными компонентами реакции гипоксии человека, что может предполагать более сложные способы генетической адаптации к большой высоте.

Код: [Выделить]
ID Date BP mtDNA Sex Site Whole-genome coverage
IL2 NA D1 XX Rio Uncallane 0.99
IL3 1783–1616 B2 XX Rio Uncallane 0.92
IL4 1529–1426 C1b XY Rio Uncallane 0.75
IL5 1722–1611 C1c XX Rio Uncallane 0.94
IL7 1825–1730 C1b XY Rio Uncallane 0.98
K1 NA C1b XX Kaillachuro 0.26
SMP5 6884–6757 C1c XY SMP 0.08
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

41 страниц V  « < 39 40 41
Быстрый ответОтветить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 16.11.2018, 10:54
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU