Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



36 страниц V  < 1 2 3 4 5 > »   
Ответить в данную темуНачать новую тему
> Реконструкция древа R1a
mouglley
сообщение 5.12.2008, 22:45
Сообщение #41


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Павел Шварёв @ 5.12.2008, 17:41) *
Этап первый - ручной сбор выборки.
R1a в ysearch:
Восточная Европа 288
Западная европа 196
Британия 265
Америка 294
Азия 34
Ближний восток 13
Скандинавия 56


R1a1
Западная Eвропа 166...
Ой, шикуете вы. Нам бы такую выборку - точно определились бы с историческими событиями "кто куда тогда-то пришёл".


--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Yurgan
сообщение 6.12.2008, 0:24
Сообщение #42


Эксперт
*****

Группа: N
Сообщений: 1167
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 529



Ладно, поделюсь.
У киргизов (SMGF) самая большая группа имеет на маркерах DYS448 DYS449 = 21 31, у большинства остальных R1a в том числе части киргизов - 20 32

YCAIIa YCAIIb = 19 23

К ней принадлежит и Кубан Чороев


--------------------
Y - DNA-mater: N1с1* (Baltic line)

--------------------
Y-DNA: N1c (Karelian line)
mt-DNA: U4a
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Yurgan
сообщение 6.12.2008, 0:24
Сообщение #43


Эксперт
*****

Группа: N
Сообщений: 1167
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 529



О поляках= наверное знаете.
393, 390, 19. 385a,b = 13 25 17 10 14
Это и чехи и немцы и поляки - в основном Силезия (полабы) и юг вплоть до Львова (YHRD)
YCAIIa YCAIIb = 19 23
К этой группе принадлежит и Pentekost-Volkonsky и Obolensky


--------------------
Y - DNA-mater: N1с1* (Baltic line)

--------------------
Y-DNA: N1c (Karelian line)
mt-DNA: U4a
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 11.12.2008, 15:14
Сообщение #44


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Закончился этап сбора и сортировки гаплотипов для третьей версии, в ysearch и по географическим проектам набралось 570 уникальных гаплотипа, после сведения к гаплотипов к ветвям 20-юродного родства получилось 392 ветви, в большинстве это ветви с одним гаплотипом.
20 рамки двадцатиюродного родства выбраны для того чтобы убрать искажающее влияние на древо со стороны гаплотипов фамильных проектов.

Сейчас просчитал статискику по 392 гаплотипам и получил в нетворке первую сеть. Утилита считала около 40 минут, нетворк трудился час.


Движемся дальше. smile.gif
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
_Centurion_*
сообщение 11.12.2008, 19:50
Сообщение #45





Гости






Цитата
нетворк трудился час.


Не может быть? Это долго...
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
kuban
сообщение 11.12.2008, 20:15
Сообщение #46


Новичок
*

Группа:  R1a
Сообщений: 1
Регистрация: 26.7.2008
Пользователь №: 618



Цитата(Павел Шварёв @ 11.12.2008, 17:14) *
Закончился этап сбора и сортировки гаплотипов для третьей версии, в ysearch и по географическим проектам набралось 570 уникальных гаплотипа, после сведения к гаплотипов к ветвям 20-юродного родства получилось 392 ветви, в большинстве это ветви с одним гаплотипом.
20 рамки двадцатиюродного родства выбраны для того чтобы убрать искажающее влияние на древо со стороны гаплотипов фамильных проектов.

Сейчас просчитал статискику по 392 гаплотипам и получил в нетворке первую сеть. Утилита считала около 40 минут, нетворк трудился час.


Движемся дальше. smile.gif





 С нетерпением ждем подробных результатов. А будет ли там ветвь киргизы?

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
aklyosov
сообщение 11.12.2008, 21:05
Сообщение #47


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 8858
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 526



Может потому что я привык к деревьям гаплотипов, которые дают четкие ветви, данное представление мне кажется значительно менее информативным. А что, дерева не будет?





--------------------
Y-DNA: R1a-Z283
mt-DNA: H

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Valery
сообщение 11.12.2008, 21:25
Сообщение #48


Знаток
****

Группа: Известные анонимы
Сообщений: 570
Регистрация: 25.10.2008
Пользователь №: 956



То что на рисунке и так довольно близко к дереву. Единственное, если требуется могу перевести в формат где слева будет дерево, в ASCII, а справа - табличка гаплотипов, все как текстовый файл, причем с длинными фамилиями, больше 6 букв. С сохранением копирайта первоначального автора, ибо речь о чисто технических вещах.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 11.12.2008, 22:48
Сообщение #49


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Отличное дерево. Как же вас много!
Батенька, да у вас диагноз - структура.
Видны, как минимум, 5 отдельновзятых ветвей, у которых либо сейчас известен (R1a1a, b, c, d, e), либо буден выяснен в ближайшее время характерный для них снип.
А теперь вопросы, коллега (отлично понимаю, что ответы на некоторые из них - авторское право и нисколько не обижусь, если Вы на них не ответите):
  • Проявлятеся ли привязка к каким-нибудь ветвям географическое расположение места происхождения их?
  • На дереве есть три хвоста, уходящие во вне кадра. К кому они идут?
    Цитата(Павел Шварёв @ 11.12.2008, 15:14) *
    Закончился этап сбора и сортировки гаплотипов для третьей версии, в ysearch и по географическим проектам набралось 570 уникальных гаплотипа, после сведения к гаплотипов к ветвям 20-юродного родства получилось 392 ветви, в большинстве это ветви с одним гаплотипом.
  • Каким образом Вы устанавливали это 20-юродное?
  • Использовали ли Вы в Нетвёрке коэффициены уважаемого wertner?
  • С какой целью?
  • Почему выбросили остальные 178 гаплотипов?


--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.12.2008, 5:49
Сообщение #50


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Уважаемое днк-генеалогическое сообщество это только промежуточный результат, следующий этап работа с весами. Сеть должна стать более похожей на древо, потом будет этап проверок и корректировок, потом будем анализировать географию ветвей, потом попробуем привязать древние ДНК.


mouglley, я не засекречиваю методологию, ведь мы кровно заинтересованы в успехе других гаплогрупп.
Лично я выявил 20 юродное примитивным способом, просчитал на утилите TMRCA, и по желтому цвету ячеек вычислил все пары с этим уровнем родства.


Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.12.2008, 5:52
Сообщение #51


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата
Почему выбросили остальные 178 гаплотипов?

Например Макдональдов человек 25, если их не свести к одному гаплотипу то они будут сильно искажать древо вокруг себя, да и окажут дурное шотландское влеяние на веса.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 13.12.2008, 9:01
Сообщение #52


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Павел Шварёв @ 13.12.2008, 5:49) *
Лично я выявил 20 юродное примитивным способом, просчитал на утилите TMRCA, и по желтому цвету ячеек вычислил все пары с этим уровнем родства.
Спасибо. Надо попробовать. Эпсилон 0, или другой? Хвосты наружу к другим гаплогруппам? Или тоже к R1a1, но мутантам?


--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.12.2008, 9:43
Сообщение #53


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Я не в Нетворке выявлял, а с помощью известной утилиты МасGee.
Настройки:
1 TMRCA,
2 Probability = 95%
3 Mutation Rate = FTDNA 0.004..0.0075
4 Units = Generations
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 13.12.2008, 10:36
Сообщение #54


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Павел Шварёв @ 13.12.2008, 9:43) *
Я не в Нетворке выявлял, а с помощью известной утилиты МасGee.
Это понятно, но потом - сам рисунок в Нетвоке? А там есть эпсилон в настройках. Что он улучшает не знаю. Но время затягивает в десятки раз


--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
wertner
сообщение 13.12.2008, 20:09
Сообщение #55


Активист
***

Группа:  E
Сообщений: 323
Регистрация: 2.7.2008
Из: Казань<->Москва
Пользователь №: 505



Если сеть считать с эпсилон=0, то Нетворк не имеет выбора как построить сеть. А эпсилон как бы задает свободу выбора, делает сеть более свободной и получающийся результат должен быть лучше. Например, чем больше эпсилон, тем правильней Нетворк прикрепляет упомянутые "хвосты".
Впрочем, Valery лучше все опишет.


--------------------
Y-DNA: E1b1b1a2
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2, I2b1, R1b1b2a1a1
Мой предиктор Y-гаплогрупп (включая ветви R1a1a): файл для скачивания
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 13.12.2008, 20:52
Сообщение #56


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(wertner @ 13.12.2008, 20:09) *
Если сеть считать с эпсилон=0, то Нетворк не имеет выбора как построить сеть. А эпсилон как бы задает свободу выбора, делает сеть более свободной и получающийся результат должен быть лучше. Например, чем больше эпсилон, тем правильней Нетворк прикрепляет упомянутые "хвосты".
Впрочем, Valery лучше все опишет.
Большое спасибо за пояснения. Но времени на это уходит. У меня черырёхядерник вместе с 2 гигами памяти кипит всю ночь.


--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Yurgan
сообщение 14.12.2008, 15:07
Сообщение #57


Эксперт
*****

Группа: N
Сообщений: 1167
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 529



Цитата(Yurgan @ 6.12.2008, 3:24) *
О поляках= наверное знаете.
393, 390, 19. 385a,b = 13 25 17 10 14
Это и чехи и немцы и поляки - в основном Силезия (полабы) и юг вплоть до Львова (YHRD)
YCAIIa YCAIIb = 19 23
К этой группе принадлежит и Pentekost-Volkonsky и Obolensky

Распространение этого польско-чешского гаплотипа хорошо лажится на территорию пражско-корчаковской культуры



--------------------
Y - DNA-mater: N1с1* (Baltic line)

--------------------
Y-DNA: N1c (Karelian line)
mt-DNA: U4a
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Yurgan
сообщение 14.12.2008, 15:12
Сообщение #58


Эксперт
*****

Группа: N
Сообщений: 1167
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 529



Действительно, на древе R1a выделяются две большие ветви, условно которые можно назвать балтийской и сарматской. Польско-чешская линия явно относится к сарматской, ветвь Лифанцева, Уваркина, Трубецкого - балтийская. Скандинавская вместес Мкдональдами - идет от балтской.
Т.е. явно заметно, что на территории Центральной Европы были одно группа R1a (балтийская), и к ней прибавились представители сарматской ветви, пришедшие с Востока из Великой Степи.
Новгородцы - потомки балтийской ветви.


--------------------
Y - DNA-mater: N1с1* (Baltic line)

--------------------
Y-DNA: N1c (Karelian line)
mt-DNA: U4a
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 14.12.2008, 16:45
Сообщение #59


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Yurgan @ 14.12.2008, 15:12) *
Действительно, на древе R1a выделяются две большие ветви, условно которые можно назвать балтийской и сарматской. Польско-чешская линия явно относится к сарматской, ветвь Лифанцева, Уваркина, Трубецкого - балтийская. Скандинавская вместес Мкдональдами - идет от балтской.
Т.е. явно заметно, что на территории Центральной Европы были одно группа R1a (балтийская), и к ней прибавились представители сарматской ветви, пришедшие с Востока из Великой Степи.
Новгородцы - потомки балтийской ветви.
Обратите внимание на то, что в дереве N1c1 прослеживается аналогичная тенденция с балтами и её потомками - скандинавами и британцами.

Можно уже говорить о том, что эта ветвь R1a1 образовывала с N1c1 общее племя и они распространялись совместно. Остаётся прикинуть по датам. У N1c1 пока по этой ветви данных мало. Может быть, нам помогут данные по возрасту ветвей R1a1.

Вот и колхоз получается. tongue.gif



--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 14.12.2008, 17:01
Сообщение #60


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(mouglley @ 14.12.2008, 16:45) *
У N1c1 пока по этой ветви данных мало. Может быть, нам помогут данные по возрасту ветвей R1a1.

Я тут денька три топал бодрым шагом, сейчас понял что не туда. Завтра передам АК выборки по ветвям, тогда может что с временами начнет проясняться.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

36 страниц V  < 1 2 3 4 5 > » 
Быстрый ответОтветить в данную темуНачать новую тему
2 чел. читают эту тему (гостей: 2, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 14.11.2019, 10:30
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU