Днк-археология, Палео-днк, Исследования древней ДНК (дДНК) Опции

[Залесец]

Genomic Steppe ancestry in skeletons from the Neolithic Single Grave Culture in Denmark (https://journals.plos.org/plosone/article?i...al.pone.0244872).

Это Культура одиночных погребений (КИО шуровой керамики и боевых топоров).

Нашли 9 человек (Supporting information > S4 Table):
R1b (R1b-M343),
R1b1 (R1b-L754/L761),
R1b1a (R1b-L389),
R1b1a1 (R1b-P297),
R1b1a2 (R1b-V1636),
R1b1a2a (R1b-V1274 (< V1636)),
R1b1a2b (R1b-Y83069/Y106006 (< V1636)),
R1b1b1 (R1b-M18 (< V88)),
R1b1b2 (R1b-Y7777 (< V88)).

К предкам колоколовидников или ямников (Rb-L23) могут относиться лишь 4 первых недотипированных образца, а остальные 5 человек – это боковые линии от магистральной линии R1b-L23.

Немного удивляют находки 2 носителей R1b-V88 здесь на севере Европы, так как ранее их находили или в Италии, или конкретно на Сардинии (http://www.balto-slavica.org/forum/index.p...77&p=322817). Так же удивляет, что не нашли ни носителей I2a1, ни носителей I2a2, ни носителей G2a.

[Igor1961]

Спасибо за ссылку! Мы видим очередной пример, что "шнуровиков" было много, хороших и разных. Археологи, похоже, свалили в одну кучу самые разные народы, каждый со своей историей. Тот, что жил на территории Дании 4400 лет назад, похоже, не оставил там прямых потомков по мужской линии.

Субклад R1b-V88 очень древний, так что его находка далеко от Сардинии не должна вызывать особого удивления. Безвременно ушедший блогер с ником Genetiker уже находит V88 а неолите Германии (культура Баальберге), но его интерпретации БАМ-файлов нередко грешили натяжками, так что результат не считается надежным. Опубликованные датчанами данные тоже надо перепроверять, впрочем.

Отсутствие G2a как раз удивлять не должно - они до этих краев не доходили, по всей видимости. Почему нет I2, действительно, странно. Но на такой выборке может быть что угодно.

[Igor1961]

Небольшая поправка в стиле старого анекдота, что заканчивается словами «и не выиграл, а проиграл». При внимательном чтении статьи выясняется, что в Table S4 даётся не список из 9 образцов, а результаты анализа ЕДИНСТВЕННОГО образца, у которого удалось получать сколько-нибудь приемлемое покрытие.

Он из ныне очень редкого субклада R1b-V1636, что мало о чем говорит в силу единичности находки. Все остальные гаплогруппы не нашли, потому что не искали. Извиняюсь, что не сразу обратил на это внимание.

[Залесец]

Небольшая поправка в стиле старого анекдота, что заканчивается словами «и не выиграл, а проиграл». При внимательном чтении статьи выясняется, что в Table S4 даётся не список из 9 образцов, а результаты анализа ЕДИНСТВЕННОГО образца, у которого удалось получать сколько-нибудь приемлемое покрытие.

Он из ныне очень редкого субклада R1b-V1636, что мало о чем говорит в силу единичности находки. Все остальные гаплогруппы не нашли, потому что не искали. Извиняюсь, что не сразу обратил на это внимание.

Вот таблица ((https://journals.plos.org/plosone/article?i...al.pone.0244872): Supporting information > S4 Table):



То есть получается, что это последовательное определение субклада одного образца через наличие или отсутствие тех или иных снипов M343+ > L754/L761+ > L389+ > P297- > V1636+ > V1274- > Y83069/Y106006- > M18- > Y7777-, если я теперь правильно понял?

ISoGG (https://docs.google.com/spreadsheets/d/1JvX...#gid=1078904281):



YFull (https://www.yfull.com/tree/R1b/).

Но тогда получается, что это субклад V1636* ((https://www.yfull.com/tree/R-V1636/) субклад, у которого пока не нашли современных потомков (нисходящие субклады)) или я опять неправильно понимаю?

[Залесец]

A genetic history of the pre-contact Caribbean (https://www.nature.com/articles/s41586-020-03053-2).


Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia (https://advances.sciencemag.org/content/7/2...IOibReYszmwTz8w).


Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France (https://www.cell.com/current-biology/fullte...9822(20)31835-2).

[Igor1961]

Но тогда получается, что это субклад V1636* ((https://www.yfull.com/tree/R-V1636/) субклад, у которого пока не нашли современных потомков (нисходящие субклады)) или я опять неправильно понимаю?

Все поняли правильно. От субклада, следы которого пока нашли в ископаемой ДНК на Кавказе, осталось так мало потомков, что наткнуться на след какой-либо из современных ветвей было бы редким везением. Повторю еще раз, что по одному образцу очень сложно сделать выводы о людях, что жили на территории Ютландии в то время. Авторы и сами это понимают, а потому статья пошла не в рейтинговый журнал типа Science или Nature, а в "братскую могилу" PlosONE.

[Igor1961]

A genetic history of the pre-contact Caribbean (https://www.nature.com/articles/s41586-020-03053-2).


Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia (https://advances.sciencemag.org/content/7/2...IOibReYszmwTz8w).


Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France (https://www.cell.com/current-biology/fullte...9822(20)31835-2).

Спасибо! Со статьей по Карибам знаком. Возможно, она представляет интерес для узких специалистов по истории этого региона, но в целом ее материалы мало что дают для общей публики. Никаких сенсационных данных там нет - все образцы из гаплогруппы Q, более глубокое отнесение зависит в основном от покрытия. Примерно то же самое, наверное, можно сказать про статью о Сибири. Там образцы поступили из тех же археологических сайтов, что уже проходили в других публикациях, а потому новизны почти нет. Вдобавок, в сопроводительном файле по непонятной причине нет таблиц с данными, хотя ссылки на них имеются.

У французов с этим получше, но все таблицы разрозненные, надо самому собирать воедино. Появится время, займусь и добавлю новые точки на карты ископаемый ДНК из Западной Европы и из гаплогруппы I2.

[Залесец]

Вышла ещё одна статья о Фатьяновской культуре:
Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain (https://advances.sciencemag.org/content/7/4/eabd6535).

Появились некоторые изменения в сравнении с более ранней статьёй (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.02.184507v1). В ранней статье было 16 мужчин, из которых 14 фатьяновцы ((https://www.biorxiv.org/content/10.1101/202...entary-material): Supplementary Data 2), а в новой статье стало 19 мужчин, из которых 17 фатьяновцы ((https://advances.sciencemag.org/content/sup....4.eabd6535.DC1): Table S1). Но качественных изменений нет, по-прежнему лишь у одного носителя R1a-Z645 предполагают субклад Z283.

[Igor1961]

Второй вопрос - это недостаточно глубокое отнесение для образцов, имеющих покрытие более 2х. Но это дело поправимое, потому что опубликованы БАМ-файлы. Надеюсь, в скором будущем специалисты скажут свое слово. Может быть, наконец-то удастся поймать Неуловимого Джо R1b-U106?

Не так давно работа была проделана, и образцы с приемлемым покрытием появились на YFull https://www.yfull.com/live/tree/R-L51/
Вот выжимка по их данным



Джо опять ускользнул, а линия тех польских "шнуровиков", похоже, терминировалась, как можно судить по их месту на YTree.