Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



 
Ответить в данную темуНачать новую тему
> Таблица Расчета Времени Жизни Общего Предка Двух Гаплотипов.
Павел Шварев
сообщение 27.4.2013, 10:04
Сообщение #1


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(Igor1961 @ 29.9.2012, 7:51) *
В обсуждении разных тем постоянно возникают вопросы, сколько лет разницы соответствует тому или иному числу мутаций, разделяющих гаплотипы. Все это несложно рассчитать, пользуясь известными формулами и скоростями мутаций, откалиброванными на десятках генеалогических линий. Однако, новички не всегда о них знают и порой берут цифры неизвестно откуда. Да и тем, кто практически работает с выборками гаплотипов, не всегда удобно рыться в первых статьях А.А. Клёсова и Д.С. Адамова в поисках нужной цифры и таблицы пересчета.

Для удобства, предлагаю таблицу, в которой выписаны промежутки времени, соответствующие целому числу мутаций на гаплотип. Данные приведены для 4-х стандартных форматов, что чаще всего используются: 25, 37, 67 и 111 маркеров. При количестве мутаций, приближающемся к 1-й на 1 маркер, картина мутаций в стандартных панелях начинает отклоняться от модели свободных случайных блужданий, на которой основаны как квадратичный, так и линейный методы. Это приводит к искажениям, а потому из таблицы исключены значения, попадающие в эту область. При таком масштабе датировок следует работать с медленными панелями.

ТАБЛИЦА
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 12.5.2013, 14:47
Сообщение #2


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Знаменитая утилита МасGee длярасчета общих предков сразу для массы гаплотипов.

Y-Utility: Y-DNA Comparison Utility, Ysearch Mode

Теперь доступна версия для сравнений по 111 маркерам!
http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Brevis
сообщение 13.5.2013, 14:10
Сообщение #3


Эксперт
*****

Группа: J1
Сообщений: 1701
Регистрация: 16.7.2011
Пользователь №: 3441



Цитата(Павел Шварев @ 12.5.2013, 15:47) *
Знаменитая утилита МасGee длярасчета общих предков сразу для массы гаплотипов.

Y-Utility: Y-DNA Comparison Utility, Ysearch Mode

Теперь доступна версия для сравнений по 111 маркерам!
http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html

Уважаемый Павел,а как Вы смотрите на то,чтобы организовать дистанционные курсы по ДНК-генеалогии на Родстве,с целью обучения расчетам,составления дерева и т.д.,разумеется за доступную и умеренную плату,думаю,что спрос будет вам обеспечен,ведь проекты появляются,как грибы после дождя,а участникам самим разобраться трудновато...


--------------------
Ingush DNA Project http://www.familytreedna.com/public/Ingush...ection=yresults

--------------------
Y-DNA: J1
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.5.2013, 14:50
Сообщение #4


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



А как это "дистанционно"?
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Brevis
сообщение 13.5.2013, 15:00
Сообщение #5


Эксперт
*****

Группа: J1
Сообщений: 1701
Регистрация: 16.7.2011
Пользователь №: 3441



Цитата(Павел Шварев @ 13.5.2013, 15:50) *
А как это "дистанционно"?

В смысле,через интернет,обучать основам в инивидуальном порядке.


--------------------
Ingush DNA Project http://www.familytreedna.com/public/Ingush...ection=yresults

--------------------
Y-DNA: J1
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.5.2013, 15:14
Сообщение #6


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Через скайп?

А может просто разжеванный мануал написать, разместить в форуме и по мере вопросов отвечать? Это получится бесплатно.
У меня сейчас реально нет времени на индивидуальные уроки....
Может кто из опытных форумчан согласится?
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Brevis
сообщение 13.5.2013, 15:31
Сообщение #7


Эксперт
*****

Группа: J1
Сообщений: 1701
Регистрация: 16.7.2011
Пользователь №: 3441



Цитата(Павел Шварев @ 13.5.2013, 16:14) *
Через скайп?

А может просто разжеванный мануал написать, разместить в форуме и по мере вопросов отвечать? Это получится бесплатно.
У меня сейчас реально нет времени на индивидуальные уроки....
Может кто из опытных форумчан согласится?

Думаю,что достаточно было бы объяснять через е-майл,если кто-то из профессионалов возьмется консультировать,но если на форуме будет такая тема-это тоже будет здорово.


--------------------
Ingush DNA Project http://www.familytreedna.com/public/Ingush...ection=yresults

--------------------
Y-DNA: J1
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.5.2013, 16:21
Сообщение #8


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Бревис, если у Вас есть серьезное желание заняться филогенией, то прошу рассмотреть мое предложение от нашего проекта вести вести филогенетическое древо своей гаплогруппы. Под "вести" я подразумеваю следующее -построить филогенетическое древо гаплогруппы, отслеживать новые гаплотипы, определять куда в древе они попадают, корректировать древо по появляющимся новым снипам.
В этом случае мы, я думаю все будем стараться быстрее вас "подтянуть" в плане мастерства.

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Brevis
сообщение 13.5.2013, 17:31
Сообщение #9


Эксперт
*****

Группа: J1
Сообщений: 1701
Регистрация: 16.7.2011
Пользователь №: 3441



Цитата(Павел Шварев @ 13.5.2013, 17:21) *
Бревис, если у Вас есть серьезное желание заняться филогенией, то прошу рассмотреть мое предложение от нашего проекта вести вести филогенетическое древо своей гаплогруппы. Под "вести" я подразумеваю следующее -построить филогенетическое древо гаплогруппы, отслеживать новые гаплотипы, определять куда в древе они попадают, корректировать древо по появляющимся новым снипам.
В этом случае мы, я думаю все будем стараться быстрее вас "подтянуть" в плане мастерства.

Желание есть,предложение принимаю с радостью,но надо отметить,что мои практические навыки в этом деле на нулевом уровне.


--------------------
Ingush DNA Project http://www.familytreedna.com/public/Ingush...ection=yresults

--------------------
Y-DNA: J1
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Амиго
сообщение 27.12.2013, 21:49
Сообщение #10


Автохтон
**********

Группа: R1a, Магистры
Сообщений: 4408
Регистрация: 12.2.2010
Из: Bashkortostan
Пользователь №: 2713
Страница в ЖЖ:-



Цитата(Igor1961 @ 29.9.2012, 7:51) *
В обсуждении разных тем постоянно возникают вопросы, сколько лет разницы соответствует тому или иному числу мутаций, разделяющих гаплотипы. Все это несложно рассчитать, пользуясь известными формулами и скоростями мутаций, откалиброванными на десятках генеалогических линий. Однако, новички не всегда о них знают и порой берут цифры неизвестно откуда. Да и тем, кто практически работает с выборками гаплотипов, не всегда удобно рыться в первых статьях А.А. Клёсова и Д.С. Адамова в поисках нужной цифры и таблицы пересчета.

Для удобства, предлагаю таблицу, в которой выписаны промежутки времени, соответствующие целому числу мутаций на гаплотип. Данные приведены для 4-х стандартных форматов, что чаще всего используются: 25, 37, 67 и 111 маркеров. При количестве мутаций, приближающемся к 1-й на 1 маркер, картина мутаций в стандартных панелях начинает отклоняться от модели свободных случайных блужданий, на которой основаны как квадратичный, так и линейный методы. Это приводит к искажениям, а потому из таблицы исключены значения, попадающие в эту область. При таком масштабе датировок следует работать с медленными панелями.

ТАБЛИЦА


Спасибо!

Поскольку автор этой таблицы не указан, по умолчанию будем считать что это таблица Игоря.


--------------------
Amigo

База данных У-ДНК Soraman http://suyun.info/index.php?LANG=ENG&p=b

Если что буду общаться на http://nations.unoforum.pro/

Наш сайт по этногеномике suyun.info

ЭИ Проект ''Suyun'' на сайте Томаса Кранна https://www.yseq.net/group_alleles.php?gid=70

Если вы новичок и не знаете какая у вас ветка, и что вам дальше заказывать, то см. тут.

Matches * Матчи http://www.familytreedna.com/public/Bashqo...ection=yresults
Nations * Народы http://www.familytreedna.com/public/suyun/...ection=yresults
Clans * Кланы и фамилии http://www.familytreedna.com/public/people...ection=yresults

The descendants of the ancient tribes * Потомки древних племён http://www.familytreedna.com/public/TuranS...ection=yresults

Среди цветов вишня, среди людей самураи...

--------------------
Y-DNA: R1a.Z2123. SUR250+, SUR22+
mt-DNA: H
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Дмитрий Егоров
сообщение 22.9.2014, 20:10
Сообщение #11


Участник
**

Группа:  R1a
Сообщений: 246
Регистрация: 2.5.2012
Пользователь №: 3804



Я правельно понимаю эту таблицу или нет?
Для 2х гаплотипов по 37 маркеров, с 3мя мутациями, время до общего предка примерно 875 лет.


--------------------
Ysearch - DJ6AH
Russian Empire Project
R1a Project
- Kit No: 229591

--------------------
Y-DNA: R1a.M458.L260+
mt-DNA: Т2(16126C,16294T,16296T,16304C,16519C, 73G,146C,263G,309.1C,315.1C )
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Боромир
сообщение 23.9.2014, 18:55
Сообщение #12


Эксперт
*****

Группа: R1a, Магистры
Сообщений: 1469
Регистрация: 2.4.2009
Из: Бостон
Пользователь №: 1923



Цитата(Дмитрий Егоров @ 22.9.2014, 13:10) *
Я правельно понимаю эту таблицу или нет?
Для 2х гаплотипов по 37 маркеров, с 3мя мутациями, время до общего предка примерно 875 лет.

Не до конца. Посмотрите оригинальный линк на таблицу с последующим комментарием Анатолия Алексеевича к ней. 875 надо дополнительно разделить на два и окончательный ответ 875/2=438 +/- "очень много" smile.gif.


--------------------
FTDNA Kit No. 143121, Russian Empire Project
Ysearch/mitosearch URQ2X


--------------------
Y-DNA: R1a-Z280 >CTS1211>CTS3402>Y33>CTS8816>Y2902>Y2910>L458* Восточно-Карпатская (Волго-Карпатская ветвь)
mt-DNA: H* (16085T, 16189C, 16519C, 263G, 315.1C, 522-, 523-)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Atly
сообщение 24.9.2014, 15:33
Сообщение #13


Новичок
*

Группа:  R1a
Сообщений: 68
Регистрация: 11.5.2013
Пользователь №: 4123



294587
290827
https://www.familytreedna.com/public/KBalka...ection=yresults

22 мутации разделяют два гаплотипа из R1a_Z2123_YP450 - это по таблице 5450/2= 2700 лет до общего предка.
С учетом многошаговых мутаций (20 мутаций) 4875/2=2400 лет

Считается, что возраст ветки R1a_Z2123_YP450 - 1800 лет, что меньше на 600 лет времени жизни общего предка двух гаплотипов.

Что здесь не так?


--------------------
Y-DNA: R1a.Z2123.CTS1806+
mt-DNA: U1b
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Igor1961
сообщение 24.9.2014, 15:53
Сообщение #14


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 6929
Регистрация: 24.2.2009
Пользователь №: 1721



Цитата(Atly @ 24.9.2014, 21:33) *
Что здесь не так?

Всё так. Просто надо учитывать, что расчет дистанции между двумя 67-маркерными гаплотипами дает время с погрешностью ±25 %. Эта пара вполне вписывается в такой интервал. Кстати, по мере роста карачаевской ветви время до ее предка немного сдвинулось до 1900±250 лет назад.


--------------------
Y-DNA: R1a M458>Y2604>CTS11962>L1029>FGC66323>YP1703>YP6189>BY35612
mt-DNA: U3a2a (16343G, 16390A, 16519C, 73G, 150T, 200G, 263G, 315.1C)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Дмитрий Егоров
сообщение 24.9.2014, 17:20
Сообщение #15


Участник
**

Группа:  R1a
Сообщений: 246
Регистрация: 2.5.2012
Пользователь №: 3804



Цитата(Боромир @ 23.9.2014, 19:55) *
Цитата(Дмитрий Егоров @ 22.9.2014, 13:10) *

Не до конца.....
.........875/2=438 +/- "очень много" smile.gif.

Боромир, благодарю!
Цитата(Igor1961 @ 24.9.2014, 16:53) *
Цитата(Atly @ 24.9.2014, 21:33) *
Что здесь не так?

Всё так. Просто надо учитывать, что расчет дистанции между двумя 67-маркерными гаплотипами дает время с погрешностью ±25 %. Эта пара вполне вписывается в такой интервал. Кстати, по мере роста карачаевской ветви время до ее предка немного сдвинулось до 1900±250 лет назад.

Ещё такой вопросик. Вот эти +/- погрешности, для расчётов с разной длиной и количеством гаплотипов каково брать?



--------------------
Ysearch - DJ6AH
Russian Empire Project
R1a Project
- Kit No: 229591

--------------------
Y-DNA: R1a.M458.L260+
mt-DNA: Т2(16126C,16294T,16296T,16304C,16519C, 73G,146C,263G,309.1C,315.1C )
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Atly
сообщение 24.9.2014, 18:00
Сообщение #16


Новичок
*

Группа:  R1a
Сообщений: 68
Регистрация: 11.5.2013
Пользователь №: 4123



Цитата(Igor1961 @ 24.9.2014, 16:53) *
Всё так.


Спасибо.


Цитата(Igor1961 @ 24.9.2014, 16:53) *
Кстати, по мере роста карачаевской ветви время до ее предка немного сдвинулось до 1900±250 лет назад.

Вы имеете ввиду результат 297806 Sozinov или 1900±250 лет время жизни общего предка карачаевской ветви без его гаплотипа?


--------------------
Y-DNA: R1a.Z2123.CTS1806+
mt-DNA: U1b
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

Ответить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 23.10.2019, 8:47
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU