Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



 
Ответить в данную темуНачать новую тему
> A Worldwide Survey Of Human Male Demographic History, TMRCA 51 популяции по 65 маркерам
Nimissin
сообщение 13.10.2009, 6:49
Сообщение #1


Участник
**

Группа: Знатоки
Сообщений: 260
Регистрация: 1.8.2008
Из: г.Находка
Пользователь №: 625



Вышла большая работа с расчетами TMRCA 51 популяции по 37 снипам и 65 маркерам.
Объем выборки скромный: 590 гаплотипов.

We have investigated human male demographic history using 590 males from 51 populations in the HGDP-CEPH worldwide panel, typed with 37 Y-SNPs and 65 Y-STRs, and analyzed with the program BATWING. The general patterns we observe show a gradient from the oldest population TMRCAs and expansion times together with the largest effective population sizes in Africa, to the youngest times and smallest effective population sizes in the Americas. These parameters are significantly negatively correlated with distance from East Africa and the patterns are consistent with most other studies of human variation and history. In contrast, growth rate showed a weaker correlation in the opposite direction. Y lineage diversity and TMRCA also decrease with distance from East Africa, supporting a model of expansion with serial founder events starting from this source. A number of individual populations diverge from these general patterns, including previously-documented examples such as recent expansions of the Yoruba in Africa, Basques in Europe and Yakut in Northern Asia. However, some unexpected demographic histories were also found, including low growth rates in the Hazara and Kalash from Pakistan, and recent expansion of the Mozabites in North Africa.


Начал изучать. Статья в свободном доступе:
http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/.../msp243v1?rss=1


--------------------
Y-DNA: hg N1c1* M178+ P119- P21- P67-
mtDNA: hg C4b
Ysearch: 69ZKR
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.10.2009, 7:19
Сообщение #2


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(Nimissin @ 13.10.2009, 7:49) *
Объем выборки скромный: 590 гаплотипов.
Но все равно интересно взглянуть как там распределится по популяциям, а потом взглянуть на гаплотипы. Хорошо, что попгены переходят на длинные гаплотипы, можно будет зацепить этнические ветви гаплогрупп.
Дмитрий, сбросимся на статью?
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Nimissin
сообщение 13.10.2009, 8:06
Сообщение #3


Участник
**

Группа: Знатоки
Сообщений: 260
Регистрация: 1.8.2008
Из: г.Находка
Пользователь №: 625



Цитата(Павел Шварёв @ 13.10.2009, 14:19) *
Но все равно интересно взглянуть как там распределится по популяциям, а потом взглянуть на гаплотипы. Хорошо, что попгены переходят на длинные гаплотипы, можно будет зацепить этнические ветви гаплогрупп.
Дмитрий, сбросимся на статью?



Павел, эта статья в свободном доступе.


--------------------
Y-DNA: hg N1c1* M178+ P119- P21- P67-
mtDNA: hg C4b
Ysearch: 69ZKR
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 13.10.2009, 10:39
Сообщение #4


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11620
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Замечательно. smile.gif
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Nimissin
сообщение 13.10.2009, 16:03
Сообщение #5


Участник
**

Группа: Знатоки
Сообщений: 260
Регистрация: 1.8.2008
Из: г.Находка
Пользователь №: 625



Да-а-а уж! Удручающее впечатление.
TMRCA определяют по народам! За что боролись, как говорится, на то и
напоролись. Якуты молодые, баски молодые и т.д. Смотрю в приложение:
Из 18 якутов - 16 N1c1, из 16 басков - 14 R1b. Йоруба 10 чел - все относятся
к одной гаплогруппе. Тоже молодые. Чем больше гаплогрупп в составе народа -
тем он "старее".
Про "модернизацию" эволюционной скорости и говорить не хочется.
Выборки действительно маленькие.



--------------------
Y-DNA: hg N1c1* M178+ P119- P21- P67-
mtDNA: hg C4b
Ysearch: 69ZKR
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
aklyosov
сообщение 13.10.2009, 18:42
Сообщение #6


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 8858
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 526



C этими "популяционными генетиками" не соскучаешься. Смешали все гаплогруппы в одну кучу, и рассчитали "общего предка" по этнического признаку. Как заметил уважаемый Nimisin, результат зависит от гаплогруппного состава "народа", точнее, от выборки авторов. Две гаплогруппы - уже древность поперла, три - тем более древний народ. Евреев они не включили, видимо, по этим причинам. Они бы древнее африканцев оказались, у евреев как минимум 14 гаплогрупп. В неандертальцев бы ушли, и тем самым палестинцам бы козу показали, кто древнее.

В общем, статья, конечно, кошмар. Но что-то путное из нее вытащить можно, как авторы не старались сделать из нее полный мусор. Особенно, если знать заранее результат, то вытащить можно. Потому что можно их данные пересчитать на нормальные скорости мутации, по частям. Хотя тоже как по минному полю идти.

Вот - пример. Мы знаем, что у восточных славян (русские R1a1) время жизни общего предка 3800 лет назад. Смотрим в эту "смешную" статью, Таблица S4 (Supplementary), видим - они рассматривали всего 16 "русских", из них:

-- у всех 16 - С-R, то есть негры в выборку не попали, как, прочем, и J2,
-- все 16 - они же и F-R, то есть G тоже не попали (на самом деле один G есть, но авторы его в этой выборке проигнорировали),
-- один G (вспомнили все-таки),
-- у четырех - I,
-- у оставшихся 11 K-R,
-- у трех О, и у тех же трех N3, те же самые, то есть они О и N3 у русских объединили,
-- у оставшихся восьми - P-R,
-- один Q,
-- семеро R, и они же семеро R1, один R1b1, и он же R1b1b2,
-- остальные шесть - R1a, они же R1a1.

То есть некоторый толк от статьи уже есть, хотя 16 русских - это не статистика. Но даже здесь распределение примерно укладывается в норму - четверть I (на самом деле 22%), один R (6%, там на самом деле 5%), Q выше нормы, R1a1 занижены (должно быть 8, там 6). В общем, нормально.

Теперь смотрим времена до общего предка - для R1a1 - 9800 лет. Мы-то знаем, что на самом деле 4800 лет, то есть у авторов завышение в 2.04 раза. Проверяем по баскам (14 человек). У басков в статье - по всем гаплотруппам - R, R1, R1b1 и R1b1b2 (везде те же самые баски) - 12000 лет, то есть 5900 лет до предка. Это, конечно, не так, у них на самом деле 3700 лет, то есть ошибка у авторов на 220%. Это я рассчитывал не на 12, а на 750 гаплотипах R1b1b2.

Либо они R1a1 занизили, либо басков завысили, либо и то, и другое. Правда, для басков дали погрешность расчета, что при пересчете дает 3900-9000 лет для басков.

И так далее.

Возращаясь к русским, они дают для всего набора C-R (что у них то же самое, что F-R) 42800 лет до общего предка. Здесь и пересчитывать не имеет смысла, это по сути и по расчетам бессмыслица. Они, однако, на этом строят корреляцию с растоянием до Африки.

N3 (10 человек, Tat) у них имеют общего предка 10 тысяч лет назад, совместно с О (M214). То есть это гибрид N3O.

А вот - интересный "момент". Я рассчитал для африканских А и В общего предка 38 тысяч лет назад. То есть с их коффициентом должно быть 78 тысяч лет. Смотрим в их таблицу - африканское племя Сан (расчет по двум человекам) - 80.7 тысяч лет (особенно умиляет здесь семь десятых при погрешности от 51600 до 122900 лет, по их же данным). Как видно, сходимость неплохая. Правда, в другом месте те же Сан показали 98200, при погрешности между 67800 и 142000 лет.

В общем, мусор, конечно, но что-то вытащить можно. С трудом.

Занятно, что когда они считали возраст гаплогрупп по всему миру, у них получились примерно близкие данные:

А - 30 000 лет
BR - 64 000
B2 - 34 000
C-R - 60 000
DE - 52 000
D - 46 000
E - 49 000
E3 - 14 900
FR - 55 000
G - 35 000
H - 31 000, 28 000
I - 33 000
J2 - 31 000
KR - 52 000
L - 39 000
M - 31 000
N3 - 37 000
O - 47 000, 44 000
O3 - 39 500
PR - 49 000
Q - 35 000
R - 47 000
R1 - 44 000
R1a - 41 300
R1b1 - 40 600
R1b1b - 26 100
R1b1b2 - 35 400
R2 - 36 100

Несуразицы здесь заметны, не буду комментировать.


--------------------
Y-DNA: R1a-Z283
mt-DNA: H

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Clavis
сообщение 13.10.2009, 20:08
Сообщение #7


Активист
***

Группа: G
Сообщений: 482
Регистрация: 4.7.2008
Из: город Норильск
Пользователь №: 521



Забавно. Вспоминаю свою маленькую выборку на Однофамильцах (я курирую Семеновых и Пелиных). Оставим среди них только русских, будет тоже 16 человек.
R1a1 8 человек = 50%.
N1c 3 человека = 19%
Кажется, в моей маленькой выборке поболе сходства с большими выборками научных статей.


--------------------
Kit Number is 124854
Y+mito_search RK448
ydna.ru ID 3b276d
Y-ДНК: G2a3b1 (без SNP, по аналогам)
mito -ДНК: HV9 (ранее известная как HV3a)
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
aklyosov
сообщение 13.10.2009, 23:00
Сообщение #8


Легенда
************

Группа: R1a, Академики
Сообщений: 8858
Регистрация: 4.7.2008
Пользователь №: 526



На самом деле статья внесла бы хороший вклад в науку, если бы они просто опубликовали все 500+ гаплотипов и дали разводку по гаплогруппам всех перечисленных популяций. И всё.

Цитирований было бы выше крыши. Все бы использовали их гаплотипы, особенно по майя, биака, мбути и прочей экзотике. Правда, они сдуру (другого слова не подобрать) смешали майя с колумбийцами, чтобы набрать в сумме 4 человекa. Из этих четырех - в гаплогруппе Q все четверо, c возрастом 17200 лет в их системе, что даст где-то 5-8 тысяч лет. То есть индейцы, как и можно было предполагать. Сибиряки.


--------------------
Y-DNA: R1a-Z283
mt-DNA: H

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

Быстрый ответОтветить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 18.10.2019, 17:13
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU