Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



7 страниц V   1 2 3 > »   
Ответить в данную темуНачать новую тему
> Древо Q
Павел Шварев
сообщение 25.7.2008, 10:23
Сообщение #1


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Мы нашли члена рода Ашин!
Сегодня пришли данные по последней панели.
Скорее всего он реальный потомок последнего хазарского кагана, его гаплотип очень хорошо лег среди гаплотипов проекта Y-DNA Ашин.
Так как среди нас вряд ли появятся днк генеалоги из гаплогруппы Q, то я с чистой совестью, по поручению и под контролем потомка кагана начинаю строить древо гаплогруппы Q.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
сообщение 25.7.2008, 13:33
Сообщение #2


Знаток
****

Группа:  R1a
Сообщений: 636
Регистрация: 11.6.2008
Из: Астана. Казахстан
Пользователь №: 439



А откуда известно, что он потомок Ашина.
Можете рассказать как вы пришли к такому выводу



--------------------
ДНК-паспорт:
R1a1.
13 25 17 10 11 14 15 12 10 13 11 31

Ysearch ID: EWDFC
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
wertner
сообщение 25.7.2008, 15:27
Сообщение #3


Активист
***

Группа:  E
Сообщений: 323
Регистрация: 2.7.2008
Из: Казань<->Москва
Пользователь №: 505



Видимо близко к группе результатов "ASHINA-KHAN" в проекте ASHINA/BULANID ROYALTY AND NOBILITY (IMPERIAL CLAN) DNA. Ну, а причины почему эту группу относят к потомкам Ашины описаны на вкладке "Results" проекта.
Интересно насколько близко новый гаплотип к этой группе.


--------------------
Y-DNA: E1b1b1a2
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2, I2b1, R1b1b2a1a1
Мой предиктор Y-гаплогрупп (включая ветви R1a1a): файл для скачивания
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 25.7.2008, 17:22
Сообщение #4


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(wertner @ 25.7.2008, 15:27) *
Интересно насколько близко новый гаплотип к этой группе.
SJ5CN
Сижу во дворе с ноутбуком, ловлю вайфай, нужного материала под рукой нет.
Вертнер, благодарю за вклад в проводимую работу по Q.

В ysearch выудилось:
Q+Q1 = 315
Q1a1=0
Q1a2=2
Q1a3=110
Q1b=5 но все четверо носят одну фамилию Vick, может братья? unsure.gif
Переходим ко второму шагу, отсечение всех кто не сделал 67 маркеров, и выявлению дублей и близких родственников.

Итак, на 425 гаплотипов приходится всего 57 67маркерных, то есть 14% У R1a год назад этот показатель был 19%.
Между прочим, Россия сейчас зажигает по длинным подписям, у нас 90% заказывают длинные подписи!
Вот что значит построить древо гаплогруппы.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
asan-kaygy
сообщение 25.7.2008, 18:27
Сообщение #5


Знаток
****

Группа:  R1a
Сообщений: 636
Регистрация: 11.6.2008
Из: Астана. Казахстан
Пользователь №: 439



Цитата(wertner @ 25.7.2008, 15:27) *
Видимо близко к группе результатов "ASHINA-KHAN" в проекте ASHINA/BULANID ROYALTY AND NOBILITY (IMPERIAL CLAN) DNA. Ну, а причины почему эту группу относят к потомкам Ашины описаны на вкладке "Results" проекта.
Интересно насколько близко новый гаплотип к этой группе.

Как я помню каганы из рода Ашина не имели абсолютно никакого веса и хазарами правили еврейские беки (князья). каганы были марионетками в их руках. Не думаю, что эти люди это потомки Ашины. Последние правители из этого рода правили среди басмал и карлуков, по идее потомки должны были остаться в Тохаристане и Восточном Туркестане.


--------------------
ДНК-паспорт:
R1a1.
13 25 17 10 11 14 15 12 10 13 11 31

Ysearch ID: EWDFC
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 1:33
Сообщение #6


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2




Ну вот, два часа ночи. Готово первое приближение к 67 маркерному древу. Использовалась очищенная стодесяти гаплотипная выборка.
В районе модального жвака не наблюдается, но в центрах крупных ветвей имеютсмя многоугольники. sad.gif Завтра буду выстраивать древо со скоростями, и данная проблема должна рассосаться.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 26.7.2008, 5:36
Сообщение #7


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 1:33) *
Ну вот, два часа ночи. Готово первое приближение к 67 маркерному древу. Использовалась очищенная стодесяти гаплотипная выборка.
Уважаемый Читуай, а это не одно и то же лицо несколько раз, то, что слева бооольшой кружок. На 67Y-DNA я пока у отцов-детей не встречал полных аналогов.


Не перешлёте мне один гаплотип: "модальный всего дерева Q"?



--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 6:52
Сообщение #8


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Нет, не одно и то же. Вчера начал выявлять и устранять дубли, потом, уже ближе к завершению, заметил удивительную для меня вещь - оказывается попадались повторы гаплотипов или с разными номерами анализа FTDNA, или с разными первыми известными родоначальниками, причем, у некоторых разные фамилии!
Было уже поздно, поэтому пересматривать не стал, оставил только те дубли, которые выявились после обнаружения этих удивительных совпадений.

modal: 13 23 13 10 14 16 12 12 12 13 14 30 17 9 9 11 11 25 14 19 29 14 14 15 16 10 11 19 23 15 14 17 16 33 38 12 11 12 0 0 0 0 0 0 12 0 14 0 0 11 8 15 17 8 11 10 8 12 10 22 22 16 11 12 12 15 8 24 21 12 11 13 10 11 12 12
Но нужно не забывать, что модальный сети из выборки индивидуальных гаплотипов с ysearch не совсем является модальным древа. Нужно провести кластеризацию, а затем снова просчитать. Сейчас на модальный очень сильно влияют молодые суперветви, такие как ветвь Ашина.
Я полагаю, что они очень сильно оттягивают на себя модальный.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 26.7.2008, 7:58
Сообщение #9


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 6:52) *
оказывается попадались повторы гаплотипов или с разными номерами анализа FTDNA
Если разные номера FTDNA - вопросов нет.
Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 6:52) *
или с разными первыми известными родоначальниками, причем, у некоторых разные фамилии!
Обычно (практически всегда), при повторных гаплотипах, анализ делается в FTDNA, и, если там я нахожу лишь один результат, то остальные результаты по Ysearch выкидываю. Случаев 8 таких на 122 N с67Y-DNA.

Что заставляет одного и того же человека относить себя к разным предкам - это пусть специалисты с жанре медицины разбираются. blink.gif
Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 6:52) *
modal: 13 23 13 10 14 16 12 12 12 13 14 30 17 9 9 11 11 25 14 19 29 14 14 15 16 10 11 19 23 15 14 17 16 33 38 12 11 12 0 0 0 0 0 0 12 0 14 0 0 11 8 15 17 8 11 10 8 12 10 22 22 16 11 12 12 15 8 24 21 12 11 13 10 11 12 12
Большое спасибо.

Мне не для исследования Q, поэтому абсолютно точный модал не нужен. Вышего достаточно. Вот ещё бы модалы I1, I2, J1, J2, O, O3, R1a, R1b (а если есть, то и F и K) кто-нибудь подкинул бы, был бы очень благодарен. rolleyes.gif




--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 14:00
Сообщение #10


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(mouglley @ 26.7.2008, 8:58) *
Что заставляет одного и того же человека относить себя к разным предкам - это пусть специалисты с жанре медицины разбираются. blink.gif Большое спасибо.
А я почему-то вспомнил индийскую кино-масалу с ее вечно перепутанными младенцами. Ну ладно, в общем если кто то дважды влез к нам в выборку это уже не имеет большого значения, начинаем кластиризироваться. Сегодня ввел поправки на веса мутации и простроил заново сеть, но многоугольников почему-то не убавилось, может я допустил какую-то ошибку?
Уважаемый Вернер, правильно ли я сделал?
1. Преобразовал значения в файле статистики, вычислил "обратные" проценты. Например, если самая частая мутация встречается 15 я принял это за 1% если всего один раз, то за 99.
2. Вставил полученные значения в файл "...out"
3. По полученному файлу прорисовал сеть.

В новой версии Нетворка я работаю первый раз, возможно что-то сделал не так. В 4.3 алгоритм учета весов был другим, и там у меня все было ОК, учет весов приводил к распутыванию сети.


Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
wertner
сообщение 26.7.2008, 14:07
Сообщение #11


Активист
***

Группа:  E
Сообщений: 323
Регистрация: 2.7.2008
Из: Казань<->Москва
Пользователь №: 505



Файл .out - это уже посчитанная информация о всех вершинах и ребрах сети (можно их называть точками и отрезками сети). Добавление туда весов ничего не меняет (даже длины ребер, если не ошибаюсь).
Веса имеет смысл вставлять только во вторую строчку файла .ych, чтобы они участвовали в формировании сети.


--------------------
Y-DNA: E1b1b1a2
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2, I2b1, R1b1b2a1a1
Мой предиктор Y-гаплогрупп (включая ветви R1a1a): файл для скачивания
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 14:27
Сообщение #12


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Начинаем разбираться с молодыми и многочисленными ветвями. Начнем с предолагаемого легендарного рода Ашина.

Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 14:40
Сообщение #13


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Цитата(wertner @ 26.7.2008, 15:07) *
Веса имеет смысл вставлять только во вторую строчку файла .ych, чтобы они участвовали в формировании сети.

Спасибо biggrin.gif
Буду возвращаться и переделывать.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 16:05
Сообщение #14


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Вертнер, я тут вспомнил одну вещь. Файлы ych очень капризные, не там пробел или ещё какая неточность и полностью отказываются работать.
Может вставить во вторую строчку ... .fdi?
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 26.7.2008, 19:51
Сообщение #15


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 16:05) *
Может вставить во вторую строчку ... .fdi?
Не советую. Расчёты производятся по данным их ych. fdi - только результаты продолжительных вычислений (нескольколько тысяч человеко-часов), готовых только для построения.

А к ych привыкните в два счёта. Те первые две строчки, которые я забил сразу после появления коэффициентов уважаемого wertner, я переношу с места на место без изменения вот уже несколько месяцев. Меняются только индивиды (все остальные строки).




--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 19:56
Сообщение #16


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Блин..., ашипся буквами.
Не fdi, а rdf, который аналогичен по функции ych.
Уважаемый mouglley, а в каком виде записывается в ych строчка с весами, через пробел?те

Мне кажется, что по хорошим делам на постоянную основу надо зашивать универсальные относительные скоростиполученные Вертнером на основе многогаплогрупной выборки. Но я пока этого не делаю так как у меня выборка маленькая икластеризацию я ещё не делал, должно все рассосаться и без универсальных весов Вернера.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
mouglley
сообщение 26.7.2008, 20:01
Сообщение #17


Магистр
******

Группа: N
Сообщений: 2194
Регистрация: 8.7.2008
Из: Москва
Пользователь №: 547



Цитата(Читуай @ 26.7.2008, 20:56) *
Уважаемый mouglley, а в каком виде записывается в ych строчка с весами, через пробел?

Привожу начало первых двух строк. далее заполните сами:
Цитата
D393,D390,D19/394,
10,6,7,


В конче строк запятой нет.



--------------------
Y-DNA: [/color][color="#ff00ff"]N1с1*; M214(rs2032674); P188(rs16980610); P192(rs16980641); P193(rs16980426); P194(rs16980363); P195(rs2196155); M231(rs9341278); LLY22g; Tat(M46, rs34442126)+; P105+; M178(i3000046)+; P298; P21-; P67-; P119-
YSearch: KABEC
FamilyTree: 106620
CCR5 [/size][size="1"]del32
-normal
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 26.7.2008, 20:09
Сообщение #18


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Отлично, так и запишем.

А в rdf строчка с весами штатная
Имеет вид:

;1.0
D393aa;D393ab;D390aa;D390ab;D390ac;D394aa;D391aa;D391ab;D385aaa;D385aab;D385aac;
D385aad;D385aae;D385aaf;D385baa;D385bab;D385bac;D385bad;D385bae;D385baf;D385bag;
D
426aa;D388aa;D439aa;D439ab;D439ac;D389-1aa;D389-1ab;D392aa;D392ab;D392ac;D392ad;D389Baa;D389Bab;D389Bac;D458aa;D458ab;D458ac;D45
8ad;D459aaa;D459aab;D459baa;D454aa;D454ab;D454ac;D447aa;D447ab;D447ac;D447ad;D44
7
ae;D437aa;D437ab;D448aa;D448ab;D448ac;D448ad;D448ae;D448af;D448ag;D448ah;D448ai;
D
448aj;D448ak;D448al;D448am;D448an;D448ao;D448ap;D448aq;D448ar;D448as;D448at;D448
a
u;D449aa;D449ab;D449ac;D449ad;D449ae;D464aaa;D464aab;D464aac;D464baa;D464bab;D46
4
bac;D464bad;D464bae;D464baf;D464caa;D464cab;D464cac;D464cad;D464cae;D464caf;D464
c
ag;D464daa;D464dab;D464dac;D464dad;D464dae;D464daf;D460aa;D460ab;G-H4aa;G-H4ab;G-H4ac;G-H4ad;YCA-aaa;YCA-aab;YCA-aac;YCA-baa;YCA-bab;YCA-bac;YCA-bad;D456aa;D456ab;D456ac;D607aa;D607ab;D607ac;D607ad;D607ae;D576aa;D576ab;D576ac
;D576ad;D570aa;D570ab;D570ac;D570ad;D570ae;D570af;CDYaaa;CDYaab;CDYaac;CDYaad;CD
Y
aae;CDYaaf;CDYaag;CDYbaa;CDYbab;CDYbac;CDYbad;CDYbae;CDYbaf;CDYbag;CDYbah;CDYbai
;
D442aa;D442ab;D442ac;D442ad;D438aa;D438ab;D438ac;D425aa;D425ab;D425ac;D425ad;D42
5
ae;D425af;D425ag;D425ah;D425ai;D425aj;D425ak;D425al;D425am;D444aa;D444ab;D444ac;
D
444ad;D446aa;D446ab;D446ac;D531aa;D531ab;D5S1aaa;D5S1aab;D5S1baa;D5S1bab;D5S1bac
;
D5S1bad;D590aa;D537aa;D537ab;D537ac;D641aa;D641ab;D641ac;D06S1aa;D06S1ab;D06S1ac
;
D06S1ad;D06S1ae;D511aa;D511ab;D511ac;D413aaa;D413aab;D413aac;D413aad;D413aae;D41
3
baa;D413bab;D413bac;D413bad;D557aa;D557ab;D557ac;D557ad;D557ae;D557af;D594aa;D59
4
ab;D436aa;D534aa;D534ab;D534ac;D534ad;D450aa;D481aa;D481ab;D481ac;D481ad;D481ae;
D
481af;D481ag;D520aa;D520ab;D520ac;D520ad;D520ae;D520af;D520ag;D617aa;D617ab;D617
a
c;D617ad;D568aa;D568ab;D487aa;D487ab;D487ac;D572aa;D572ab;D572ac;D640aa;D492aa;D
5
65aa;D565ab;D565ac;
10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;10;1
0
;10;10;10;10;10;10;10;10;

>modal;1;
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
wertner
сообщение 26.7.2008, 22:06
Сообщение #19


Активист
***

Группа:  E
Сообщений: 323
Регистрация: 2.7.2008
Из: Казань<->Москва
Пользователь №: 505



Я уверен, что разницы, где указывать веса, в rdf или ych нет. В этом отношении файлы одинаково капризные. Но сам rdf не пользовался (только ych). Знаю, что rdf это перевод ych в бинарный формат, но это все.


--------------------
Y-DNA: E1b1b1a2
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2, I2b1, R1b1b2a1a1
Мой предиктор Y-гаплогрупп (включая ветви R1a1a): файл для скачивания
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 27.7.2008, 12:13
Сообщение #20


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11619
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2




Род Ашина под №8, он самый многочисленный из молодых, поэтому ничего удивительного, что предковая линия в данной сети начинается сразу от модального гаплотипа, это говорит о том что кластер Ашин "оттянул" на себя модальный гаплотип. Сеть хоть уже и похожа на древо, но она ещё очень далека от реального генеалогического древа гнаплогруппы. Чтобы приблизить ее к реальности, нужно провести кластеризацию молодых ветвей, то есть выявить их, и заменить одним гаплотипом. Новый просчет сети где не будет влияния молодых супер ветвей должно дать нам более адекватное реальности древо.


Учитывая несовершенство методов кладистики и филогении, можно ожидать от программы ошибок.
Беспокойство вызывают гаплотипы, которые, будучи отнесенными программой к ветви тем не менее, очень сильно отрываются от основной, компактно расположенной группы гаплотипов.
Для проверки на причастность гаплотипов к исследуемой ветви
применим мтод Читуая (Шварева) основанный на том, что неверно омещенные в род хорошо высвечиваются в таблице TMRCA.
Итак:


Прикрасно видно, что гаплотипы Q25, Q1-41, Q1-43, Q30 являются посторонними ошибочно включенными в род Ашина.
Во всяком случае, начало линии этих гаплотипов должно быть за пределами ТМRСА (первого общего предка рода) жившего 40 поколений назад.
QB хоть и вызывал своей выдающщестью подозрения, но лег в таблицу ТМRСА как родной.


Выборочно проверил результаты идентификации подозрительных гаплотипов методом Вернера, вроде все подтвердилось.
http://www.rodstvo.ru/forum/index.php?show...;st=0#entry1032
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

7 страниц V   1 2 3 > » 
Быстрый ответОтветить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 22.8.2019, 1:46
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU