Главная   |   Древние Рода   |   ДНК тесты   |   ДОК генеалогия             VK  |  OK  |  FB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )



 
Ответить в данную темуНачать новую тему
> Генетический мусор скрывал кодирующий участок!, Открытия меняющие теоретические представления о ДНК-генеалогии
Павел Шварев
сообщение 8.7.2010, 8:15
Сообщение #1


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11567
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Генетический мусор скрывал кодирующий участок

Генетикам придется пересматривать механизмы работы ДНК. Одна из последовательностей, которая относилась к некодирующим (мусорным) участкам, оказалась замешана в синтез одного из важнейших белков человеческого организма.


Большая часть человеческого генома состоит из некодирующей или, как ее иначе называют, мусорной ДНК. Эта часть нуклеотидной последовательности присутствует в хромосомах, но не несет никакой информации. При считывании «генетического шифра» специальные ферменты вырезают некодирующие участки из первичной копии ДНК. Далее уже другие ферменты склеивают значимые последовательности нуклеотидов в мРНК, с которой как с матрицы (из-за чего она и получила название матричной) и синтезируются белки.

Как правило, такие некодирующие последовательности (интроны) располагаются стационарно — между функциональными участками ДНК (экзонами). Но есть и мобильные некодирующие нуклеотиды, которые перемещаются по геному и периодически вклиниваются в гены, вызывая хромосомные перестройки и мутации.

Инфицированный геном

Геном человека более чем на 40% состоит из различных мобильных генетических последовательностей — ретротранспозонов. Причем среди генетических путешественников есть и эндогенные (внутренние) ретровирусы, которые заражают человеческую ДНК. Они хранят информацию в РНК и вопреки привычной схеме ДНК → РНК → белок ретровирусы передают генетическую информацию в обратном направлении. Вирусная ДНК синтезируется на основе РНК и после встраивается в геном человека. Таким способом вирусная ДНК получает «вид на жительство» в генетическом сообществе и вместе с человеческими генами передается из поколения в поколение.

По словам ученых, не стоит пугаться таких вирусов — около 8% человеческого генома состоит из «заразной» ДНК. Да и подхватил человек эту генетическую «инфекцию» достаточно давно — десятки миллионов лет назад и до сих пор жив. Более того, возможно, что именно благодаря таким генетическим вирусам произошли наиболее значимые эволюционные изменения и преобразования.

Оставшиеся 32% генетического мобильного мусора приходятся на три «семейства» нуклеотидных последовательностей различной длины и с различной степенью повторов — LINE, SINE и LTR. Ученые уверены, что большинство ретротранспозонов как минимум не приносят никакой пользы человеческому геному, а в некоторых случаях еще и причиняют вред. Одним словом, большая часть генетического мусора по праву называется «мусором». Эти предположения утвердились еще больше после того, как Малон (Malone CD) и Хэннон (Hannon GJ) в 2009 году опубликовали статью Small RNAs as guardians of the genome в журнале Cell. По результатам исследования они описали молекулярный механизм, с помощью которого «хозяйская» клетка подавляет любые попытки ретротранспозонов проявить активность.

Функциональный мусор

Тем не менее многие генетические вирусы и некодирующие последовательности все-таки оказывают влияние на синтез мРНК и белка соответственно. Многие из них расположены в ничего не значащих (интронных) участках ДНК на расстоянии до нескольких сотен тысяч оснований от гена, с которым они функционально связаны. То есть сразу-то может быть и непонятно, что «мусор» в дальнем уголке хромосомы может каким-либо способом «держаться на связи» с функциональным геном.

Одна из распространенных «мусорных» мобильных нуклеотидных последовательностей — длинный концевой повтор эндогенного ретровируса-9 (ERV-9 LTRs). Этот мобильный генетический элемент был неоднократно замечен в связи с рядом гематологических заболеваний. Он располагается на расстоянии 40−70 тыс. нуклеотидных оснований от генов, которые кодируют фетальную и взрослую формы белка глобина. Интересно то, что ERV-9 LTR взаимодействует не с одним, а почти с десятью человеческими генами, которые находятся неподалеку от генов белка глобина

В геноме человека и шимпанзе ERV-9 LTR проявляет видимое влияние на функциональную активность эмбриональных и кровяных стволовых клеток. Исследователи из медицинского колледжа Джорджии (Medical College of Georgia) решили проверить, какую роль играет ERV-9 LTR в синтезе «кровяного» белка. Для этого ученые вырастили трансгенных мышей, в геном которых был встроен локус длиной 100 000 пар оснований, содержащий гены белка глобина. Геном трансгенных мышей из экспериментальной группы содержал генетический мусор, а геном мышей из контрольной группы ученые «очистили» от ERV-9 LTR.

И все-таки не хлам

Ученые исследовали хроматин и белки, которые участвуют в реализации генетической информации. Оказалось, что ERV-9 LTR не просто регулирует работу генов фетального и взрослого глобина, а «включает» экспрессию этих генов на конкурентной основе. Исследователи описали молекулярный механизм, при помощи которого ERV-9 LTR создает конкуренцию между двумя видами глобина.

В отсутствие ERV-9 LTR в клетке заметно снижается уровень всех белков, которые участвуют в синтезе взрослого глобина. Известно, что включение в работу генов взрослого глобина автоматически выключает гены фетального глобина и наоборот. В эксперименте ученые еще раз подтвердили это и показали, что основной целью ERV-9 LTR становятся гены взрослого глобина. То есть именно он заставляет гемопоэтические клетки реализовывать закодированную информацию и синтезировать белок для взрослого гемоглобина.

Биологи также проследили за ERV-9 LTR в стволовых клетках крови и в эмбриональных клетках. Оказалось, что наиболее активно ERV-9 LTR проявляется в эритроидных стволовых клетках.

Основываясь на полученных данных, генетики пришли к выводу, что из 4000 копий ERV-9 LTR, которые присутствуют в геноме человека, хотя бы несколько последовательностей не засоряют ДНК, а помогают клеткам выполнять свои функции и дарят некоторые преимущества в конкурентном синтезе белков. Так что теперь генетикам придется пересматривать мусорные части генома, чтобы проверить, не участвуют ли они в уже вроде бы изученных механизмах работы тех или иных генов.

Подробные результаты исследования опубликованы в статье Long-range function of an intergenetic retrotransposon в журнале PNAS.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 9.7.2010, 15:33
Сообщение #2


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11567
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Странно, такое эпохальное событие, а у сообщества никакой реакции.
Неужели никто кроме меня не улавливает его значимость, или я экстрасенс?




Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
Павел Шварев
сообщение 9.7.2010, 15:41
Сообщение #3


Легенда
************

Группа: Главные администраторы
Сообщений: 11567
Регистрация: 22.4.2008
Из: порт Находка
Пользователь №: 2



Сегодня появилась еще одна свежая информация для размышлений о неизвестном влиянии Y хромосомы в общем и, возможно, ее "мусорных" участков на мейоз и кроссинговер:


Гены отца отвечают за пол ребенка

Многие женщины радуются рождению первенца в независимости от его пола. Со вторым ребенком приходит "аппетит" и поэтому молодые родители больше интересуются возможностью спланировать пол ребенка. Есть много теорий о том, что является решающим при зарождении новой жизни. Ученые ломают над этим голову не одно десятилетие.



Новейшие исследования и статистика показала, что, возможно, решающим является генетический фонд отца ребенка. Склонность к производству потомства определенного пола отец будущего ребенка наследует от своих родителей! Это недавно подтвердили ученые, произведя обширные исследования пар, ожидающих ребенка. Ученые проанализировали 927 семей, а также их генеалогические деревья по возможности вплоть до 1600 года. Таким образом в статистику вошли более 500 000 человек.

Результаты ошеломили. Оказывается, что рождение мальчика можно скорей всего ожидать у будущих отцов, которые сами имеют много братьев. Отцом девочки с большей вероятностью станет тот, у которого больше сестер, чем братьев. По результатам исследований ученые теперь более склонны считать, что генетическое предрасположение играет большую роль в вопросе о поле будущего ребенка.

Этим например, объясняется большое количество мальчиков, рожденных в годы после войны. Если в семье было много мальчиков, то вероятность, что один из них вернется с войны становилась выше, чем в семьях с один сыном. Таким образом, именно мужчины с предрасположенностью к зачатию мальчиков преобладали в послевоенные годы и таким образом, способствовали росту рождения детей мужского пола.

http://www.babyplan.ru/biblioteka/planirov...-o-pole-rebenka

Статья популярная, но в ней сообщается об очень важной работе, поэтому буду благодарен тому, кто найдет прямую ссылку на эту работу.
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
bashqort
сообщение 4.2.2018, 22:10
Сообщение #4


Активист
***

Группа:  R1a
Сообщений: 409
Регистрация: 30.11.2008
Из: г. Кыштым, Челяб. обл.
Пользователь №: 1275



Цитата(Павел Шварёв @ 9.7.2010, 17:33) *
Странно, такое эпохальное событие, а у сообщества никакой реакции.
Неужели никто кроме меня не улавливает его значимость, или я экстрасенс?
Работа с ДНК в живых организмах давно должна была навести на мысль, что геном спроектирован не случайно и не Отбором, но неким Высшим Существом, с возможностью мутирования генотипа во имя приспособляемости фенотипа...


--------------------
Y-12: 13 25 16 11 11-15 12 12 10 13 11 30). "Башҡортмон, бәкәтинмен, насар кеше түгелмен!"

--------------------
Y-DNA: R1a.Z280.CTS3402+
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
ВикторияС
сообщение 6.2.2018, 16:17
Сообщение #5


Участник
**

Группа: XX
Сообщений: 213
Регистрация: 14.7.2011
Из: Ростов-на-Дону
Пользователь №: 3438



Жалко денег потраченных на такие горе-исследования.

Еще в советское время в журнале "Химия и жизнь" была опубликована статья о том, что есть какой-то механизм поддержания равновесия полов у живородящих. В качестве яркого примера приведена ситуация, с которой сталкиваются начинающие аквариумисты. Они заполняют аквариум красивыми рыбками, а это почти всегда самцы. А потом сталкиваются с ситуацией, когда в следующем поколении оказываются в подавляющем большинстве "серенькие" самки.

Авто статьи делает совершенно очевидное логическое заключение, которое вообще не требует никаких экспериментальных обоснований. Если пол потомства определяется мужской особью, то поддержание равновесия полов определяется свойствами заложенными в мужской особи. А уж каким способом мужские особи "диагностируют" дисбаланс окружающей среды можно догадаться без всяких дорогостоящих исследований.

Пример из реальной жизни послевоенных поколений. В семье, где после войны родилось 5-ть сыновей и одна дочь, позже стало 6-ть внуков и 5-ть внучек. "Перевес" внуков +1 за счет единственной дочери)).
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение
bashqort
сообщение 7.2.2018, 21:21
Сообщение #6


Активист
***

Группа:  R1a
Сообщений: 409
Регистрация: 30.11.2008
Из: г. Кыштым, Челяб. обл.
Пользователь №: 1275



Цитата(ВикторияС @ 6.2.2018, 18:17) *
Жалко денег потраченных на такие горе-исследования.

Еще в советское время в журнале "Химия и жизнь" была опубликована статья о том, что есть какой-то механизм поддержания равновесия полов у живородящих. В качестве яркого примера приведена ситуация, с которой сталкиваются начинающие аквариумисты. Они заполняют аквариум красивыми рыбками, а это почти всегда самцы. А потом сталкиваются с ситуацией, когда в следующем поколении оказываются в подавляющем большинстве "серенькие" самки.

Авто статьи делает совершенно очевидное логическое заключение, которое вообще не требует никаких экспериментальных обоснований. Если пол потомства определяется мужской особью, то поддержание равновесия полов определяется свойствами заложенными в мужской особи. А уж каким способом мужские особи "диагностируют" дисбаланс окружающей среды можно догадаться без всяких дорогостоящих исследований.

Пример из реальной жизни послевоенных поколений. В семье, где после войны родилось 5-ть сыновей и одна дочь, позже стало 6-ть внуков и 5-ть внучек. "Перевес" внуков +1 за счет единственной дочери)).
Жалко ещё то, что читаешь некоторые современные палеогенетические статьи, ожидаешь данных - а они не приводятся, сразу становится понятным, для кого написаны...


--------------------
Y-12: 13 25 16 11 11-15 12 12 10 13 11 30). "Башҡортмон, бәкәтинмен, насар кеше түгелмен!"

--------------------
Y-DNA: R1a.Z280.CTS3402+
Перейти в начало страницы
 
+Цитировать сообщение

Ответить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 

              Mantlet IPB skin Designed by Fisana, IPBskins.ru
RSS Текстовая версия Сейчас: 24.4.2018, 15:47
 
     




Генеалогический сайт Рунета Сайт Всероссийского Генеалогического Древа Генеалогическая сеть Анализ фамилий Cайт рода R1a Краеведческий сайт Чеченский ДНК проект


© 2004-2015 RODSTVO.RU