Помощь - Поиск - Пользователи - Календарь
Полная версия этой страницы: Обновленное Генеалогическое Дерево Гаплoгрупы A И Современного Человека.
Rodstvo.ru > Y-гаплогруппы (мужские линии) > Рода A и B
Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6
Stanislaw
Обновленное генеалогическое дерево гаплoгрупы A и современного человека.



или в pdf.
http://www.tropie.tarnow.opoka.org.pl/adam_root2012.pdf

Во вертикали А0 учли SNPs:
Jones, Dorsey, Simms, Boon и "Bakola" (по Cruciani).
Igor1961
Все логично. И чем оно принципиально отличается от дерева, построенного по 22-маркерной панели STR?

http://www.rodstvo.ru/forum/index.php?act=...post&id=951

Топология одна и та же, при этом дерево STR дает более аккуратные датировки.
aklyosov
Цитата(Stanislaw @ 7.7.2012, 6:47) *
Обновленное генеалогическое дерево гагаплoгрупы A и современного человека.


Нормальное дерево, мы с ним давно работаем. Только это дерево не "гаплогруппы А и современного человека", там все мутации получены от современных людей. И там не "гаплогруппа А", а серия гаплогрупп. Остальное все верно:-))

Но есть вопросы:

1. Кто конкретно имел именно гаплогруппу А1, имя?

2. Кто конкретно имел гаплогруппу А1b, имя?

3. Если таких не было, на каком основании разделены А1 и А1b?

4. Почему М91 в ВТ, а не в левой ветви? Для ответа посмотрите на предковую последовательность снипа и на ту же в ВТ и в левой ветви. Впрочем,в списке ISOGG вы его не найдете, он удобно пропущен.

Люда
Да, отличий практически никаких. Я увидела из основных - Р305 и L986 переместились в А1. Я об этом писала еще 24.4 и 9.5.2012
Сообщение #187
...
3) Не понимаю, почему Р305 снип А0, по-моему он должен быть в А1.
4) Не вижу в Табл. L986. На схеме он в А0, а должен быть в А1 (найден в А0 -"G", у шимпанзе "А").

Бедный Перри, он так и остался один.
Люда
P.S. Присмотрелась, внутри А0 перетасовались группы. Почему-то L1005 cтал снипом А1, хотя у шимп. и чел.последовательности в базе данных в этой позиции одинаковый нуклеотид - А.
aklyosov
Цитата(Люда @ 7.7.2012, 15:27) *
Да, отличий практически никаких. Я увидела из основных - Р305 и L986 переместились в А1.


Да, дерево уже подправлено. P305 у них еще совсем недавно был в А0, теперь уже в А1. Наша критика возымела действие. То же и с L986.

Надеюсь, получу ответ на свои вопросы выше.

Занятно, что "Адам" заметно постарел. Интересно. как теперь адепты ISOGG определяют его возраст.

Еще интересно то, что неандертальны не были чернокожими, как и неафриканцы (альфа-гаплогруппа). То есть при расхождении предков неандертальцев и хомо сапиенс обе линии были нечернокожими, и обе были не в Африке.

А вот А0 были, видимо, чернокожими. То есть это какая-то параллельная линия, которая идет даже древнее неандертальцев.

Еще занятно то, что бушмены (гаплогруппа В, как я понимаю), тоже нечернокожие.
Igor1961
Цитата(aklyosov @ 8.7.2012, 8:11) *
Еще занятно то, что бушмены (гаплогруппа В, как я понимаю), тоже нечернокожие.

Как раз среди бушменов гаплогруппа В встречается относительно редко. В последней по времени статье T. Naidoo et al. Development of a single base extension method to resolve Y chromosome haplogroups in sub-Saharan African populations Investig Genet. 2010; 1: 6 есть статистика по 183 бушменам Южной Африки (Table 3). Детали сбора образцов и племенная принадлежность их носителей не уточняются, но, исходя из современной численности этого народа (около 100 тыс. человек), такая выборка соответствует примерно одному образцу на 275 человек. То есть, покрытие очень плотное.

Из этих 183 человек 52 (28,4 %) дали положительный тест на снип М51. Это A1b1b2a в текущей версии ISOGG. К ним можно добавить носителей снипов М14 (A1b1a1a) - 5 чел., M114 (A1b1a1a1a) - 8 чел., и P28 (A1b1a1a1b) - 16 чел. Итого, представители гаплогрупп, объединенных под A1b1, собирают 44.3 % бушменов из выборки. У их ближайших соседей - банту Южной Африки, в этом же исследовании нашли 5 % (17 из 343) представителей гаплогруппы A1b1b2a. Очевидно, следствие метисации и ассимиляции, что, несомненно, имела место за долгое время соседства. Достаточно взглянуть на портрет Н. Манделы,
коса (xhosa, первый звук - щелчок) по национальности.

На втором месте идут различные субклады, нисходящие к E1b1a: М2 (E1b1a) - 24 чел., M58 (E1b1a1a1a) - 2 чел., M154 (E1b1a1a1g1c) - 2 чел., М191 (E1b1a1a1f1a) - 14 чел. Все вместе они набирают 23,0 % от выборки. С большой долей уверенности происхождение этих линий можно связать с метисацией бушменов окружавшими их, и намного более превосходящими по численности банту. Среди них этот же набор снипов дал 66 %.

На третьем - 29 человек (15,8 %) со снипом M35. Это гаплогруппа E1b1b1, характерная для жителей Средиземноморья и Африканского Рога, но весьма редкая в субсахарской Африке (1,5 % у банту Южной Африки в том же исследовании).

Лишь затем следуют 13 человек (7,1 %) со снипом Р6 (B2b1), к которым примыкают обладатели снипов M112 (B2b*) - 2 чел., и Р8 (B2b4a) - 5 чел. Итого получается 10,9 % представителей гаплогруппы B2b, практически отсутствующей в выборке южноафриканских банту (1 из 343). Среди последних с частотой 16 % встречается другой субклад - B2a1a (M152).

Из оставшиеся 10-ти человек 6 или 7 - явные потомки европейских поселенцев из гаплогрупп I (M170) - 1, R1a1a (M198) - 2, и R1b (M343) - 3. 300 лет совместного проживания и распространенная практика бурских фермеров брать себе наложниц из местного населения не могли не сказаться. Один носитель снипа M34 (E1b1b1b2a1) может, в принципе, оказаться как потомком белого иммигранта, так и одним из членов ветви, маркированной М35.

Наконец, трое - представители гаплогруппы Е2, встречающейс с частотой 10,2 % у южноафриканских банту. Очевидно, от последних и досталась.

Итого, специфичечески койсанскими линиями в этой выборке можно назвать A1b1, B2b и E1b1b1, которые вместе собирают 71 % выборки южноафриканских бушменов. Последняя группа дала отрицательные результаты по нисходящим снипам M78 (E1b1b1a1), M148 (E1b1b1a1c1), M81 (E1b1b1b1a), M107 (E1b1b1b1a1 - private), M165 (E1b1b1b1a2a - private), M123 (E1b1b1b2a), M34 (E1b1b1b2a1), M136 (E1b1b1b2a1a1) и M281 (E1b1b2), что уводит ее общего предка с европейскими и ближневосточными ветвями того же субклада, как минимум, на 12000 лет назад.

В этой весьма репрезентативной выборке (см. выше) не были обнаружены гаплотипы А0, что ставит под сомнение популярное утверждение, что бушмены - потомки самых ранних людей. Их необычайно большая вариативность - следствие наложения нескольких далеко разошедшихся линий, производных от альфа-гаплогруппы, а вовсе не знак того, что эта этническая группа какая-то особенно древняя.

Где и когда они перемешались, дав в итоге современную популяцию койсанских народов, мы не знаем. Если исходить из того, что гаплоруппы A1b1 и E1b1b1 весьма характерны для юга Аравийского п-ва и Африканского Рога, то по имеющимся данным можно предположить, что предки бушменов сформировались где-то в этом районе между 15 и 12 тыс. лет назад, и лишь затем мигрировали на юг Африки. Встретили ли они там других людей и смешались с ними, или те уже вымерли к тому времени, мы не знаем. Бесспорно лишь, что за этой миграцией последовал долгий период изоляции (вплоть до появления скотоводов банту в начале нашей эры), в течение которого "вымылись" другие генеалогические линии. В свою очередь, сохранились те, что оказались минорными во времена неолитической революции на Ближнем Востоке, и исчезли там.

Так что имеющиеся данные по Y хромосоме койсанских народов не дают никакй дополнительной поддержки гипотезе Out-of-Africa. Все логично объясняется без привлечения ее постулатов.
Люда
Перри пока никуда не определили, но ведь 28(по моим подсчетам) из его снипов должны перейти в А1.
bugler
Цитата(aklyosov @ 8.7.2012, 3:11) *
Цитата(Люда @ 7.7.2012, 15:27) *
Да, отличий практически никаких. Я увидела из основных - Р305 и L986 переместились в А1.


....
Еще интересно то, что неандертальны не были чернокожими, как и неафриканцы (альфа-гаплогруппа). То есть при расхождении предков неандертальцев и хомо сапиенс обе линии были нечернокожими, и обе были не в Африке.

А вот А0 были, видимо, чернокожими. То есть это какая-то параллельная линия, которая идет даже древнее неандертальцев.

Еще занятно то, что бушмены (гаплогруппа В, как я понимаю), тоже нечернокожие.


Я думаю, что и А0 не были чернокожими (или точнее негроидами). Это всё пре-палеантропы. Или гейдельбергский человек в своих проявлениях. Неандерталец это специализированная форма гейдельбергца, а A0 - африканская форма, жившая в наиболее благоприятных условиях ( возле тропиков). Альфа-гаплогруппа, скорее всего, с Ближнего Востока, где условия были более жёсткие. Отсюда и шёл исход в Африку, Европу и Азию. Расообразование началось где-то 40 тыс.лет назад.
aklyosov
Цитата(bugler @ 8.7.2012, 9:15) *
Расообразование началось где-то 40 тыс.лет назад.


Так не получается, если следовать ряду положений антропологов. По их понятиям, лопатовидным резцам у монголоидов не менее миллиона лет. Если так, то расы были сотни тысяч лет, но передача их носителям мужских гаплогрупп видна как только недавняя. Думаю, это фокусы бутылочных горлышек. Более того, в передаче расовых признаков участвовали женщины, которые на нашем дереве не отражены.
Odin
Ладони всех людей светлые, у Неандертальцев головная коробка была больше чем у Сапиенса-Сапиенса, возможно Неандертальцы потеснили Сапиенса-Сапиенса в Африку.
bugler
Цитата(aklyosov @ 8.7.2012, 18:45) *
Цитата(bugler @ 8.7.2012, 9:15) *
Расообразование началось где-то 40 тыс.лет назад.


... По их понятиям, лопатовидным резцам у монголоидов не менее миллиона лет. Если так, то расы были сотни тысяч лет, но передача их носителям мужских гаплогрупп видна как только недавняя. Думаю, это фокусы бутылочных горлышек. Более того, в передаче расовых признаков участвовали женщины, которые на нашем дереве не отражены.


Да! Так получается, когда антропологи оценивают одни признаки и замалчивают о других.Если оценка ведётся комплексно, отталкиваясь от современных значений (минимум- максимум, исключая паталогию), то негроиды в Африке появились не ранее 40 тыс.лет. А монголоиды в Центральной Азии и того меньше (время зависит от заселения Америки, т.к. там переходная форма монголоидов). Причём в Австралии признаки более европеоидные, чем в других местах.
Таким образом оценка опять зависит от масштаба измерений.
А женщины, безусловно, внесли свой вклад. Стоит вспомнить таримские мумии.
bugler
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 19:19) *
Ладони всех людей светлые, у Неандертальцев головная коробка была больше чем у Сапиенса-Сапиенса, возможно Неандертальцы потеснили Сапиенса-Сапиенса в Африку.

Да нет! Неандертальцы "классические" это специализированная форма. Такие формы образуются при значительной изоляции популяции. Умеренный климат и специализация охотника на крупную дичь увела их в сторону. Сейчас спорят об их видовой обособленности, но твёрдых доказательств нет. Возможно отдельные популяции и отделились от вида Homo, но не все. Они могли участвовать в антропогенезе в районе Передней Азии, чему есть некоторые предпосылки. Безусловно то, что мозги у них работали по другому, так как орудия мустье связываются с ними однозначно.
А неандертальцы "атипичные" это гейдельбергский человек в своём многообразии. Ашельская индустрия.
Stanislaw
Цитата
Топология одна и та же, при этом дерево STR дает более аккуратные датировки.
1) Датировки были бы более аккуратные, если бы была возможность считания всех мутаций СТР. Hа дороге симуляции выступил и такой случай, что из пяти мутаций между двумя гаплoтыпами выявилась только одна, так как все оставшееся четыре были идеально палялельнэ.
2) Программный ”1000 геномов” в сфере 24 миллионов пар принципов выявили в каждом образце в среднем 18,700 SNP. это над 2 SNP на поколение. А счет SNP не представляет собой такой проблемы как мутации STR. SNP кроме того однозначно показывает первого предка.

Цитата
1. Кто конкретно имел именно гаплогруппу А1, имя?
2. Кто конкретно имел гаплогруппу А1b, имя?
3. Если таких не было, на каком основании разделены А1 и А1b?

На что нужное вам имя, если Kahn и WTY их не публикуют?
1) Снипы гаплoгрупы A1 мы имеем все: почти все aфыканьцы и все гаплoгрупы неафрыканьские.
Мы своe им знаем...
21 SNP в гаплoгрупе А1 общее (bottleneck?), прежде чем возникло разветвление (coalescentia) популяции.
2) Гаплогруппу А1b конкретно имели: Stanisław, Anatolij, Ludmiła, Igor..., все неафрыканьцы и много aфрыканьцeв из гаплoгруп A1b1a, A1b1b и их подгрупп. Имя aфрыканьцeв находятся между прочим в стороне Hg. A Project FTDNA.
http://www.familytreedna.com/public/Haplog...ection=yresults
3) Снипы тестированые напр. в пределах WTY частично как будто снипами рода, а частично соединяются (coalescentia) в большие группы, обозначающие более далекиx и наиболее далекиx предков. Такими снипами групп предков: 22 SNP BT, 2 SNP А1b и 21 SNP А1.
Все над А1 снова соединяются с снипами над А0 и создают... Адама.

Цитата
Почему М91 в ВТ, а не в левой ветви?

На эту тему была большая дискуссия на форум Родство.
Игорь хорошо знается с делом.

Цитата
P.S. Присмотрелась, внутри А0 перетасовались группы. Почему-то L1005 cтал снипом А1, хотя у шимп. и чел.последовательности в базе данных в этой позиции одинаковый нуклеотид - А.
Так, это может быть ошибка Крагна.
В index ISOGG SNP 1005: G -> A.

Odin
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.
Odin
У Perry L74-?

Если да то где можно посмотреть на его гаплотип?
bugler
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 21:25) *
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.


Когда пишут о % "денисовского" генома, то это mtДНК. Какая кореляция с Y-ДНК - неизвестно.
Если не найдут L74, то "наша песня хороша, начинай сначала..." laugh.gif .
Уверен, найдут, так как это противоречит парадигме ДНК-генеалогии. Как и то, что человек современной анатомии не вышел из Африки, а пришёл туда примерно 40000 лет назад. Или чуть ранее. И это была гаплогруппа В.
bugler
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 21:35) *
У Perry L74-?

Если да то где можно посмотреть на его гаплотип?


Это, кажется, KIT N64496 ( ссылка выше). И это архаичный гаплотип. Такой же KIT 215865. В 22-маркерном формате:
13 11 12 – 10 11 – 16- 10 9 14 14 8 8 8 9 12 11 12 8 12 12 11 11

Например от базового гаплотипа гаплогруппы Т он отличается на 32 мутации. Примерно 300 тыс.лет до общего предка.
Odin
Цитата(bugler @ 8.7.2012, 20:50) *
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 21:25) *
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.


Когда пишут о % "денисовского" генома, то это mtДНК. Какая кореляция с Y-ДНК - неизвестно.
Если не найдут L74, то "наша песня хороша, начинай сначала..." laugh.gif .
Уверен, найдут, так как это противоречит парадигме ДНК-генеалогии. Как и то, что человек современной анатомии не вышел из Африки, а пришёл туда примерно 40000 лет назад. Или чуть ранее. И это была гаплогруппа В.

До 6% Ядерной, не Митогруппу, но раз 6% Ядерной тогда возможно найдут и новую Митогруппу и Y*
Odin
По проэкту А получается что P97 у всех людей но не очень стабильная(один Араб потерял эту мутацию)
bugler
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 22:09) *
Цитата(bugler @ 8.7.2012, 20:50) *
Цитата(Odin @ 8.7.2012, 21:25) *
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.


Когда пишут о % "денисовского" генома, то это mtДНК. Какая кореляция с Y-ДНК - неизвестно.
Если не найдут L74, то "наша песня хороша, начинай сначала..." laugh.gif .
Уверен, найдут, так как это противоречит парадигме ДНК-генеалогии. Как и то, что человек современной анатомии не вышел из Африки, а пришёл туда примерно 40000 лет назад. Или чуть ранее. И это была гаплогруппа В.

До 6% Ядерной, не Митогруппу, но раз 6% Ядерной тогда возможно найдут и новую Митогруппу и Y*


Про ядерную не слышал. unsure.gif Может есть ссылка?
Odin
Subsequent study of the nuclear genome from this specimen suggests this group shares a common origin with Neanderthals, they ranged from Siberia to Southeast Asia, and they lived among and interbred with the ancestors of some present-day modern humans, with up to 6% of the DNA of Melanesians and Australian Aborigines deriving from Denisovans.[4][5]

4.^ Carl Zimmer (22 December 2010). "Denisovans Were Neanderthals' Cousins, DNA Analysis Reveals". NYTimes.com. Retrieved 22 December 2010.
5.^ a b Callaway, Ewen (September 22, 2011), First Aboriginal genome sequenced, Nature News, DOI:10.1038/news.2011.551
Odin
Здесь написанно что P97+ (= xBT), я что-то не понял что P97- (= BT)?

http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/r...2-02/1330242936
Stanislaw
Цитата(Odin)
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.

L74+ во все гаплoгрупах, на стороне А0 и А1
Y человекa дэнисовскoo нет Y_DNA. это девочка примерно 10-рочна


Odin
Цитата(Stanislaw @ 8.7.2012, 21:58) *
Цитата(Odin)
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.

L74+ во все гаплoгрупах, на стороне А0 и А1
Y человекa дэнисовскoo нет Y_DNA. это девочка примерно 10-рочна

Нет там другое написанно что у Меланезийцев до 6% ядерного генома общего с Денисовской девушкой, я об этом.
Stanislaw
Цитата(Люда @ 7.7.2012, 23:27) *
Бедный Перри, он так и остался один.

Продолжается еще эмбарго на результаты теста WTY Перри and consortes!
aklyosov
Цитата(Stanislaw @ 8.7.2012, 12:11) *
Цитата
1. Кто конкретно имел именно гаплогруппу А1, имя?
2. Кто конкретно имел гаплогруппу А1b, имя?
3. Если таких не было, на каком основании разделены А1 и А1b?

На что нужное вам имя, если Kahn и WTY их не публикуют?
1) Снипы гаплoгрупы A1 мы имеем все: почти все aфыканьцы и все гаплoгрупы неафрыканьские.
Мы своe им знаем...
21 SNP в гаплoгрупе А1 общее (bottleneck?), прежде чем возникло разветвление (coalescentia) популяции.
2) Гаплогруппу А1b конкретно имели: Stanisław, Anatolij, Ludmiła, Igor...,


Вы или не поняли вопрос, или уклонились от ответа. Суть вопроса понятна из п. 3, на который Вы не ответили. Поэтому - уклонились от ответа.

Хорошо, перефразирую. Мне не нужно имя, мне нужно знать, нашли ли у кого гаплогруппу А1 без снипов Р108 и V221. Иначе говоря, гаплогруппу А1*. Но поскольку Вы обычно уклоняетесь от прямых ответов, то я запросил имя тестированного. Но Вы опять уклонились.

То же самое про А1b*. Есть ли кто-то, у которого есть А1 и/или Р108, но нет снипов ВТ? Только не надо уклоняться, если не знаете, то так и скажите - не знаю.

Уклонились Вы и от последнего вопроса, про М91. Напишите, пожалуйста, эту нуклеотидную последовательность с предковыми нуклеотидами (пусть будет у шимпанзе), ее же в ВТ. Увидите, что она одинакова. Вопрос - на каком тогда основании М91 поместили в ВТ? Это - не снип ВТ.

Если хотите понять вопрос лучше - напишите эту же последовательность нуклеотидов в "африканских" гаплогруппах.

И не надо говорить, что это уже обсуждали. Не знаете - так и скажите.

Боромир
Цитата(aklyosov @ 7.7.2012, 10:12) *
Цитата(Stanislaw @ 7.7.2012, 6:47) *
Обновленное генеалогическое дерево гагаплoгрупы A и современного человека.


Нормальное дерево, мы с ним давно работаем. Только это дерево не "гаплогруппы А и современного человека", там все мутации получены от современных людей. И там не "гаплогруппа А", а серия гаплогрупп. Остальное все верно:-))

Но есть вопросы:

1. Кто конкретно имел именно гаплогруппу А1, имя?

2. Кто конкретно имел гаплогруппу А1b, имя?

3. Если таких не было, на каком основании разделены А1 и А1b?

...

Первоначально А1 был разделен на А1а и А1b 24 июня 2011 года (см. сервер ФТДНА). Согласно зяблику2 в это время никакиe носители гаплогруппы А анализ WTY не проходили. Значит разделение на А1а и А1b провели на основании анализа ДНК обычных покупателей сервиса ФТДНА. Ключ к кладу А1а - это наличие снипа М31 или отсутствие снипa Р108. Поиск на проекте гаплогруппы А дает 3 положительных на М31 гаплотипа. Это #52093 (37 маркеров), #180250 (111 маркеров) и #16415 (67 маркеров). Все остальные, с понятным исключением клада А0 и Перри - это А1b.

Не уверен, что ответил впопад, поэтому заранее извиняюсь.

На дереве, приведенном паном Станиславом интересен снип L74, который объединяет всё человечество, включая клады А0 и А1. У меня и у пана Станислава (мы оба участники WTY программы) аллель L74 – тимин (Т), т.е. у всех человеков, начиная с "Адама" в локусе L74 тимин (информацию по L74 можно найти на ФТДНА сервере, хотя на драфте Крана он пока отсутствует, как впрочем и "Адам"). У шимпанзе и других приматов аллель L74 - цитозин (С). Получается, что Кран вполне официально укореняет дерево на шимпанзе.

Возникает вопрос почему именно L74 Кран выбрал в качестве снипа определяющего современного человека (Адама в их понятиях ). Видимо это дело случая. Поскольку в среднем геномы человека и шимпанзе сходны на 99%, то, логично предположить, что после сравнения участков Y-хромосомы шимпа и человека, проходящих через WTY–проект (400 000) можно наковырять в первом приближении до 4000 различных снипов отличающих Homo sapiens от шимпа. Собственно репертуар L-снипов уже перевалил за тысячу. Но оставшиеся три тысячи еще ждут своих исследователей.

До сих пор результаты WTY-теста Перри не опубликованы на зяблике2. Как впрочем и результаты еще пяти протестированных "африканцев".

Пан Станислав, кстати, Вы где-то утверждали, что когда-то летом все снипы "африканцев", изъятых с Finch2 должны уже быть опубликованы. Я не ошибаюсь?
aklyosov
Цитата(Боромир @ 8.7.2012, 15:17) *
Первоначально А1 был разделен на А1а и А1b 24 июня 2011 года. Согласно зяблику2 в это время никакиe носители гаплогруппы А анализ WTY не проходили. Значит разделение на А1а и А1b провели на основании анализа ДНК обычных покупателей сервиса ФТДНА.


Не обязательно. Эти "покупатели" неизвестны, и в проекте "Гаплогруппа А" их тоже нет.

Не исключено, что разделение проведено с потолка, и гаплогруппа А1b вообще мифическая. Это - гаплогруппа А1, она же альфа-гаплогруппа.

Дальше Вы поясняете по снип М31, но про него вопроса вообще не было. С гаплогруппой A1a-М31 вопросов нет.

Вопрос в том, на каком основании Р108 и V221 вынесли в отдельную гаплогруппу (A1b), следов которой нет ни в одном проекте, и нет в WTY. Я потому про имена и спросил.

Igor1961
Цитата(Stanislaw @ 9.7.2012, 3:58) *
Цитата(Odin)
Если я правильно понял, А или АТ = L74, то-есть у всех L74+
А вот интересно вдруг у Меланезийцев найдут немного Y* L74-, раз у них есть до 6% "Денисовского" генома.

L74+ во все гаплoгрупах, на стороне А0 и А1
Y человекa дэнисовскoo нет Y_DNA. это девочка примерно 10-рочна

А что, мужчин у них не было? Одни девочки? smile.gif

Лично я не вижу ничего фантастического, что когда-нибудь выскочит Y-хромосомная линия, идущая от тех людей. Меланезийский Перри, так сказать.
Igor1961
Цитата(aklyosov @ 9.7.2012, 5:29) *
Не исключено, что разделение проведено с потолка, и гаплогруппа А1b вообще мифическая. Это - гаплогруппа А1, она же альфа-гаплогруппа.

Дальше Вы поясняете по снип М31, но про него вопроса вообще не было. С гаплогруппой A1a-М31 вопросов нет.

Вопрос в том, на каком основании Р108 и V221 вынесли в отдельную гаплогруппу (A1b), следов которой нет ни в одном проекте, и нет в WTY. Я потому про имена и спросил.

Вот данные с гаплогруппного проекта. Поскольку системные администраторы FTDNA явно не поспевают за работой своего собственного сотрудника (Томаса Крана), плюсы и минусы на страничке снипов безнадежно перепутаны. Потому даю оригинальные нуклеотиды.

P108 = C (шимпанзе - С)
N71150 Boon A0
N38376 Jones A0
N14468 Dorsey A0
25210 Morten A0 (predicted)
180250 Phillips A1a (М31+)
16415 Wright A1a (М31+)
Р108 = Т
181787 Gage A1b1a (V50+)
200747 Saudi Arabia A1b1b2b (M13+)
176787 Panossian A1b1b2b (M13+)
151201 Boyd A1b1b2b (M13+)
121019 Boyd A1b1b2b (M13+)

Статистика по http://ytree.ftdna.com/
count_derived: 297
count_tested: 307
То есть, помимо тех шестерых участников проекта, еще у четырех человек нашли предковый нуклеотид С.

V221= G (шимпанзе - G)
N64496 Perry A0
N38376 Jones A0
180250 Phillips A1a (M31+)
V221 = T
181787 Gage A1b1a (V50+)

Статистика по http://ytree.ftdna.com/
count_derived: 107
count_tested: 114
Имена еще четверых, как и в случае Р108, неизвестны.

По этим данным видно, что снипы Р108 и V221 находятся на своем месте, разделяя А1а и A1b.

Если в базах данных есть "чистые" А1*(хА1а,хA1b), то они могут оказаться в этой четверке неизвестных. Впрочем, вероятность весьма мала.
aklyosov
Цитата(Igor1961 @ 8.7.2012, 20:36) *
По этим данным видно, что снипы Р108 и V221 находятся на своем месте, разделяя А1а и A1b.


Я этого не вижу.

Мой вопрос был не о разделении А1а и A1b, а о наличии A1b вообще. Я не вижу ни одного человека с гаплогруппой A1b*. Поэтому за разделение А1а с якобы A1b можно легко принять разделение A1a и А1.

Давайте из Вашего списка уберем избыточную информацию, кто там чего путает, уберем А0 и уберем А1а, с которой вообще вопросов нет. Ее имеют много людей, и сомнений там нет.

Итак:

Цитата(Igor1961 @ 8.7.2012, 20:36) *
Цитата(aklyosov @ 9.7.2012, 5:29) *
Не исключено, что разделение проведено с потолка, и гаплогруппа А1b вообще мифическая. Это - гаплогруппа А1, она же альфа-гаплогруппа.

Дальше Вы поясняете по снип М31, но про него вопроса вообще не было. С гаплогруппой A1a-М31 вопросов нет.

Вопрос в том, на каком основании Р108 и V221 вынесли в отдельную гаплогруппу (A1b), следов которой нет ни в одном проекте, и нет в WTY. Я потому про имена и спросил.


P108 = C (шимпанзе - С)
Р108 = Т
То есть, помимо тех шестерых участников проекта, еще у четырех человек нашли предковый нуклеотид С.

V221= G (шимпанзе - G)
V221 = T

Имена еще четверых, как и в случае Р108, неизвестны.

По этим данным видно, что снипы Р108 и V221 находятся на своем месте, разделяя А1а и A1b.


Итак, когда из списка убрали А0, А1а и субклады А1b, то никого не осталось. Нет никого со снипами Р108 и V221, не считая подчиненных субкладов, которые могут в той же степени оказаться подчиненными А1, в который входят P108 и V221.

В этом и был мой вопрос - зачем отделять Р108 и V221 от гаплогруппы А1? Они замечательно смотрятся всем блоком в гаплогруппе А1. И тогда снипы Р108 и V221 (как и многие другие) разделяют А1 и А1а. Чем плохо? Зачем нужна A1b, тем более, что таких людей, похоже, нет. Похоже, что это - фантомная гаплогруппа-субклад.

Igor1961
Цитата(aklyosov @ 9.7.2012, 11:17) *
Мой вопрос был не о разделении А1а и A1b, а о наличии A1b вообще. Я не вижу ни одного человека с гаплогруппой A1b*. Поэтому за разделение А1а с якобы A1b можно легко принять разделение A1a и А1.
...Похоже, что это - фантомная гаплогруппа-субклад.

А как в таком случае отобразить в нотации, что Р108=Т и V221=T у A-V50, А-М13 и всех гаплогрупп, производных от ВТ? То есть, узел, из которого они расходятся, находится чуть "ниже по течению", чем развилка А1 - А1а. Я пока не могу представить других вариантов, что сочетались бы с предковыми Р108=С и V221=G у носителей А-М31. Потому и вводятся индексы "а" и "b", чтобы отобразить такую топологию.

То, что нет ни одного человека с гаплогруппой A1b*, еще ни о чем не говорит. В коммерческих базах данных нет ни одного подтвержденного носителя IJ*, I*, J*, Q*, Q1*, Q1a*, R1b*, что отнюдь не делает эти гаплогруппы фантомными. В данном случае под буквенными обозначениями закодированы определенные комбинации снипов, что возможны по текущему состоянию дел в SNP-филогении, не более того.
Боромир
Анатолий Алексеевич, мой пост в некотором смысле повторяет пост ИР, но может поможет.
Цитата(aklyosov @ 8.7.2012, 16:29) *
Вопрос в том, на каком основании Р108 и V221 вынесли в отдельную гаплогруппу (A1b), следов которой нет ни в одном проекте, и нет в WTY. Я потому про имена и спросил.

Я ведь специально привел ссылку в своём предыдущем сообщении на, видимо, первоначальное время разделения кладов A1a и A1b. Повторю ещё раз: (см. сервер ФТДНА). По ссылке видно, что со снипом P108 происходили кульбиты, которые в виде, теперь уж некорректно обозначеных снипов P108, остались на некоторых проектах и сбивают с толку. Такая же ситуация, кстати, видимо, была и со снипом SRY10831.2. Где-то видел гаплотип, который одновременно был обозначен SRY10831.2- и SRY10831.2+. ohmy.gifsad.gif

Теперь к конкретным именам с требуемыми снипами клада A1b. Начнём с меня. В декабре прошлого года, во время очередного кульбита мои снип Р108 и индель М91, которые первоначально были определены как отрицательные, были переименованы в положительные (понятно, что значения аллелей не поменялись). Снип V221 у меня не определялся (V-серия Круциани не была известна, когда я проходил WTY-тест), зато начиная с Леслы, показано, что все R1a1, прошедшие WTY несут положительный V221, как и V168 (определяет принадлежность к А1).

WTY тест показал у меня отрицательный М31 (отрицателен у всех R1a1 участников проекта), что исключает принадлежность к кладу А1а. В предыдущем моём сообщении приведены 3 участника с положительным М31, причем у двоих из них М31+,Р108+. Это, надо полагать, последствие неисправленного кульбита с Р108. В противном случае придется нехорошо подумать о Томасе Кране, но к нему претензий до сих пор не было, а вот неоткорректированные после кульбитов маркеры, как было показано, встречаются. Кого в этом обвинять - вопрос не относящийся к дискуссии.

У А-М31 #180250 с проекта гаплогруппы А положителен V168, что помещает его в один с нами клад более высокого порядка - это клад А1. Так, что все верно: А1 расщепляется на А1а и A1b и мы в кладе A1b.
Odin
Уважаемый А.Клёсов,
Может вот это?

181787 Nazareth Gage (1848-1912)
M42- (= xBT), SRY10831.1- (= xBT), V221+(=A1b)
aklyosov
Цитата(Боромир @ 8.7.2012, 22:03) *
Цитата(aklyosov @ 8.7.2012, 16:29) *
Вопрос в том, на каком основании Р108 и V221 вынесли в отдельную гаплогруппу (A1b), следов которой нет ни в одном проекте, и нет в WTY. Я потому про имена и спросил.

...По ссылке видно, что со снипом P108 происходили кульбиты

...Теперь к конкретным именам с требуемыми снипами клада A1b. Начнём с меня. В декабре прошлого года, во время очередного кульбита мои снип Р108 и индель М91, которые первоначально были определены как отрицательные, были переименованы в положительные (понятно, что значения аллелей не поменялись). Снип V221 у меня не определялся...
...показано, что все R1a1, прошедшие WTY несут положительный V221, как и V168 (определяет принадлежность к А1).

WTY тест показал у меня отрицательный М31 (отрицателен у всех R1a1 участников проекта), что исключает принадлежность к кладу А1а...

В предыдущем моём сообщении приведены 3 участника с положительным М31, причем у двоих из них М31+,Р108+. Это, надо полагать, последствие неисправленного кульбита с Р108. В противном случае придется нехорошо подумать о Томасе Кране, но к нему претензий до сих пор не было...

...У А-М31 #180250 ... положителен V168, что помещает его в один с нами клад более высокого порядка - это клад А1.

Так, что все верно: А1 расщепляется на А1а и A1b и мы в кладе A1b.


Уважаемый Боромир,

Возможно, это "кульбиты" с переименованием в классификации причина того, что я никак не пойму, зачем нужен субклад А1b. Всё, что Вы привели, можно описать центральной гаплогруппой А1, от которой отходят А1а и ВТ.

Тогда вот это "...показано, что все R1a1, прошедшие WTY несут положительный V221, как и V168 (определяет принадлежность к А1)" можно уже не приводить, это уже очевидная и избыточная информация. A1b там нет.

То же самое и вот это: "Начнём с меня. В декабре прошлого года, во время очередного кульбита мои снип Р108 и индель М91, которые первоначально были определены как отрицательные, были переименованы в положительные (понятно, что значения аллелей не поменялись). Снип V221 у меня не определялся..." А1b и здесь нет.

И это избыточная и очевидная информация: "WTY тест показал у меня отрицательный М31 (отрицателен у всех R1a1 участников проекта), что исключает принадлежность к кладу А1а..." A1b здесь тоже нет.

И это: "...У А-М31 #180250 ... положителен V168, что помещает его в один с нами клад более высокого порядка - это клад А1". Это вообще к A1b не имеет отношения.

Поэтому последняя фраза "Так, что все верно: А1 расщепляется на А1а и A1b и мы в кладе A1b." вызывает недоумение. Все, что Вы описали выше, делает ее фразой: Так, что все верно: от А1 отщепляется А1а и мы в кладе A1.

Разве не так?
aklyosov
Что же касается - "...Начнём с меня. В декабре прошлого года, во время очередного кульбита мои снип Р108 и индель М91, которые первоначально были определены как отрицательные, были переименованы в положительные (понятно, что значения аллелей не поменялись)", то можно не обращать внимание на "кульбиты", и просто посмотреть на ту серию нуклеотидов, которые определяют М91 у Вас, и на исходную, предковую последовательность (например, в шимпанзе).

Попробуйте здесь написать в форме:

Шимпанзе......

Боромир ......

И сразу увидите, есть у Вас этот снип или нет. Чтобы он был, у шимпанзе должен быть один, у Вас - другой. Вы говорите, что по данным Крана у Вас этот снип есть, то есть у Вас якобы другое, чем у шимпанзе.

Ну как, написали?

Помочь?
Боромир
OK. На М91 Вы меня подловили: и у шимпанзе, и у Боромира в локусе инделя М91 аллель 9Т (insertion). Если укоренять по шимпанзе (а это явно следует из снипа L74 – общего для всех человеков согласно приведенному в первом сообщении этой темы дереву Станислова, согласованному с Краном), то М91 надо перекидывать в клад А0, у которого в локусе М91 аллель 8Т (deletion) (проверял по Jones - A0a2 и Dorsey - A0b, у которых там 8Т). С другой стороны, у турка А-М13 (#176787), который по Станиславу/Крану в нашем "A1b" кладе smile.gif в М91 тоже аллель 8Т. Чертовщина. Нужно больше информации, но она закрыта, а та что доступна запутана кульбитами и не понятно чему верить. Вот такой расклад на сегодня.

Получается что на принципиальный вопрос о A1b – to be or not to be - ответить не могу, надо ещё подумать. Загоревал sad.gif и ушел в огород думать.
Stanislaw
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 17:16) *
С другой стороны, у турка А-М13 (#176787), который по Станиславу/Крану в нашем "A1b" кладе smile.gif в М91 тоже аллель 8Т. Чертовщина. Нужно больше информации, но она закрыта, а та что доступна запутана кульбитами и не понятно чему верить. Вот такой расклад на сегодня.

У турка GRC10039758 #176787 нет тестирования снипа M91!
Боромир
Цитата(Stanislaw @ 9.7.2012, 10:38) *
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 17:16) *
С другой стороны, у турка А-М13 (#176787), который по Станиславу/Крану в нашем "A1b" кладе smile.gif в М91 тоже аллель 8Т. Чертовщина. Нужно больше информации, но она закрыта, а та что доступна запутана кульбитами и не понятно чему верить. Вот такой расклад на сегодня.

У турка GRC10039758 #176787 нет тестирования снипа M91!

Ага! А вот эту запись из списка маркеров гаплотипа #176787 куда позволите деть? (В экселевском файле запись идет в одну строку)

GRC10039758 M91 del- 1 thomas 2011-01-04 00:17:47 GRC10039758_WTY_J24_sL316_R|2865080,GRC10039758_365_B09_M91_R|2178392,GRC1003975
8_WTY_F19_sM91M120M121_R|2864456,GRC10039758_WTY_F19_sM91M120M121_F|2864643,GRC10
039758_WTY_J24_sL316_F|2865342,GRC10039

Значение аллеля выделено мною.

Пан Станислав, список маркеров #176787 Вы можете самостоятельно сгрузить с Finch2 и убедится, что ошибки нет.
Stanislaw
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 18:04) *
Цитата(Stanislaw @ 9.7.2012, 10:38) *
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 17:16) *
С другой стороны, у турка А-М13 (#176787), который по Станиславу/Крану в нашем "A1b" кладе smile.gif в М91 тоже аллель 8Т. Чертовщина. Нужно больше информации, но она закрыта, а та что доступна запутана кульбитами и не понятно чему верить. Вот такой расклад на сегодня.

У турка GRC10039758 #176787 нет тестирования снипа M91!

Ага! А вот эту запись из списка маркеров гаплотипа #176787 куда позволите деть? (В экселевском файле запись идет в одну строку)

GRC10039758 M91 del- 1 thomas 2011-01-04 00:17:47 GRC10039758_WTY_J24_sL316_R|2865080,GRC10039758_365_B09_M91_R|2178392,GRC1003975
8_WTY_F19_sM91M120M121_R|2864456,GRC10039758_WTY_F19_sM91M120M121_F|2864643,GRC1
0
039758_WTY_J24_sL316_F|2865342,GRC10039
Значение аллеля выделено мною.

Пан Станислав, список маркеров #176787 Вы можете самостоятельно сгрузить с Finch2 и убедится, что ошибки нет.

Так, вы прав!
М91, я не знаю почему, не расположен в порядке очереди букв и цифр, но только в конце, по "V" букве (среди дополнительных тестов?)



Igor1961
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 22:16) *
Чертовщина. Нужно больше информации, но она закрыта, а та что доступна запутана кульбитами и не понятно чему верить. Вот такой расклад на сегодня.

А Вы не ловитесь на кульбиты. Как хороший защитник, смотрите на мяч, а не на ноги всяких там Криштиану Роналду от ДНК-генеалогии. Под мячом имею в виду сам нуклеотид.

Напрмер, если на зяблике против фамилии Джонс стоит M91 del, а на проекте он же помечен как M91+, то, значит, те, кто записан М91-, имеют инсерцию, т. е. 9Т. При этом совершенно не должно волновать, что там думает Томас Кран (а думает он обычно по делу), Бонни Шрак или анонимный сисадмин, что расставляет по чьей-либо команде плюсы и минусы в графе снипов. Берете программу dnapars или dnapenny из пакета PHYLIP, вводите в нее последовательности нуклеотитов, и в течение 1-2 секунд получаете оптимизированную расстановку снипов. Зная положение корня из данных по шимпанзе, не составит большого труда самому вычислить, какой нуклеотид предковый, какой производный, а также выявить нестабильные снипы.

К слову, к таковым может относиться М91. На проекте М91- (=9Т) отмечен для саудовского араба M7223 и финского шведа 208466, 67-маркерные гаплотипы которых однозначно попадают в ветви A1b1b2 и А1а, соответственно. Их ближайшие соседи имеют ожидаемые М91+ (8Т).
Stanislaw
http://www.rodstvo.ru/forum/index.php?show...c=3158&st=0
Посмотрите над дерево.
Под "Rооt - Adam" я рядом L74 устроил второй снип Адама: М91=8Т.
Igor1961
Цитата(Stanislaw @ 10.7.2012, 1:57) *
Под "Rооt - Adam" я рядом L74 устроил второй снип Адама: М91=8Т.

Тогда уточните, что это М91.1 с предковым значением 9Т (шимпанзе) и производным 8Т (А0/А1).
Мутация, что у носителей ВТ переводит 8Т (А1) в совпадающий с шимпанзе фрагмент 9Т, по правилам, должна записываться как М91.2.

По определению, нуклеотиды в таких мутациях могут принмать только 2 значения, откуда другое название снипа - binary polymorphism. Если мы видим 3 или более варианта, то, значит, в этом локусе имели место 2 или более мутации, никак не связанные друг с другом. По правилам, их пишут с добавлением индекса после точки.
Igor1961
Цитата(aklyosov @ 9.7.2012, 18:23) *
Поэтому последняя фраза "Так, что все верно: А1 расщепляется на А1а и A1b и мы в кладе A1b." вызывает недоумение. Все, что Вы описали выше, делает ее фразой: Так, что все верно: от А1 отщепляется А1а и мы в кладе A1.

Разве не так?

Не так, потому что это противоречит алгоритму, по которому составляется нотация ISOGG и YCC. Если из гаплогруппы А1 отщепилась ветвь А1а, охарактеризованная хотя бы одним собственным снипом, то после развилки А1 без индекса может обозначать только т.н. парагруппу, т.е. гаплотипы, для которых не найдены снипы помимо тех, что характеризуют А1. Если нисходящие снипы имеются, то по определению к А1 добавляется буквенный индекс. В нашем случае такие снипы есть (Р108 и V221), а потому второй зуб вилки получает обозначение A1b.

Теоретически, из того же узла должна также выходить парагруппа А1*. Будут там "живые" гаплотипы или нет, зависит от конкретной ситуации. К примеру, еще 3 года назад вся гаплогруппа R1a1 состояла из парагруппы R1a1*, куда входили все известные гаплотипы, и 6-ти пустых субкладов R1a1a ... R1a1f, а сейчас мы днем с огнем ищем хотя бы один гаплотип, что не попадал бы ни в один из уже охарактеризованных субкладов, нисходящих от М417.

Впрочем, разделение на А1а и A1b никак не противоречит понятию альфа-гаплогруппы с параллельно расходящимися ветвями. Просто узел становится там не тугим, а немного "ослабленным" за счет перемычки из 2-х снипов. Все остальное работает.
Stanislaw
Цитата(Igor1961 @ 9.7.2012, 21:14) *
Цитата(Stanislaw @ 10.7.2012, 1:57) *
Под "Rооt - Adam" я рядом L74 устроил второй снип Адама: М91=8Т.

Тогда уточните, что это М91.1 с предковым значением 9Т (шимпанзе) и производным 8Т (А0/А1).
Мутация, что у носителей ВТ переводит 8Т (А1) в совпадающий с шимпанзе фрагмент 9Т, по правилам, должна записываться как М91.2.

Я написал коротко, какое состояние Адам имел и передал ветвям А0 и А1.
Добавлять обозначений .1 или .2 вызвало бы может быть удивение, откуда это походит.

Правду говоря, не известно, ли совершилась дэлецья у "Адама" ли инсэрцья у шимпанзе.

Odin
Цитата(Stanislaw @ 9.7.2012, 22:26) *
Правду говоря, не известно, ли совершилась дэлецья у "Адама" ли инсэрцья у шимпанзе.

Надо и Горилу проверить.
aklyosov
Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 8:16) *
и у шимпанзе, и у Боромира в локусе инделя М91 аллель 9Т (insertion)...
то М91 надо перекидывать в клад А0, у которого в локусе М91 аллель 8Т (deletion) (проверял по Jones - A0a2 и Dorsey - A0b, у которых там 8Т). С другой стороны, у турка А-М13 (#176787), который по Станиславу/Крану в нашем "A1b" кладе smile.gif в М91 тоже аллель 8Т. Чертовщина.


Никакой чертовщины нет, все довольно просто. Смотрите:

Шимпанзе (предковая) - 9Т
Боромир (ВТ-->R1a) - 9T
А-M13 - 8T

Это означает, что предковая аллель прошла без изменений от шимпанзе в А1 и далее в ВТ, и снипа М91 у неафриканцев нет. Зато он произошел при переходе от А1 к африканцам и прочим А1а (в данном случае у турка), у кого этот снип есть.

В свою очередь это означает, что не нужно было переносить М91, он был на месте. Далее это означает, что мы не произошли от африканцев, во всяком случае от тех, у кого есть этот снип. У нас его нет.

Так получается по этим и другим данным. Если есть данные новые, рассмотрим.

Цитата(Боромир @ 9.7.2012, 8:16) *
Получается что на принципиальный вопрос о A1b – to be or not to be - ответить не могу, надо ещё подумать.


Да, как видите, А1b и здесь пока нет, не просматривается.

Естественно, не просматривается - не значит, что ее нет. Это значит, что для данных примеров без нее можно обойтись. Естественно, можно вводить хоть гирлянды умозрительных снипов, весь вопрос в том, какие исторические положения на этом строятся. Я прекрасно понимаю, что введение A1b не нарушает концепцию альфа-гаплогруппы и расхождения генеалогии на фариканцев и неафриканцев, но система должна быть минимизирована по имебщимся данным.

Аналогия с I*, например, которого тоже не нашли, плохо работает. Это - скорее аналогия с введением I** и I***, которых тоже не нашли. Нужно ли их вводить?

Люда
aklyosov
Цитата
Это означает, что предковая аллель прошла без изменений от шимпанзе в А1 и далее в ВТ, и снипа М91 у неафриканцев нет. Зато он произошел при переходе от А1 к африканцам и прочим А1а (в данном случае у турка), у кого этот снип есть.

Если считать М91 снипом, то делеция 1Т должна была произойти у общего предка человека, потому что и у А0, и у А1а и A1b1a - 8T (в противном случае, у каждой из ветвей эта мутация должна была произойти независимо друг от друга). После разделения на А1b1 и ВТ, у ВТ должна была пройти возвратная мутация.
Возможно, вообще этот маркер нестабилен.
Кроме того, когда мы сравниваем с шимпанзе, все-таки это У хромосома одного самца. Для более точного определения предкового нуклеотида нужна статистика.

Stanislaw
Цитата
Под "Rооt - Adam" я рядом L74 устроил второй снип Адама

Обозначение неудачное. Правильно Вам Игорь написал:
Цитата
Мутация, что у носителей ВТ переводит 8Т (А1) в совпадающий с шимпанзе фрагмент 9Т, по правилам, должна записываться как М91.2. М91=8Т.


Odin
Цитата
Надо и Горилу проверить.

У гориллы 100 в фрагмент с этим снипом гомологию не нашел. Может быть надо взять больший фрагмент для поиска.
У макаки 7Т в гомологичном фрагменте на У-хромосоме.
У шимп. кстати рядом с 9Т лишняя G по сравнению с ВТ (наверно и с остальным человечеством?)
Stanislaw
Цитата(Люда @ 10.7.2012, 17:42) *
Stanislaw
Цитата
Под "Rооt - Adam" я рядом L74 устроил второй снип Адама

Обозначение неудачное. Правильно Вам Игорь написал:
Цитата
Мутация, что у носителей ВТ переводит 8Т (А1) в совпадающий с шимпанзе фрагмент 9Т, по правилам, должна записываться как М91.2. М91=8Т.

Я не имею власти создавать новые номера для снипов!
Знаком =8Т я констатирую действительное состояние, безотносительно чем прежнего.
Никто из нас не знает, ли 8Т суть родом из времен перед разойтением линии чeловека и шимапнсe и есть первоначальное состояние,
ли возник только по разойтению этих линий, вследствие дэлецйи 9Т->8Т.

Для просмотра полной версии этой страницы, пожалуйста, пройдите по ссылке.
Форум IP.Board © 2001-2019 IPS, Inc.