Помощь - Поиск - Пользователи - Календарь
Полная версия этой страницы: Может ли Гаплогруппа H не иметь подгруппы?
Rodstvo.ru > Mt-DNA и Х-хромосомы (женские линии) > Род H (Helena / Елена)
KTYF
Здравствуйте!

Мне в одной иностранной лаборатории ( не буду её пока называть) сделали тест mtDNA . Выдали следующий результат:

HVR1: 16519C

HVR2: 195C , 263G, 309.1C , 315.1C ,

HVR3: none


Но, ни подгруппу, ни HVR3 не указали. Отписались тем, что она полностью совпадает со стандартом этой гаплогруппы.

Помогите разобраться, пожалуйста, правильно ли мне выдали результат?



Valery
Часом не ancestry.com?

В принципе такое может быть, H содержит массу кластеров недавнего происхождения классификация которых затруднительна. Даже после полного исследования молекулы шансы остаться H* велики. Пожалуйста, спросите у них - что еще делалось, как доказали что это H. Делали ли тест кодирующей области (the coding region of the mtdna molecule)? Остается минорная вероятность что это HV* а не H.
ДАР ИСИДЫ
Цитата(KTYF @ 25.10.2008, 11:02) *




А откуда родом ваша женская линия, если не тайна? Вопрос объясняется тем, что у меня H*, имеющая четкий ареал распространения во Владимирской и Ивановской областях.
Valery
во Владимирской и Ивановской

ГВС какой?
Пастор
У меня ГВС 1 такой же, надо делать ГВС 2. smile.gif
Valery
Тогда напомните плиз smile.gif
ДАР ИСИДЫ
Вот весь геном:

H*
263G
309.1C
315.1C
750G
980C
1438G
3290C
4769G
8860G
11665T
13651G
15326G
16354T
16519C

Правда, это не мой, а моей родственницы.
Valery
Цитата(ДАР ИСИДЫ @ 6.1.2009, 1:46) *
Вот весь геном:

H*
263G
309.1C
315.1C
750G
980C
1438G
3290C
4769G
8860G
11665T
13651G
15326G
16354T
16519C

Правда, это не мой, а моей родственницы.




Это H* с четырьмя дополнительными мутациями 980C 3290C 11665T 13651G которые я впервые вижу вместе. Неужто у Пастора такой же ГВС? У него ж был 362-482 разве нет?
ДАР ИСИДЫ
Он вообще про другой ГВС1 говорил. Судя по всему, у него 16519C.
Пастор
Цитата(ДАР ИСИДЫ @ 6.1.2009, 12:52) *
Он вообще про другой ГВС1 говорил. Судя по всему, у него 16519C.


Да я о говорил 16519C
Valery
Пастор, так какой ГВС1-2 у Вас? Неужто у меня ложные воспоминания? smile.gif
Пастор
Цитата(Valery @ 6.1.2009, 17:05) *
Пастор, так какой ГВС1-2 у Вас? Неужто у меня ложные воспоминания? smile.gif


Валер, я вообще уже запутался, щас принтскрин с экрана сделаю и покажу.
Пастор
Kнязь Игорь
Так это же - референтная последовательность, а не Ваша, Пастор.

Если я правильно понял...
Пастор
Цитата(Kнязь Игорь @ 6.1.2009, 17:48) *
Так это же - референтная последовательность, а не Ваша, Пастор.

Если я правильно понял...


там в 16520 должна быть мутация
Kнязь Игорь
Цитата(Пастор @ 6.1.2009, 18:50) *
там в 16520 должна быть мутация


Так всё-таки ГВС-2 не делали, или нет отличий? Что 16519 Т-С понятно.
Пастор
Цитата(Kнязь Игорь @ 6.1.2009, 18:00) *
Так всё-таки ГВС-2 не делали, или нет отличий? Что 16519 Т-С понятно.


Я же говорил: "надо ГВС2 мне делать"
Пастор
Marie Antoinette - H

16519C

152C, 194T, 263G, 315.1C

у нас получается с Марией Антуанетой ГВС одинаковый.
ДАР ИСИДЫ
Это самая распространенная мутация в ГВС1. На самом деле, этот одинаковый ГВС1 мало что значит.
Valery
Да, ты пока H*. Но почему я думал что H6? Надеюсь у меня склероз а не ложные воспоминания smile.gif
Пастор
Цитата(Valery @ 6.1.2009, 21:12) *
Да, ты пока H*. Но почему я думал что H6? Надеюсь у меня склероз а не ложные воспоминания smile.gif


Вот и я был очеееееееееень сильно удивлен твоей уверенности smile.gif

Sergey Lutak
Всем доброго дня!
Вчера вечером получил из FTDNA результаты исследования своей мито-ДНК.
Мне определили мито-гаплогруппу H без уточнения субклада.

Совпаденцы - Запдная Европа.

Вот мои результаты:
Haplogroup - H
HVR1 differences from CRS 16189C 16356C 16519C
HVR2 differences from CRS 263G 315,1C

Действительно ли моя мито-гаплогруппа просто H или всё же есть какая-то более конкретная подгруппа?
Помогите разобраться.
Alesh
У меня FT показал, Haplogroup - U4 16356C 16519C, жду HVR2. GenTree определил как H.
Может кто знает от чего такая путаница, или близость гапплогрупп mtDNA это норма?
Sergey Lutak
Alesh, я конечно не специалист по мито-гаплогруппам, но может всё же правы на GenTree?

Вот часть филогенетического древа mtDNA-гаплогруппы H касающаяся мито-гаплогруппы H1b из статьи Eva-Liis Loogväli et al. (2004) с обозначением несинонимичных (#) и синонимичных (") мутаций:



Обратите внимание, что мутация 16189C характерна для H1b и H1f, а мутация 16356C именно для H1bю
ДАР ИСИДЫ
Цитата(Sergey Lutak @ 25.7.2009, 10:16) *
Alesh, я конечно не специалист по мито-гаплогруппам, но может всё же правы на GenTree?

Вот часть филогенетического древа mtDNA-гаплогруппы H касающаяся мито-гаплогруппы H1b из статьи Eva-Liis Loogväli et al. (2004) с обозначением несинонимичных (#) и синонимичных (") мутаций:



Обратите внимание, что мутация 16189C характерна для H1b и H1f, а мутация 16356C именно для H1bю




Совершенно верно, уважаемый Сергей, Вы H1b. 16189C и 16356C встречаются вместе только у H1b. Кроме того, вот описание H1b (http://www.familytreedna.com/haplogroup-h-subclades.aspx): "H1b обнаруживается с наибольшей частотой в Восточной Европе и Северо-Центральной Европе. Она также обнаруживается в количестве 5% от всех ветвей гаплогруппы H у сибирских манси". Как я понимаю, это описание достаточно хорошо под Вас подпадает (в части Восточной Европы). Так что сомнений почти не остается.

А вот что касается уважаемого Alesh, то у Вас, очевидно, все же U4. Дело в том, что FTDNA помимо собственно тестирования заказанного участка mtDNA тестирует в обязательном порядке и SNP, определяющие основные гаплогруппы. А вот делает ли это GeneTree, я не знаю. Важно выяснить, GeneTree определил или предположил гаплогруппу. Лучше всего просто спросить их: Ваша гаплогруппа "predicted by HVR result" или "confirmed by SNP"?
Stanislaw

Гаплогруппа H иметь подгруппы
Что-то для уважаемого Владислава Рыжковa

Связь митоДНА с болезнями:
mtH5 и AD.
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%...al.pone.0012037

Slavar
Цитата(Stanislaw @ 30.9.2010, 22:03) *
Гаплогруппа H иметь подгруппы
Что-то для уважаемого Владислава Рыжковa

Связь митоДНА с болезнями:
mtH5 и AD.
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%...al.pone.0012037

Уважаемый Станислав, спасибо.
VLADF
Бобик поздравляю, ты дурак!, подумал про себя,
попытавшись самостоятельно разобраться в своих результатах
mtDNA,
вот обращаюсь за помощью,
к какой Маме мне идти?
Подскажите, Please.
На сайте Femely tree DNA,
показаны "совпаденцы" но насколько близко,
не разобраться.
Вот чего имею:
Haplogroup - H
• HVR1 differences from CRS
o 16209C
o 16519C
• HVR2 differences from CRS
o 263G
o 309.1C
o 309.2C
o 315.1C
kosmonomad
Проверьте по ссылке по мутациям к какому субкладу у Вас сводится.

http://www.phylotree.org/tree/subtree_R0.htm

У Вас не исследована область CR, желательно дозаказать FGS.
kosmonomad
В настоящее время расстояние на одну мутацию в области HVR1 & HVR2 оценивается в примерно 500 лет и области CR - 2000 лет, хотя это спорно.
VLADF
Цитата(kosmonomad @ 28.10.2010, 17:56) *
В настоящее время расстояние на одну мутацию в области HVR1 & HVR2 оценивается в примерно 500 лет и области CR - 2000 лет, хотя это спорно.


Подскажите, есть в моих (URAUP) матчах-

RVJWF H1 209C,519C 0 263G,309.1C,309.2C,315.1C 0

как понять дистанцию, в годах, веках.
kosmonomad
Цитата(VLADF @ 20.7.2011, 14:51) *
Подскажите, есть в моих (URAUP) матчах-

RVJWF H1 209C,519C 0 263G,309.1C,309.2C,315.1C 0

как понять дистанцию, в годах, веках.


Во-первых, у Вас не H1, а пока смахивает на H2a2a. Как я вижу FGS не делали, закажите, может поменяться. 209C, 519C, 263G, 309.2 смотрятся как определяющие мутации.

Во-вторых, mitosearch не учитывает область CR. Необходимо связываться письменно.

В-третьих, Ваши "сестрички" показаны по степени близости по растоянию от -2 до +2 мутаций. Что означает, 0 - в пределах 500 лет, 1 - от 500 до 1000 лет.
VLADF
Цитата(kosmonomad @ 20.7.2011, 15:40) *
Цитата(VLADF @ 20.7.2011, 14:51) *
Подскажите, есть в моих (URAUP) матчах-

RVJWF H1 209C,519C 0 263G,309.1C,309.2C,315.1C 0

как понять дистанцию, в годах, веках.


Во-первых, у Вас не H1, а пока смахивает на H2a2a. Как я вижу FGS не делали, закажите, может поменяться. 209C, 519C, 263G, 309.2 смотрятся как определяющие мутации.

Во-вторых, mitosearch не учитывает область CR. Необходимо связываться письменно.

В-третьих, Ваши "сестрички" показаны по степени близости по растоянию от -2 до +2 мутаций. Что означает, 0 - в пределах 500 лет, 1 - от 500 до 1000 лет.


Почему же FGS делал, все на FT DNA, вот в mitosearch, их не воткнуть, по известным причинам...
но готов получить инструкции как продвинуть изыскания в этом направлении.
Спасибо.
2. Я не писал, что я H1 rolleyes.gif, это финская дамочка Н1, а я ее совпаденец 0:0. smile.gif
Martell
Цитата(VLADF @ 21.7.2011, 0:27) *
Цитата(kosmonomad @ 20.7.2011, 15:40) *
Цитата(VLADF @ 20.7.2011, 14:51) *
Подскажите, есть в моих (URAUP) матчах-

RVJWF H1 209C,519C 0 263G,309.1C,309.2C,315.1C 0

как понять дистанцию, в годах, веках.


Во-первых, у Вас не H1, а пока смахивает на H2a2a. Как я вижу FGS не делали, закажите, может поменяться. 209C, 519C, 263G, 309.2 смотрятся как определяющие мутации.

Во-вторых, mitosearch не учитывает область CR. Необходимо связываться письменно.

В-третьих, Ваши "сестрички" показаны по степени близости по растоянию от -2 до +2 мутаций. Что означает, 0 - в пределах 500 лет, 1 - от 500 до 1000 лет.


Почему же FGS делал, все на FT DNA, вот в mitosearch, их не воткнуть, по известным причинам...
но готов получить инструкции как продвинуть изыскания в этом направлении.
Спасибо.
2. Я не писал, что я H1 rolleyes.gif, это финская дамочка Н1, а я ее совпаденец 0:0. smile.gif


Вот тянет, Вас Пан Влад на тую, на балто-финскую сторону... Ну просто безобразие!
Ну эт ишшо ничё, других нашинских по у-хромосоме на хазар потянуло (которую неделю отбиваюсь). И шо нам местным делать?
kosmonomad
Цитата(VLADF @ 20.7.2011, 22:27) *
Почему же FGS делал, все на FT DNA, вот в mitosearch, их не воткнуть, по известным причинам...
но готов получить инструкции как продвинуть изыскания в этом направлении.
Спасибо.
2. Я не писал, что я H1 rolleyes.gif, это финская дамочка Н1, а я ее совпаденец 0:0. smile.gif

Просто обычно про себя спрашивают. Мне в личку скиньте полные данные теста.
kosmonomad
Точно H2a2a, с дополнительными мутациями лично Вашей линии. Это конечно если они не поменяют номенклатуру, что тоже возможно при поступлении новых гаплотипов. Несколько раз в год phylotree вносят изменения.

Так это H2a2a и есть rCRS той англичанки у которой первой прочитали мтДНК! http://en.wikipedia.org/wiki/RCRS
VLADF
Цитата(kosmonomad @ 3.8.2011, 13:49) *
Точно H2a2a, с дополнительными мутациями лично Вашей линии. Это конечно если они не поменяют номенклатуру, что тоже возможно при поступлении новых гаплотипов. Несколько раз в год phylotree вносят изменения.

Так это H2a2a и есть rCRS той англичанки у которой первой прочитали мтДНК! http://en.wikipedia.org/wiki/RCRS


Спасибо большое, за определение...
Но как то я уж совсем в ступоре..., как выразился Martell,
куда то меня тянет....
Был H1, а стал... unsure.gif
kosmonomad
Я постоянно напоминаю о разнице в номенклатуре в фтдна и самыми новыми данными в филотри.

Ваша линия мтднк - родственная той первой протестированной англичанке. Если передадите свои данные в genbank через Ian Logan, то получите личный субклад относительно H2a2a.
VLADF
Цитата(kosmonomad @ 4.8.2011, 16:33) *
Я постоянно напоминаю о разнице в номенклатуре в фтдна и самыми новыми данными в филотри.

Ваша линия мтднк - родственная той первой протестированной англичанке. Если передадите свои данные в genbank через Ian Logan, то получите личный субклад относительно H2a2a.



Я так понимаю речь об этом-?
GenBank

183681-FASTA.sqn Федоров HQ908087
Только чего, к чему там как то тоже не совсем понятно...
там можно почерпнуть чего полезного, отправить письмо с запросом?
kosmonomad
Это те данные на которые фтдна запрашивали разрешение где-то зимой-весной? Тогда уже ничего делать не надо.
VLADF
Цитата(Martell @ 20.7.2011, 23:37) *
Цитата(VLADF @ 21.7.2011, 0:27) *
Цитата(kosmonomad @ 20.7.2011, 15:40) *
Цитата(VLADF @ 20.7.2011, 14:51) *
Подскажите, есть в моих (URAUP) матчах-

RVJWF H1 209C,519C 0 263G,309.1C,309.2C,315.1C 0

как понять дистанцию, в годах, веках.


Во-первых, у Вас не H1, а пока смахивает на H2a2a. Как я вижу FGS не делали, закажите, может поменяться. 209C, 519C, 263G, 309.2 смотрятся как определяющие мутации.

Во-вторых, mitosearch не учитывает область CR. Необходимо связываться письменно.

В-третьих, Ваши "сестрички" показаны по степени близости по растоянию от -2 до +2 мутаций. Что означает, 0 - в пределах 500 лет, 1 - от 500 до 1000 лет.


Почему же FGS делал, все на FT DNA, вот в mitosearch, их не воткнуть, по известным причинам...
но готов получить инструкции как продвинуть изыскания в этом направлении.
Спасибо.
2. Я не писал, что я H1 rolleyes.gif, это финская дамочка Н1, а я ее совпаденец 0:0. smile.gif


Вот тянет, Вас Пан Влад на тую, на балто-финскую сторону... Ну просто безобразие!
Ну эт ишшо ничё, других нашинских по у-хромосоме на хазар потянуло (которую неделю отбиваюсь). И шо нам местным делать?


Ну вот, Martell,
"накаркал" laugh.gif,
еще забавнее-
You match 1 person out of 102 people from Armenia, this is 1,0% of the population tested from Armenia.
Першее место, у меня теперь Армянская "кровь" нашлась...
Для просмотра полной версии этой страницы, пожалуйста, пройдите по ссылке.
Форум IP.Board © 2001-2019 IPS, Inc.