Помощь - Поиск - Пользователи - Календарь
Полная версия этой страницы: Научные публикации
Rodstvo.ru > ДНК-генеалогия и другие научные направления > Конференции и библиотека научных публикаций > Публикации по мтДНК
mouglley
Во как! В дополнение к аутосомным генам (CCR5), влияющим на выживание, есть и предрасположенность носителей определённых mtDNA-гаплогрупп к разным-всяким нехорошим заболеваниям.

Mitochondrial DNA haplogroups influence AIDS progression Hendrickson SL, Hutcheson HB, Ruiz-Pesini E, Poole JC, Lautenberger J, Sezgin E, Kingsley L, Goedert JJ, Vlahov D, Donfield S, Wallace DC, Oʼbrien SJ.

OBJECTIVE:: Mitochondrial function plays a role in both AIDS progression and HAART toxicity; therefore, we sought to determine whether mitochondrial DNA variation revealed novel AIDS restriction genes, particularly as mitochondrial DNA single-nucleotide polymorphisms are known to influence regulation of oxidative phosphorylation, reactive oxygen species production, and apoptosis. DESIGN:: This is a retrospective cohort study. METHODS:: We performed an association study of mitochondrial DNA haplogroups among 1833 European American HIV-1 patients from five US cohorts: the Multicenter AIDS Cohort Study, the San Francisco City Clinic Study, Hemophilia Growth and Development Study, the Multicenter Hemophilia Cohort Study, and the AIDS Linked to Intravenous Experiences cohort to determine whether the mitochondrial DNA haplogroup correlated with AIDS progression rate. RESULTS:: Mitochondrial DNA haplogroups J and U5a were elevated among HIV-1 infected people who display accelerated progression to AIDS and death. Haplogroups Uk, H3, and IWX appeared to be highly protective against AIDS progression. CONCLUSION:: The associations found in our study appear to support a functional explanation by which mitochondrial DNA variation among haplogroups, influencing ATP production, reactive oxygen species generation, and apoptosis, is correlated to AIDS disease progression; however, repeating these results in cohorts with different ethnic backgrounds would be informative. These data suggest that mitochondrial genes are important indicators of AIDS disease progression in HIV-1 infected persons.
Centurion
Н-да... J* и тут "засветилась" mellow.gif
mouglley
Цитата(Centurion @ 14.11.2008, 22:38) *
Н-да... J* и тут "засветилась" mellow.gif
Зато у Вы от лихорадки Западного Нила, точно, не помрёте. А у меня выжить практически нет вероятности.
Centurion
Цитата(mouglley @ 15.11.2008, 10:21) *
Зато у Вы от лихорадки Западного Нила, точно, не помрёте. А у меня выжить практически нет вероятности.

Это вы про del32?
mouglley
Цитата(Centurion @ 15.11.2008, 11:08) *
Это вы про del32?
Оба, пропустил. Да.

Mitochondrial Haplogroups Associated with Elite Kenyan Athlete Status Scott RA, Fuku N, Onywera VO, Boit M, Wilson RH, Tanaka M, H Goodwin W, Pitsiladis YP

Цитата
The maternal inheritance of mitochondrial DNA (mtDNA) has enabled construction of detailed phylogenies. Analysis of key polymorphisms from these phylogenies allows mtDNA to be assigned to haplogroups, which have been associated with elite endurance performance. PURPOSE:: To compare the frequencies of mtDNA haplogroups found in elite Kenyan athletes with those in the general Kenyan population. METHODS:: DNA samples were obtained from 221 national level Kenyan athletes (N), 70 international Kenyan athletes (I), and 85 members of the general Kenyan population ©. mtDNA haplogroups were classified by sequencing 340 bases of hypervariable section (HVS I) and by genotyping known restriction sites. Frequency differences between groups were assessed using exact tests of population differentiation. RESULTS:: The haplogroup distribution of national (P = 0.023) and international athletes (P < 0.001) differed significantly from controls, with international athletes showing a greater proportion of L0 haplogroups (C = 15%, N = 18%, I = 30%) and lower proportion of L3* haplogroups (C = 48%, N = 36%, I = 26%). Although a high number of international athletes originated from the Rift Valley province relative to controls (C = 20%, N = 65%, I = 81%), subjects from this province did not differ in haplogroup distribution from other regions (P = 0.23). Nor did Bantu subjects differ from Nilotic (P = 0.12) despite an overrepresentation of Nilotic languages among the athletes. CONCLUSIONS:: International athletes differed in their mtDNA haplogroup distribution relative to the general Kenyan population. They displayed an excess of L0 haplogroups and a dearth of L3* haplogroups. These findings suggest that mtDNA haplogroups are influential in elite Kenyan distance running, although population stratification cannot be ruled out.
А почему тогда и у нас бегуны неплохие? Непонятно. blink.gif

alfatvcom
Интересная статья для начинающих.
http://www.bionet.nsc.ru/vogis/pict_pdf/20...gis_10_1_03.pdf

Kнязь Игорь
Цитата(alfatvcom @ 5.1.2009, 22:04) *
Интересная статья для начинающих.
http://www.bionet.nsc.ru/vogis/pict_pdf/20...gis_10_1_03.pdf


Hужно спросить у Валерия, насколько эта статья может быть полезна новичкам для понимания географии и филогении митохондриальных групп.

Признаюсь честно, мне было в ней трудно разобраться. Может быть потому, что никогда прицельно этой темой не интересовался.
Valery
Беглый просмотр говорит что пока статья не устарела хотя написана давно.
татиа
А не был бы кто-нибудь так любезен прислать мне ее на мыло?
У меня комп вырубает Explorer при попытке скачивания.
Пастор
Страсти-то какие http://medportal.ru/mednovosti/news/2008/12/15/hiv/
Пастор
Sequences From First Settlers Reveal Rapid Evolution in Icelandic mtDNA Pool
Agnar Helgason, Carles Lalueza-Fox, Shyamali Ghosh, Sigrún Sigurðardóttir, Maria Lourdes Sampietro, Elena Gigli, Adam Baker, Jaume Bertranpetit, Lilja Árnadóttir, Unnur Þorsteinsdottir, Kári Stefánsson

Abstract

A major task in human genetics is to understand the nature of the evolutionary processes that have shaped the gene pools of contemporary populations. Ancient DNA studies have great potential to shed light on the evolution of populations because they provide the opportunity to sample from the same population at different points in time. Here, we show that a sample of mitochondrial DNA (mtDNA) control region sequences from 68 early medieval Icelandic skeletal remains is more closely related to sequences from contemporary inhabitants of Scotland, Ireland, and Scandinavia than to those from the modern Icelandic population. Due to a faster rate of genetic drift in the Icelandic mtDNA pool during the last 1,100 years, the sequences carried by the first settlers were better preserved in their ancestral gene pools than among their descendants in Iceland. These results demonstrate the inferential power gained in ancient DNA studies through the application of population genetics analyses to relatively large samples.
mouglley
Реккомендация: убирать все цифры и прочие значки в фамилиях авторов, а то трудно искать будет позже.
Павел Шварев
Цитата(Пастор @ 6.1.2009, 19:26) *
Страсти-то какие url="http://прямой конкурент родства.ru/пересказ чужой новости.html[/url]

Пастор, пожалуста давайте ссылки на первоисточник.
Вашу ссылку в этот раз я подправил.
Slavar
Из K. Tambets et al. Haploid and autosomal variation within a linguistic continuum of the Uralic-speaking people of Eurasia.
"In general, the genome-wide analyses corroborate the results of mtDNA analysis and do not reflect the common genetic characteristics between western and eastern Uralic-speakers at the level seen in case of N1c."
Slavar
Боюсь повториться, но тема важная для женщин:
Ren-Kui Bai et al. Mitochondrial Genetic Background Modifies Breast Cancer Risk, Cancer Res 2007; 67: (10). May 15, 2007, http://cancerres.aacrjournals.org/content/...0/4687.full.pdf
Относительный риск заболевания раком груди у европеек по мито-гаплогруппам (даю в примерном порядке старшинства гаплогрупп):
I - 1.71 - в неолите составляла до 20% у европеек, сейчас не более 2%

W - 1.19, X - 1.19

U - 0.38, K - 3.03, т.е. дочерняя от U8 митоК в 8 раз более рисковая, чем вся остальная U

J - 0.54, T - 1.19 - две сестры

HV- 0.78, V - 1.05, H -0.99

казак
В эпоху неолита Сибирь была плотно заселена, о чём можно судить по огромному количеству археологических памятников, в том числе и по появлению некрополей. Созданная к настоящему времени обширная база радиоуглеродных дат свидетельствует о том, что эпоха неолита для Южного региона Западной Сибири совпала с оптимальным по климатическим условиям во всей Северной Евразии отрезком атлантического периода голоцена 6000-5500 лет назад. Человек осваивал территории, либо сочетавшие за счет высотной поясности широкий набор ландшафтов с обязательным компонентом темнохвойных елово-кедрово-пихтовых лесов (межгорные котловины Алтая, долина среднего Енисея с прилегающими к ней низкогорьями Восточного Саяна, Присалаирье), либо районы на границе лесостепи и леса (отдельные районы Западно-Сибирской низменности в междуречье Оби и Иртыша). Именно эти регионы, судя по уровню концентрации археологических памятников, сочетали наиболее благоприятные экологические условия для жизнеобеспечения людей, за счет охоты, рыболовства и собирательства. Остепненные ландшафты, такие как в Минусинской котловине или в котловинах и на нагорьях Тувы, были менее привлекательны для коллективов человека в эпоху неолита. Энергетический потенциал лесостепных и степных биогеоценозов был раскрыт человеком с развитием скотоводства и земледелия.

Археологические материалы поселенческих комплексов и могильников носителей неолитических культур юга Западной Сибири свидетельствуют об их широких контактах с тремя этнокультурными областями: 1.Зауральем и северо-западными районами Восточной Европы, 2.Южным Приуральем и северными районами Средней Азии, 3. Прибайкальем. Эти линии связей подкрепляются для отдельных районов региона палеоантропологическими данными (Дремов, 1980, 1997; Зах, Багашев, 1998).

Для переходного времени от неолита к бронзовому веку в археологической литературе часто применяется термин «ранний металл», который использован и в данной работе. Период раннего металла, развивающийся по закономерностям новой эпохи - палеометалла - на юге Западной Сибири начался на рубеже IV-III тыс. до н.э. и закончился в начале II тыс. до н.э.

Характерной чертой эпохи палеометалла является формирование систем особого рода, представляющих собой тесно взаимосвязанные очаги металлургии и металлообработки, так называемых металлургических провинций, в которых и проявлялся с максимальной полнотой весь комплекс прогрессивных инноваций. Концепция металлургических провинций, как крупных технологических и историко-культурных систем древности, предложена Е.Н.Черныхом (Chernykh, 1971; Черных, 1976, 1978, , 1989, 2007, 2008). Это чрезвычайно важное в методологическом отношении открытие, позволяющее в понимании целого ряда аспектов генезиса и археологических культур и антропогеоценозов избежать абсолютизации климато-географического фактора.

2.2.2. Период раннего металла. В истории культур периода раннего металла южных районов Сибири большое внимание традиционно уделяется обоснованию их связей со степными курганными культурами – ямной и катакомбной. Но для этих культур было уже характерно широкое применение бронзы, тогда как в южносибирских комплексах встречаются только отдельные металлические изделия. Однако в среде племен афанасьевской культуры Горного Алтая уже отмечаются следы зарождения особой металлургической Саяно-Алтайской горной области в составе Евразийской металлургической провинции (ЕАМП). Её расцвет пришелся на II тыс. до н.э., и в дальнейшем она сыграла «выдающуюся роль в формировании металлопроизводства позднебронзовых сообществ «степного пояса» и восточно-евразийской модели металлургии в целом» (Черных, 2008, с.46).

В южном регионе Западной Сибири к культурам периода раннего металла, по которым имеется палеоантропологический материал, соответствующий задачам данной работы, относятся усть-тартасская и афанасьевская.

Динамика антропологической дифференциации населения юга Юга Западной Сибири в эпохи неолита - раннего железного века.
Чикишева Татьяна Алексеевна (09.03.2010)

http://dibase.ru/article/09032010_chikishevata/1



Амиго
По Мт-ДНК есть какие-нибудь новые исследования? Имеется ввиду продвинулись ли также успешно как и по Y-хромосоме в науке вопросе происхождения родства по материнской линии?
Для просмотра полной версии этой страницы, пожалуйста, пройдите по ссылке.
Форум IP.Board © 2001-2020 IPS, Inc.